戊型肝炎病毒ORF2蛋白與豬肝細(xì)胞蛋白相互作用的研究
發(fā)布時(shí)間:2020-12-22 20:43
戊型肝炎病毒(Hepatitis E Virus,HEV)是戊型肝炎(Hepatitis E,HE)的病原體,主要經(jīng)糞口途徑傳播。HEV為單股正鏈無(wú)包膜RNA病毒,基因組長(zhǎng)約7.2Kb,包含三個(gè)開放編碼區(qū),ORF1、ORF2、ORF3,其中ORF2蛋白為病毒衣殼的主要成份,衣殼蛋白與宿主細(xì)胞的特異性結(jié)合啟動(dòng)HEV的復(fù)制過(guò)程,是決定HEV對(duì)宿主細(xì)胞親嗜性的首要步驟。哺乳動(dòng)物HEV有4個(gè)基因型(1-4型),4種型別之間HEV核苷酸序列的相似性在80%左右,但宿主范圍有一定差異,1型和2型HEV只感染人,3型和4型HEV既感染人也感染豬,并且豬是其主要的儲(chǔ)存宿主。本課題擬通過(guò)對(duì)HEV與豬肝蛋白相互作用的研究,篩選并確認(rèn)與HEV有特異性結(jié)合作用的豬肝蛋白,分析這些蛋白在病毒復(fù)制過(guò)程中的作用,進(jìn)一步通過(guò)比較基因1型、4型HEV與豬肝蛋白結(jié)合能力的差異,分析HEV宿主限制性及跨種屬感染的機(jī)制。我們利用分裂-泛素酵母雙雜交系統(tǒng),分別以基因1型HEV ORF2和基因4型HEVORF2蛋白為誘餌對(duì)豬肝臟cDNA文庫(kù)進(jìn)行篩選,經(jīng)過(guò)三次文庫(kù)篩選,運(yùn)用酵母共轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)去除酵母雙雜交假陽(yáng)性結(jié)果,得到與1型HEV ...
【文章來(lái)源】:中國(guó)食品藥品檢定研究院北京市
【文章頁(yè)數(shù)】:69 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
主要中英文縮寫詞
中文摘要
Abstract
一 前言
1.1 HEV 的基本病毒學(xué)特性
1.2 HEV 基因型及不同基因型的地理分布
1.3 HEV 在動(dòng)物中的流行、傳播途徑及跨種屬感染的潛在可能
1.4 本課題的研究目的和內(nèi)容
二 實(shí)驗(yàn)材料、試劑和儀器
2.1 材料
2.1.1 酵母雙雜交系統(tǒng)
2.1.2 化學(xué)發(fā)光免疫共沉淀系統(tǒng)
2.2 試劑及配制
2.2.1 試劑
2.2.2 試劑配制
2.3 儀器
三 實(shí)驗(yàn)技術(shù)
3.1 分裂‐泛素酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)技術(shù)
3.2 化學(xué)發(fā)光免疫共沉淀技術(shù)
四 實(shí)驗(yàn)方法
4.1 酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)
4.1.1 誘餌質(zhì)粒的構(gòu)建及擴(kuò)增
4.1.2 誘餌質(zhì)粒轉(zhuǎn)化酵母報(bào)告株 NMY51
4.1.3 酵母雙雜交誘餌質(zhì)粒功能性驗(yàn)證
4.1.4 酵母雙雜交篩選壓力的確定
4.1.5 酵母雙雜交篩選豬肝臟 cDNA 文庫(kù)
4.1.6 陽(yáng)性克隆的確認(rèn)以及捕獲質(zhì)粒的提取
4.1.7 酵母雙雜交共轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)
4.1.8 對(duì) pPR3N-Prey 中的捕獲基因進(jìn)行測(cè)序和序列分析
4.2 化學(xué)發(fā)光免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)
4.2.1 pAcGFP1‐Bait 和 pProlabel‐Prey 質(zhì)粒的構(gòu)建
4.2.2 AcGFP1‐Bait 和 ProLabel‐Prey 共轉(zhuǎn)染 293FT 細(xì)胞
4.2.3 化學(xué)發(fā)光免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)
4.3 ORF2 蛋白與肝細(xì)胞相互作用蛋白的生物信息學(xué)分析
五 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
5.1 酵母雙雜交篩選實(shí)驗(yàn)結(jié)果
5.1.1 酵母雙雜交誘餌質(zhì)粒大量提取后鑒定及定量
5.1.2 酵母報(bào)告株 NMY51 轉(zhuǎn)化誘餌質(zhì)粒后菌落 PCR 鑒定
5.1.3 誘餌質(zhì)粒功能性驗(yàn)證
5.1.4 酵母雙雜交文庫(kù)篩選壓力選擇
