丙型肝炎病毒（Hepatitis C Virus,HCV）具有相當高的變異性,HCV感染后多數(shù)可發(fā)展為慢性丙型肝炎,部分患者可進一步發(fā)展為肝硬化和肝癌。HCV基因型可以明顯影響α干擾素抗病毒治療的療效,其中1型與2型HCV感染相比應(yīng)答率較低。NS3蛋白是一種多功能蛋白,在病毒的生命周期中起重要作用,因而成為新型抗HCV藥物的最主要的靶點。NS3蛋白同時也是細胞毒T淋巴細胞（CTL）的識別靶位。目前我國北方地區(qū)缺少近期大樣本HCV基因分型資料,我國患者中HCV NS3區(qū)相關(guān)耐藥變異和CTL表位變異尚未見報道。本文在對767例北方地區(qū)基因型的分析和150例HCV NS3蛋白激酶編碼區(qū)序列分析,以了解我國北方地區(qū)HCV感染患者中近期HCV基因型流行狀況以及蛋白酶抑制劑的天然耐藥相關(guān)變異和CTL表位變異狀況。目的（1）對北方地區(qū)慢性HCV感染患者的基因型進行分析,以進一步了解我國北方地區(qū)近期HCV基因型流行特點。（2）建立擴增和檢測我國各種基因型HCV感染患者NS3蛋白激酶編碼區(qū)序列擴增分析的方法。（3）對NS3區(qū)進行序列分析,揭示我國北方地區(qū)HCV感染患者中與NS3蛋白酶抑制劑相關(guān)耐藥變異和... 

【文章來源】：中國人民解放軍軍事科學院北京市

【文章頁數(shù)】：48 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

HCV基因組結(jié)構(gòu)圖

表 5. 兩種方法 HCV 基因分型結(jié)果比較數(shù)（150）測序分型基因芯片法 Mega4 N因 1a 型因 1b 型因 2a 型因 3a 型因 3b 型因 6 型1 1 100 98 34 32 6 6 6 6 3 3 基因型均可擴出較為單一的 PCR 產(chǎn)物，但產(chǎn)物長度可應(yīng)基別（圖 8）。

圖 9. HCV NS3NS3 區(qū)分子進化分析 區(qū)序列分析耐藥相關(guān)突變位點結(jié)果各型 NS3 序列的 543 個氨基酸中分別有 253/543（1b/543（3a）、94/543（3b）和 69/543（6 型）個位點發(fā)代，另外一條序列中出現(xiàn)一處位點插入突變。所有樣elaprevir 耐藥相關(guān)的 V36M/A，T54A，R155K/T，A/對這些位點的分析中，檢出有 3 例（2%）的 1b 基因S 變異形式，另外在 1b 基因型樣本中檢出 V36G 和 V表 9），而 2a 基因型樣本在此位點上的表現(xiàn)形式均為

【參考文獻】：
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