目的炎癥性腸病（Inflammatory bowel disease,IBD）是一種特發(fā)性的腸道炎癥性疾病,常累及回腸、結(jié)腸及直腸。目前普遍認(rèn)為腸黏膜屏障的損傷是IBD患者腸道中較為常見的病理學(xué)改變,致病機(jī)制復(fù)雜,其主要原因為腸道上皮細(xì)胞的分化異常�，F(xiàn)有研究結(jié)果表明,Notch信號通路在腸道上皮細(xì)胞的分化過程中發(fā)揮主要調(diào)節(jié)作用。巖藻多糖是一種主要來源于褐藻的硫酸鹽碳水化合物,研究顯示其具有抗炎、抗氧化、抗腫瘤等作用。本研究結(jié)合生物信息學(xué)分析方法,基于Notch信號通路,探討巖藻多糖（Fucoidan,FUC）對人正常結(jié)腸上皮細(xì)胞（NCM460）炎癥損傷的保護(hù)作用。方法1.生物信息學(xué)分析從Gene Expression Omnibus（GEO）數(shù)據(jù)庫中下載GSE55651數(shù)據(jù)集的原始數(shù)據(jù),利用R語言對數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理后篩選出差異表達(dá)基因。利用DAVID數(shù)據(jù)庫和蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析,篩選出關(guān)鍵的靶基因。2.建立細(xì)胞炎癥損傷模型、細(xì)胞處理及分組體外培養(yǎng)NCM460細(xì)胞株,細(xì)胞分組如下:（1）空白組:僅添加完全培養(yǎng)基,不含細(xì)胞;（2）對照組:使用完全培養(yǎng)基培養(yǎng)細(xì)胞;（3）LPS誘導(dǎo)組:在體外培養(yǎng)的細(xì)... 

【文章來源】：青島大學(xué)山東省

【文章頁數(shù)】：60 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

火山圖注：橫坐標(biāo)為log2（FoldChange），縱坐標(biāo)為log10（FDR）

青島大學(xué)碩士學(xué)位論文16圖2.熱圖注：共172個差異表達(dá)基因（其中145個為上調(diào)基因，27個為下調(diào)基因）。紅色表示該基因在該樣本上高表達(dá)，而深藍(lán)色表示該基因在該樣本上低表達(dá)。Control（粉紅色）：對照組；LPS（淺藍(lán)色）：炎癥組。

結(jié)果19圖3.GOBP功能注釋注：橫坐標(biāo)表示該組基因數(shù)目所占比例，縱坐標(biāo)表示GO功能注釋分類名稱。紅色表示該GO組P值大，而深藍(lán)色表示該GO組P值校圓圈的大小表示基因數(shù)目，隨著圓圈的不斷增大，基因的數(shù)目逐漸增多。

【參考文獻(xiàn)】：
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本文編號：3119300