基于宏基因組學(xué)/培養(yǎng)組學(xué)的膽囊炎菌群致病機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2021-04-24 23:46
目的運(yùn)用宏基因組學(xué)及培養(yǎng)組學(xué)的方法對(duì)健康人糞便樣本和膽囊炎患者糞便及相應(yīng)的膽汁樣本進(jìn)行高通量全基因組測(cè)序和高通量分離培養(yǎng),對(duì)膽囊炎相關(guān)菌群進(jìn)行全面解析,探討膽囊炎菌群的致病機(jī)制。方法收集5例健康人糞便樣本和5例膽囊炎患者的膽汁及相應(yīng)糞便樣本,采用11種不同的培養(yǎng)基對(duì)培養(yǎng)組樣本進(jìn)行大規(guī)模分離培養(yǎng)并同時(shí)抽提細(xì)菌總DNA,對(duì)分離培養(yǎng)出的細(xì)菌使用MALDI-TOF飛行時(shí)間質(zhì)譜結(jié)合16S rRNA進(jìn)行細(xì)菌鑒定。采用鳥槍法宏基因組測(cè)序技術(shù)對(duì)測(cè)序組樣本進(jìn)行測(cè)序,抽提環(huán)境中總DNA;谂囵B(yǎng)組學(xué)、宏基因組學(xué)的結(jié)果,探討膽囊炎菌群的致病機(jī)制。結(jié)果1、通過對(duì)5例健康人糞便標(biāo)本和5例膽囊炎患者糞便和膽汁樣本進(jìn)行培養(yǎng)組學(xué)分析共分離鑒定到727株細(xì)菌,隸屬于22個(gè)屬,共40個(gè)菌種。其中健康人糞便中共分離出328株細(xì)菌,隸屬于15個(gè)屬,共20種;其中最常分離到的為雙歧桿菌屬(Bifidobacterium)、乳桿菌屬(Lactobacillus)和埃希氏菌屬(Escherichia),分別分離到53株、44株和33株。膽囊炎患者總共分離出399株細(xì)菌,隸屬于18個(gè)屬,35個(gè)種。其中膽汁樣本分離培養(yǎng)得到細(xì)菌25株,...
【文章來源】:湖南師范大學(xué)湖南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:103 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
英文摘要
第一章 前言
第二章 膽囊炎相關(guān)微生物培養(yǎng)組學(xué)分析
2.1 實(shí)驗(yàn)材料和實(shí)驗(yàn)方法
2.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)論
第三章 膽囊炎相關(guān)微生物宏基因組學(xué)分析
3.1 實(shí)驗(yàn)方法
3.2 生物信息學(xué)分析
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
3.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)論
第四章 討論
第五章 結(jié)論
第六章 創(chuàng)新與不足
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
英文縮略詞對(duì)照表
附錄
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]人體微生態(tài)研究現(xiàn)狀與展望[J]. 廖秦平,牛小溪. 中國(guó)實(shí)用婦科與產(chǎn)科雜志. 2017(08)
[2]老年急性結(jié)石性膽囊炎腹腔鏡手術(shù)時(shí)機(jī)的探討[J]. 張宗明,魏文平,劉卓,田祖豪,張翀,劉立民,于宏偉,萬柏江,劉子旭,朱明文,宋蒙蒙,鄧海,謝朝輝. 中華普外科手術(shù)學(xué)雜志(電子版). 2016(05)
[3]Escherichia coli challenge and one type of smectite alter intestinal barrier of pigs[J]. Juliana Abranches Soares Almeida,Yanhong Liu,Minho Song,Jeong Jae Lee,H Rex Gaskins,Carol Wolfgang Maddox,Orlando Osuna,James Eugene Pettigrew. Journal of Animal Science and Biotechnology. 2014(02)
[4]急、慢性膽囊炎膽汁細(xì)菌培養(yǎng)及抗生素敏感性188例比較分析[J]. 顏偉筆,徐小豐,周龍飛. 現(xiàn)代診斷與治療. 2013(17)
[5]上海松江地區(qū)膽囊良性疾病的流行病學(xué)調(diào)查30901例[J]. 孫曉敏,徐萍,馬志紅,程曉松,朱佳莉,何桂鈞,任大賓. 世界華人消化雜志. 2011(27)
[6]Helicobacter species and common gut bacterial DNA in gallbladder with cholecystitis[J]. Peren H Karagin,Unne Stenram,Torkel Wadstrm,sa Ljungh. World Journal of Gastroenterology. 2010(38)
本文編號(hào):3158289
【文章來源】:湖南師范大學(xué)湖南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:103 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
英文摘要
第一章 前言
第二章 膽囊炎相關(guān)微生物培養(yǎng)組學(xué)分析
2.1 實(shí)驗(yàn)材料和實(shí)驗(yàn)方法
2.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)論
第三章 膽囊炎相關(guān)微生物宏基因組學(xué)分析
3.1 實(shí)驗(yàn)方法
3.2 生物信息學(xué)分析
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
3.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)論
第四章 討論
第五章 結(jié)論
第六章 創(chuàng)新與不足
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
英文縮略詞對(duì)照表
附錄
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]人體微生態(tài)研究現(xiàn)狀與展望[J]. 廖秦平,牛小溪. 中國(guó)實(shí)用婦科與產(chǎn)科雜志. 2017(08)
[2]老年急性結(jié)石性膽囊炎腹腔鏡手術(shù)時(shí)機(jī)的探討[J]. 張宗明,魏文平,劉卓,田祖豪,張翀,劉立民,于宏偉,萬柏江,劉子旭,朱明文,宋蒙蒙,鄧海,謝朝輝. 中華普外科手術(shù)學(xué)雜志(電子版). 2016(05)
[3]Escherichia coli challenge and one type of smectite alter intestinal barrier of pigs[J]. Juliana Abranches Soares Almeida,Yanhong Liu,Minho Song,Jeong Jae Lee,H Rex Gaskins,Carol Wolfgang Maddox,Orlando Osuna,James Eugene Pettigrew. Journal of Animal Science and Biotechnology. 2014(02)
[4]急、慢性膽囊炎膽汁細(xì)菌培養(yǎng)及抗生素敏感性188例比較分析[J]. 顏偉筆,徐小豐,周龍飛. 現(xiàn)代診斷與治療. 2013(17)
[5]上海松江地區(qū)膽囊良性疾病的流行病學(xué)調(diào)查30901例[J]. 孫曉敏,徐萍,馬志紅,程曉松,朱佳莉,何桂鈞,任大賓. 世界華人消化雜志. 2011(27)
[6]Helicobacter species and common gut bacterial DNA in gallbladder with cholecystitis[J]. Peren H Karagin,Unne Stenram,Torkel Wadstrm,sa Ljungh. World Journal of Gastroenterology. 2010(38)
本文編號(hào):3158289
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