本文關(guān)鍵詞：IBS患者結(jié)腸組織中microRNA表達譜分析及其意義研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

《廣西醫(yī)科大學(xué)》 2014年

IBS患者結(jié)腸組織中microRNA表達譜分析及其意義研究

郭先文  

【摘要】：背景與目的：腸易激綜合征(Irritable bowel syndrome, IBS)是一種常見的功能性胃腸疾病,其臨床癥狀主要表現(xiàn)為腹痛、腹脹或腹部不適伴隨排便習(xí)慣或糞便性狀的改變。根據(jù)大便性狀可將IBS分為IBS-D、IBS-C和IBS-M三種不同的亞型。目前該病的發(fā)病機制尚未完全明確,其診斷主要依據(jù)以癥狀學(xué)為主的羅馬Ⅲ診斷標(biāo)準(zhǔn),缺乏公認的客觀診斷指標(biāo)。因此,尋找方便、有效的生物學(xué)標(biāo)志,將極大有利于疾病的診斷和治療。 微小RNA (microRNA, miRNAs)是一組長約18-23nt的內(nèi)源性非編碼RNA,其表達具有組織細胞特異性、發(fā)育時序性和進化保守性,在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)節(jié)靶基因的表達,從而參與細胞增殖、分化、凋亡、代謝、氧化應(yīng)激和人類疾病發(fā)生等生理和病理過程。研究發(fā)現(xiàn)在IBS患者腸道黏膜中存在著miRNAs表達改變,這提示miRNAs可能參與了IBS的發(fā)病過程。 本研究旨在應(yīng)用miRNA芯片技術(shù),從組織標(biāo)本中篩選出在IBS-D和IBS-C患者腸粘膜中差異表達顯著的miRNAs,并應(yīng)用生物信息學(xué)分析所有差異表達miRNAs的靶基因及其生物學(xué)功能,初步探討miRNAs在該病中發(fā)揮的作用,為IBS的分子診斷及治療奠定基礎(chǔ)。 材料和方法： 1.從正常對照組、IBS-D和IBS-C組中各抽出3例患者的乙狀結(jié)腸粘膜標(biāo)本用于芯片篩選實驗。 2.采用mirVanaTM RNA Isolation Kit提取分離總RNA,使用瓊脂糖凝膠電泳檢測RNA濃度及質(zhì)量。 3.利用Agilent Human miRNA芯片(8*60K,V19.0)進行miRNAs的篩選(北京曠博科技公司提供),應(yīng)用Feature Extraction和Gene Spring12.0軟件進行數(shù)據(jù)分析,以表達相差2.0倍或-2.0倍為閾值,找出差異表達顯著的miRNAs。 4.應(yīng)用TargetScan軟件對差異表達miRNAs進行靶基因預(yù)測,之后采用Gene Spring12.0軟件對靶基因進行GO富集分析和KEGG通路分析,以得到生物功能聚類注釋信息。 5.基于生物學(xué)功能選取其中8個miRNAs,利用qRT-PCR法檢測它們在20例IBS-D患者、10例IBS-C患者和10例正常對照者血清中的表達量,以對芯片篩選結(jié)果進行驗證。 實驗結(jié)果： 1.通過比較IBS-D組和對照組芯片檢測結(jié)果,發(fā)現(xiàn)72個miRNAs表達差異顯著,其中67個表達上調(diào),5個下調(diào)；比較IBS-C組和對照組miRNA芯片檢測結(jié)果,發(fā)現(xiàn)有17個miRNAs表達呈顯著差異,均為表達上調(diào)；進一步比較IBS-D組和IBS-C組miRNA芯片檢測結(jié)果,發(fā)現(xiàn)31個miRNAs差異表達顯著,其中28個表達上調(diào),3個表達下調(diào)。 2.應(yīng)用TargetScan對篩選出的miRNAs進行靶基因預(yù)測,預(yù)測到IBS-D/N中的靶基因數(shù)為461個,IBS-C/N中的靶基因數(shù)為218個,而IBS-D/IBS-C中的靶基因數(shù)為357個。然后,對這三組靶基因進行G0富集分析,發(fā)現(xiàn)這些靶基因與離子通道(Ca2+等)調(diào)控、細胞骨架、細胞黏附、細胞膜轉(zhuǎn)運、肥大細胞脫顆粒、神經(jīng)遞質(zhì)釋放或信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等過程相關(guān)；KEGG通路分析顯示這三組靶基因分別富集于13個、7個和9個通路中(p0.05),與細胞骨架調(diào)節(jié)、細胞因子與其受體相互作用等通路密切相關(guān)。 3.基于生物學(xué)功能選取8個miRNAs,利用qRT-PCR方法進行擴大樣本量驗證,結(jié)果顯示：與正常對照組相比較,miR-29b-1-5p, miR-3151, miR-3158-3p, miR-4421, miR-4660, miR-4755-3p和miR-3190-3p在IBS-D患者血清中表達明顯上調(diào)(p0.05),miR-3151在IBS-C患者血清中表達明顯上調(diào)(p0.05)；而miR-4660, miR-29b-1-5p在IBS-D/IBS-C組中表達明顯上調(diào)(p0.05)；這與芯片結(jié)果表達趨勢基本一致。 實驗結(jié)論： 1.證實miRNAs在IBS-D和IBS-C患者體內(nèi)存在差異性表達,進而表明IBS患者具有特異的miRNAs表達譜,這為進一步開展miRNAs作為IBS診斷及分型標(biāo)志物的研究奠定了基礎(chǔ)。 2.應(yīng)用生物信息學(xué)方法,發(fā)現(xiàn)了IBS-D/N、IBS-C/N和IBS-D/IBS-C組中差異表達miRNAs的靶向基因。這些靶基因與離子通道調(diào)控、細胞骨架及細胞黏附或跨膜轉(zhuǎn)運、肥大細胞顆粒、神經(jīng)遞質(zhì)釋放或信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等過程相關(guān)。這些生理過程可能參與了IBS的發(fā)病。因此,相關(guān)miRNAs可能在IBS發(fā)病中發(fā)揮重要的作用,其不同的表達譜可能是造成IBS亞型間存在不同臨床特征的原因之一。

