幽門螺桿菌（Helicobacter20pylori,20H.20pylori）是目前發(fā)現(xiàn)唯一能夠在人胃內(nèi)定植、生存的微需氧革蘭氏陰性桿菌。是世界性分布的病原菌,也是目前人類發(fā)生率最高的慢性細(xì)菌感染之一,全世界范圍內(nèi)感染率超過50%。來自世界各地的流行病學(xué)研究證實(shí),H.20pylori感染是消化性潰瘍和慢性胃炎的重要病因,并與胃癌和胃黏膜相關(guān)淋巴樣組織（MALT）淋巴瘤的發(fā)病密切相關(guān),1994年世界衛(wèi)生組織已將其列為Ⅰ類致癌原。cag致病島編碼的Ⅳ型分泌系統(tǒng)是幽門螺桿菌的一個(gè)重要致病因素,通過此分泌系統(tǒng)cag致病島可將其唯一效應(yīng)分子CagA轉(zhuǎn)運(yùn)至宿主細(xì)胞并發(fā)揮其毒性作用。目前,cag致病島編碼基因的生物學(xué)功能及其參與H.20pylori致病的機(jī)制尚未明確,因此,本文以cag致病島中的cagM、cagI基因?yàn)檠芯繉?duì)象,通過分子生物學(xué)、微生物學(xué)及生物信息學(xué)等技術(shù)探討H.20pylori20cagM、cagl基因的結(jié)構(gòu)和功能,以指導(dǎo)以后的實(shí)驗(yàn)研究,為更深入研究cag致病島的致病機(jī)理奠定理論基礎(chǔ)。方法：1.根據(jù)GenBank中已報(bào)道的H.20pylori22695的全基因組序列,利用生物信息學(xué)... 

【文章來源】：江蘇大學(xué)江蘇省

【文章頁數(shù)】：102 頁

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 緒論
    1.1 研究背景
        1.1.1 幽門螺桿菌感染現(xiàn)狀
        1.1.2 幽門螺桿菌cag致病島
        1.1.3 幽門螺桿菌的致病因子
        1.1.4 幽門螺桿菌Ⅳ型分泌系統(tǒng)(type Ⅳ secretion system,T4SS)
        1.1.5 Ⅳ型分泌系統(tǒng)伴侶蛋白(Type Ⅳ secretion system chaperone)
    1.2 本研究的目的、內(nèi)容及技術(shù)路線
        1.2.1 研究目的
        1.2.2 研究內(nèi)容及方案
        1.2.3 技術(shù)路線
第二章 幽門螺桿菌cagM、cagI基因的克隆與測序
    前言
    2.1 材料
        2.1.1 菌株和質(zhì)粒
        2.1.2 主要試劑
        2.1.3 主要溶液配制
        2.1.4 主要儀器
    2.2 方法
        2.2.1 H.pylori培養(yǎng)與鑒定
        2.2.2 H.pylori基因組DNA的提取
        2.2.3 PCR引物的設(shè)計(jì)
        2.2.4 PCR擴(kuò)增H.pylori的cagM、cagI基因
        2.2.5 目的DNA片段的回收
        2.2.6 制備感受態(tài)細(xì)胞
        2.2.7 載體和目的片段的連接
        2.2.8 轉(zhuǎn)化與篩選
        2.2.9 重組質(zhì)粒的鑒定
        2.2.10 H.pylori NCTC11637 cagM、cagI基因序列的檢測
        2.2.11 H.pylori NCTC11637 cagM、cagI基因序列提交NCBI核酸數(shù)據(jù)庫GenBank
    2.3 結(jié)果
        2.3.1 H.pylori的分離培養(yǎng)與鑒定
        2.3.2 PCR法擴(kuò)增H.pylori cagM、cagI基因片段
        2.3.3 T-A克隆與鑒定
        2.3.4 H.pylori NCTC11637菌株cagM、cagI基因的測序結(jié)果
    2.4 討論
第三章 CagM、CagI蛋白的生物信息學(xué)分析
    前言
    3.1 材料
        3.1.1 主要軟件
        3.1.2 主要網(wǎng)站
    3.2 方法
        3.2.1 序列組成和基本性質(zhì)分析
        3.2.2 同源性分析
        3.2.3 跨膜區(qū)預(yù)測分析
        3.2.4 信號(hào)肽和剪切位點(diǎn)預(yù)測分析
        3.2.5 二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測分析
        3.2.6 三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測分析
        3.2.7 功能位點(diǎn)分析
        3.2.8 卷曲螺旋的預(yù)測分析
        3.2.9 細(xì)胞定位的預(yù)測分析
        3.2.10 蛋白家族保守區(qū)域分析
        3.2.11 蛋白質(zhì)指紋圖譜分析
    3.3 結(jié)果
        3.3.1 序列組成和基本性質(zhì)分析
        3.3.2 同源性分析
        3.3.3 跨膜區(qū)預(yù)測
        3.3.4 信號(hào)肽和剪切位點(diǎn)預(yù)測
        3.3.5 二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測分析
        3.3.6 三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測分析
        3.3.7 功能位點(diǎn)分析
        3.3.8 卷曲螺旋的預(yù)測分析
        3.3.9 細(xì)胞定位的預(yù)測分析
        3.3.10 蛋白家族保守區(qū)域分析
        3.3.11 蛋白指紋圖譜分析
    3.4 討論
        3.4.1 基本性質(zhì)
        3.4.2 同源性
        3.4.3 結(jié)構(gòu)預(yù)測
        3.4.4 功能分析
第四章 結(jié)論和展望
    4.1 結(jié)論
    4.2 展望
致謝
參考文獻(xiàn)
讀博期間發(fā)表的論文和參加的課題


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3179051