5.1.5 酵母雙雜交篩選與 HEV ORF2 相互作用的豬肝細(xì)胞文庫(kù)
5.1.6 捕獲蛋白亞細(xì)胞定位
5.2 化學(xué)發(fā)光免疫共沉淀
5.2.1 化學(xué)發(fā)光免疫共沉淀質(zhì)粒的構(gòu)建
5.2.2 化學(xué)發(fā)光免疫共沉淀質(zhì)粒表達(dá)鑒定
5.2.3 化學(xué)發(fā)光免疫共沉淀結(jié)果
5.2.4 相互作用蛋白功能富集聚類分析
5.2.5 捕獲蛋白與基因 1 型、4 型 HEV ORF2 結(jié)合力的比較
討論
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
論文綜述
參考文獻(xiàn)
致謝
本文編號(hào):2932405
【文章來(lái)源】:中國(guó)食品藥品檢定研究院北京市
【文章頁(yè)數(shù)】:69 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
主要中英文縮寫詞
中文摘要
Abstract
一 前言
1.1 HEV 的基本病毒學(xué)特性
1.2 HEV 基因型及不同基因型的地理分布
1.3 HEV 在動(dòng)物中的流行、傳播途徑及跨種屬感染的潛在可能
1.4 本課題的研究目的和內(nèi)容
二 實(shí)驗(yàn)材料、試劑和儀器
2.1 材料
2.1.1 酵母雙雜交系統(tǒng)
2.1.2 化學(xué)發(fā)光免疫共沉淀系統(tǒng)
2.2 試劑及配制
2.2.1 試劑
2.2.2 試劑配制
2.3 儀器
三 實(shí)驗(yàn)技術(shù)
3.1 分裂‐泛素酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)技術(shù)
3.2 化學(xué)發(fā)光免疫共沉淀技術(shù)
四 實(shí)驗(yàn)方法
4.1 酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)
4.1.1 誘餌質(zhì)粒的構(gòu)建及擴(kuò)增
4.1.2 誘餌質(zhì)粒轉(zhuǎn)化酵母報(bào)告株 NMY51
4.1.3 酵母雙雜交誘餌質(zhì)粒功能性驗(yàn)證
4.1.4 酵母雙雜交篩選壓力的確定
4.1.5 酵母雙雜交篩選豬肝臟 cDNA 文庫(kù)
4.1.6 陽(yáng)性克隆的確認(rèn)以及捕獲質(zhì)粒的提取
4.1.7 酵母雙雜交共轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)
4.1.8 對(duì) pPR3N-Prey 中的捕獲基因進(jìn)行測(cè)序和序列分析
4.2 化學(xué)發(fā)光免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)
4.2.1 pAcGFP1‐Bait 和 pProlabel‐Prey 質(zhì)粒的構(gòu)建
4.2.2 AcGFP1‐Bait 和 ProLabel‐Prey 共轉(zhuǎn)染 293FT 細(xì)胞
4.2.3 化學(xué)發(fā)光免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)
4.3 ORF2 蛋白與肝細(xì)胞相互作用蛋白的生物信息學(xué)分析
五 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
5.1 酵母雙雜交篩選實(shí)驗(yàn)結(jié)果
5.1.1 酵母雙雜交誘餌質(zhì)粒大量提取后鑒定及定量
5.1.2 酵母報(bào)告株 NMY51 轉(zhuǎn)化誘餌質(zhì)粒后菌落 PCR 鑒定
5.1.3 誘餌質(zhì)粒功能性驗(yàn)證
5.1.4 酵母雙雜交文庫(kù)篩選壓力選擇
5.1.5 酵母雙雜交篩選與 HEV ORF2 相互作用的豬肝細(xì)胞文庫(kù)
5.1.6 捕獲蛋白亞細(xì)胞定位
5.2 化學(xué)發(fā)光免疫共沉淀
5.2.1 化學(xué)發(fā)光免疫共沉淀質(zhì)粒的構(gòu)建
5.2.2 化學(xué)發(fā)光免疫共沉淀質(zhì)粒表達(dá)鑒定
5.2.3 化學(xué)發(fā)光免疫共沉淀結(jié)果
5.2.4 相互作用蛋白功能富集聚類分析
5.2.5 捕獲蛋白與基因 1 型、4 型 HEV ORF2 結(jié)合力的比較
討論
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
論文綜述
參考文獻(xiàn)
致謝
本文編號(hào):2932405
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