【關(guān)鍵詞】：
【學(xué)位授予單位】：廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2014
【分類號】：R574.4
【目錄】：

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【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前6條

1 王旭丹;楊惠玲;;MicroRNA檢測方法的發(fā)展現(xiàn)狀[J];國際內(nèi)科學(xué)雜志;2007年11期

2 郭朝書;王承黨;;肥大細胞及類胰蛋白酶在腸易激綜合征內(nèi)臟敏感性中的作用[J];國際消化病雜志;2010年01期

3 童津津;曲波;李慶章;;整合素生物學(xué)功能的研究進展[J];中國畜牧獸醫(yī);2010年10期

4 郭維康;劉文虎;張東亮;;干擾肌動蛋白細胞骨架對NF-κB活性影響的研究進展[J];基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床;2010年12期

5 郝振華;李巍;;內(nèi)體—溶酶體運輸及其細胞功能[J];生命科學(xué);2010年11期

6 黃進;于翠平;殷海成;張勇;劉來亭;;TGF-β/Smad信號通路在動物腸黏膜屏障改變中的作用[J];飼料研究;2013年07期

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 彭麗華;腹瀉型腸易激綜合征及潰瘍性結(jié)腸炎大腸黏膜全基因組及MicroRNA表達譜研究[D];中國人民解放軍軍醫(yī)進修學(xué)院;2010年

【共引文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 王艷芳;趙彥宏;安澤偉;王愛云;張麗;劉林德;;植物microRNA及其抗脅迫作用機制研究進展[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2009年24期

2 于顥;閆旭;辛德東;;植物microRNA計算識別的研究進展[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2011年19期

3 王海霞;楊正濤;陳媛媛;劉文博;張雯;張乃生;;牛整合素β7亞基片段的表達及多抗制備[J];中國畜牧獸醫(yī);2011年03期

4 姜楠;胡易;陳耀星;王子旭;曹靜;董玉蘭;白鶴;;肥大細胞在動物腸道黏膜免疫屏障中的作用[J];中國畜牧獸醫(yī);2011年08期

5 趙潔苑;龔云路;王翼飛;;基于MiRfilter系統(tǒng)的毛果楊miRNA預(yù)測[J];上海大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2010年04期

6 楊中玫;沈茜;;游離microRNA在腫瘤診斷中的臨床應(yīng)用價值[J];檢驗醫(yī)學(xué);2010年05期

7 龐鑫;馬春林;廖世奇;何科基;王怡云;王小琦;毛愛紅;馬瑾;陳樺;;小鼠肝臟MicroRNA的提取與分離[J];中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報;2011年11期

