中國漢族人群潰瘍性結(jié)腸炎的候選基因研究
發(fā)布時間:2021-04-13 05:24
目的:潰瘍性結(jié)腸炎是結(jié)腸的慢性炎癥性疾病,它和克羅恩病共同構(gòu)成炎癥性腸病的兩種主要亞型。許多證據(jù)表明遺傳易感性在潰瘍性結(jié)腸炎的發(fā)病機(jī)制中扮演重要的角色。近期的全基因組關(guān)聯(lián)研究發(fā)現(xiàn)了潰瘍性結(jié)腸炎的一些新的易感基因,并且大部分結(jié)果已經(jīng)在不同的隊列中得到了一致性重復(fù)。然而,這些研究結(jié)果都僅來自于高加索人群,中國人群中潰瘍性結(jié)腸炎患者的遺傳背景并不清楚。本研究的目的是:在中國人群中,對新近發(fā)現(xiàn)的易感基因IL10、IL2、IL21、MYO9B、ECM1、MST1和IL23R與潰瘍性結(jié)腸炎之間的易感性進(jìn)行關(guān)聯(lián)研究,并進(jìn)一步探索基因型與疾病表型之間的關(guān)系。方法:本研究為病例對照關(guān)聯(lián)研究,包括245例潰瘍性結(jié)腸炎患者和300例健康對照,全部為中國漢族人群。采用Taqman@基因分型技術(shù)對這7個易感基因的27個標(biāo)簽SNPs進(jìn)行檢測。實驗數(shù)據(jù)的分析使用UNPHASED3.0.12和Haploview4.0軟件包。結(jié)果:IL2-IL21基因區(qū)域與UC之間具有顯著關(guān)聯(lián)。IL2基因上的rs2069762(P=7.0×10-4,OR=1.54,95%CI 1.20-1....
【文章來源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
英文縮略詞表
中文摘要
英文摘要
第一章 前言
1.1 炎癥性腸病概述
1.2 本課題的整體研究策略
第二章 材料與方法
2.1 臨床樣本與臨床資料的收集
2.1.1 病例組—潰瘍性結(jié)腸炎患者
2.1.2 對照組
2.1.3 臨床資料的收集
2.2 SNP的選擇
2.3 SNP的分型
2.3.1 主要試劑
2.3.1.1 DNA提取的相關(guān)試劑
2.3.1.2 PCR相關(guān)試劑及其濃度
2.3.3 主要實驗技術(shù)步驟
2.3.3.1 DNA的提取
2.3.3.2 DNA的定量
2.3.3.3 實時定量聚合酶鏈反應(yīng)
2.3.3.4 等位基因分型鑒定
2.4 統(tǒng)計方法
2.4.1 Pedigree數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建
2.4.2 基因型分布頻率的Hardy-Weinberg平衡檢驗
2.4.3 病例-對照關(guān)聯(lián)研究數(shù)據(jù)分析
2.4.4 單體型分析
2.4.5 數(shù)量性狀分析
2.4.6 關(guān)聯(lián)研究結(jié)果的校正
第三章 研究結(jié)果
3.1 候選基因與潰瘍性結(jié)腸炎的相關(guān)性研究結(jié)果
3.1.1 Hardy-Weinberg平衡檢驗結(jié)果
3.1.2 基于等位基因的關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
3.1.3 基于基因型的關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
3.1.4 單體型分析結(jié)果
3.2 候選基因與臨床表型的相關(guān)性分析結(jié)果
3.2.1 等位基因-表型關(guān)聯(lián)分析的結(jié)果
3.2.2 基因型-表型關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
第四章 討論
4.1 嚴(yán)格篩選研究樣本的重要性
4.2 候選基因的選擇
4.3 SNP選擇方法的創(chuàng)新點
4.4 等位基因鑒定技術(shù)的先進(jìn)性
4.5 對本研究結(jié)果的詳細(xì)討論
4.5.1 IL2-IL21基因區(qū)域與潰瘍性結(jié)腸炎
4.5.2 IL23R基因與潰瘍性結(jié)腸炎
4.5.3 MYO9B基因與潰瘍性結(jié)腸炎
4.5.4 ECM1基因與潰瘍性結(jié)腸炎
4.5.5 IL10基因與潰瘍性結(jié)腸炎
4.5.6 MST1基因與潰瘍性結(jié)腸炎
4.6 未來研究的預(yù)期方向
第五章 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
簡歷
致謝
本文編號:3134701
【文章來源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
英文縮略詞表
中文摘要
英文摘要
第一章 前言
1.1 炎癥性腸病概述
1.2 本課題的整體研究策略
第二章 材料與方法
2.1 臨床樣本與臨床資料的收集
2.1.1 病例組—潰瘍性結(jié)腸炎患者
2.1.2 對照組
2.1.3 臨床資料的收集
2.2 SNP的選擇
2.3 SNP的分型
2.3.1 主要試劑
2.3.1.1 DNA提取的相關(guān)試劑
2.3.1.2 PCR相關(guān)試劑及其濃度
2.3.3 主要實驗技術(shù)步驟
2.3.3.1 DNA的提取
2.3.3.2 DNA的定量
2.3.3.3 實時定量聚合酶鏈反應(yīng)
2.3.3.4 等位基因分型鑒定
2.4 統(tǒng)計方法
2.4.1 Pedigree數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建
2.4.2 基因型分布頻率的Hardy-Weinberg平衡檢驗
2.4.3 病例-對照關(guān)聯(lián)研究數(shù)據(jù)分析
2.4.4 單體型分析
2.4.5 數(shù)量性狀分析
2.4.6 關(guān)聯(lián)研究結(jié)果的校正
第三章 研究結(jié)果
3.1 候選基因與潰瘍性結(jié)腸炎的相關(guān)性研究結(jié)果
3.1.1 Hardy-Weinberg平衡檢驗結(jié)果
3.1.2 基于等位基因的關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
3.1.3 基于基因型的關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
3.1.4 單體型分析結(jié)果
3.2 候選基因與臨床表型的相關(guān)性分析結(jié)果
3.2.1 等位基因-表型關(guān)聯(lián)分析的結(jié)果
3.2.2 基因型-表型關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
第四章 討論
4.1 嚴(yán)格篩選研究樣本的重要性
4.2 候選基因的選擇
4.3 SNP選擇方法的創(chuàng)新點
4.4 等位基因鑒定技術(shù)的先進(jìn)性
4.5 對本研究結(jié)果的詳細(xì)討論
4.5.1 IL2-IL21基因區(qū)域與潰瘍性結(jié)腸炎
4.5.2 IL23R基因與潰瘍性結(jié)腸炎
4.5.3 MYO9B基因與潰瘍性結(jié)腸炎
4.5.4 ECM1基因與潰瘍性結(jié)腸炎
4.5.5 IL10基因與潰瘍性結(jié)腸炎
4.5.6 MST1基因與潰瘍性結(jié)腸炎
4.6 未來研究的預(yù)期方向
第五章 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
簡歷
致謝
本文編號:3134701
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