8 馬雪梅;;基于qPCR的循環(huán)miRNA定量檢測的方法探討[J];臨床和實驗醫(yī)學(xué)雜志;2012年07期

9 葸玉琴;張強;馬春林;曾家豫;廖世奇;;運用SMART技術(shù)從雞肝臟中篩選microRNA[J];生物物理學(xué)報;2013年06期

10 田媛媛;李科純;史記;鄭文新;;MicroRNA在腫瘤發(fā)生發(fā)展、診斷、耐藥性方面的研究進展[J];數(shù)理醫(yī)藥學(xué)雜志;2013年06期

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前6條

1 陳愛榮;1、葉酸代謝酶相關(guān)亞甲基四氫葉酸還原酶基因多態(tài)性與2型糖尿病及代謝綜合征易感性的關(guān)聯(lián)研究 2、膀胱癌石蠟包埋組織microRNA檢測及臨床意義的初步探討[D];蘭州大學(xué);2010年

2 魏明輝;喉鱗癌及癌旁正常組織中microRNA的差異表達分析[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué);2009年

3 張文輝;胃遠端腺癌miRNA表達譜及miR-204調(diào)控機制的初步研究[D];中國人民解放軍軍醫(yī)進修學(xué)院;2010年

4 邊焱焱;大劑量糖皮質(zhì)激素對骨髓間充質(zhì)干細胞成骨分化的MiroRNA調(diào)控的實驗研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2012年

5 楊辰;~(125)I-UdR-殼聚糖納米微粒的研制及其治療兔肝癌的研究[D];蘇州大學(xué);2013年

6 石慧;基于功能化納米材料和Aptamer的細胞、活體層面腫瘤成像研究[D];湖南大學(xué);2013年

【二級參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 姚文柱,胡家露,吳開春,崔大祥;大鼠腸粘膜不同狀態(tài)下轉(zhuǎn)化生長因子的表達[J];第四軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報;2001年05期

2 王瑾;楊惠玲;;微小RNA與腫瘤[J];國際內(nèi)科學(xué)雜志;2007年03期

3 楊雪,歐陽欽;轉(zhuǎn)化生長因子β與炎癥性腸病研究進展[J];國外醫(yī)學(xué)(消化系疾病分冊);2005年03期

4 麗娜;付琳;梁磊;娜仁花;;精子膜表面糖蛋白受精素β的研究進展[J];中國畜牧獸醫(yī);2009年08期

5 楊云生;腸易激綜合征神經(jīng)免疫內(nèi)分泌網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機制[J];胃腸病學(xué)和肝病學(xué)雜志;2002年04期

6 虞冠華,葛錫銳,姚(金玨);轉(zhuǎn)化生長因子-β(TGF-β)的結(jié)構(gòu)[J];細胞生物學(xué)雜志;1994年03期

7 李巍;馮雅琴;郝嬋娟;郭小黎;崔艷艷;賀敏;何新;;溶酶體相關(guān)細胞器生物發(fā)生復(fù)合體相互作用組構(gòu)成胞內(nèi)體運輸網(wǎng)絡(luò)(英文)[J];遺傳學(xué)報;2007年08期

8 張喆;李巍;;Weibel-Palade小體形成和功能研究進展[J];遺傳;2009年09期

9 鞠成群;吳欣怡;;整合素在角膜上皮創(chuàng)傷愈合中的研究進展[J];眼科研究;2009年06期

10 王偉岸,錢家鳴,潘國宗;結(jié)腸黏膜肥大細胞活化在腸易激綜合征發(fā)病中的作用[J];中華消化雜志;2003年05期

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 姚欣;腹瀉型腸易激綜合征患者結(jié)腸黏膜蛋白質(zhì)的篩選與鑒定[D];中國人民解放軍軍醫(yī)進修學(xué)院;2008年

2 張春燕;腸易激綜合征與結(jié)腸黏膜差異表達蛋白[D];中國人民解放軍軍醫(yī)進修學(xué)院;2009年

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 張曉偉;李悅;李為民;楊寶峰;;microRNA與心血管疾病[J];中國心臟起搏與心電生理雜志;2008年02期

2 張強;李明遠;;癌癥新策略—let-7 microRNA家族[J];西部醫(yī)學(xué);2009年07期

3 龔柳陽;吳小脈;馮加喜;;肺癌相關(guān)microRNA的研究進展[J];中國肺癌雜志;2009年09期

4 許建;武治印;于典科;;血清microRNA在腫瘤診斷和預(yù)后評估中的應(yīng)用[J];科學(xué)通報;2010年01期

5 張瑩;鄭素軍;段鐘平;;microRNA-21在肝臟中的作用[J];世界華人消化雜志;2010年25期

6 王羽歐;桑偉偉;張紅勝;;microRNA在人類免疫缺陷病毒感染中的作用[J];生物技術(shù)通訊;2011年01期

7 ;Mechanisms of microRNA 200a in Hepatic Insulin Resistance by Interleukin-6[J];中國動脈硬化雜志;2011年03期

8 王福飛;李勇;;microRNA在腫瘤診治中的進展[J];江西醫(yī)藥;2011年06期

9 王坦;王玉;楊廷桐;;microRNA在肺癌發(fā)生發(fā)展中的研究進展[J];新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院學(xué)報;2011年06期

10 劉浩書;屈藝;母得志;;MicroRNA與缺氧缺血性腦損傷[J];實用兒科臨床雜志;2011年24期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 賈新正;盧肖男;聶慶華;張細權(quán);;雞部分microRNA的同源預(yù)測與克隆驗證[A];中國動物遺傳育種研究進展——第十五次全國動物遺傳育種學(xué)術(shù)討論會論文集[C];2009年

2 李炯;段德民;鄭克孝;;新型非標(biāo)記高通量microRNA芯片技術(shù)[A];第一屆全國生物物理化學(xué)會議暨生物物理化學(xué)發(fā)展戰(zhàn)略研討會論文摘要集[C];2010年

3 徐晨;鮑堅強;李定;郭強蘇;;microRNA-449在小鼠精子發(fā)生過程中的作用研究[A];中國解剖學(xué)會2011年年會論文文摘匯編[C];2011年

4 李道傳;王慶;楊萍;唐石伏;李志芳;肖勇梅;魏青;張波;陳雯;;microRNA在細胞轉(zhuǎn)化中的表達差異[A];中國毒理學(xué)會生化與分子毒理專業(yè)委員會第六屆全國學(xué)術(shù)會議、中國毒理學(xué)會遺傳毒理專業(yè)委員會第五屆全國學(xué)術(shù)會議、廣東省預(yù)防醫(yī)學(xué)會衛(wèi)生毒理專業(yè)委員會學(xué)術(shù)會議、廣東省環(huán)境誘變劑學(xué)會學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2008年

5 ;Induced cardiac myocytes apoptosis in vitro by micro RNA-122 overexpression[A];第十三次全國心血管病學(xué)術(shù)會議論文集[C];2011年

6 羅維;林宇翔;繩紀坡;于芳;胡寶成;;靶向細胞外基質(zhì)磷酸糖蛋白的microRNA的篩選及鑒定[A];第二屆模式生物與人類健康研討會會議論文集[C];2012年

7 ;microRNA-19a,a Novel Prognosis Predictor of Hepatocellular Carcinoma Following Liver Transplantation,Suppresses Cancer Metastasis by Down-Regulating SOX4[A];2012中國器官移植大會論文匯編[C];2012年

8 任雪峰;Dan GAILE;宮志宏;葛怡琛;黃陳平;閆洪濤;鄔紅梅;;砷對大鼠肝microRNA表達的影響[A];中國毒理學(xué)會第六屆全國毒理學(xué)大會論文摘要[C];2013年

9 劉詠梅;王階;;心血管疾病相關(guān)microRNA的研究進展[A];第十次中國中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會心血管病學(xué)術(shù)大會暨第五次江西省中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會心血管病學(xué)術(shù)大會論文匯編[C];2010年

10 鞏麗穎;孫開來;;兩種microRNA在先心病心肌組織中的表達[A];中國的遺傳學(xué)研究——遺傳學(xué)進步推動中國西部經(jīng)濟與社會發(fā)展——2011年中國遺傳學(xué)會大會論文摘要匯編[C];2011年

中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前4條

1 陳英云 喬蕤琳;[N];黑龍江經(jīng)濟報;2010年

2 記者 陳青;[N];文匯報;2011年

3 特約記者 肖鑫　記者 唐先武;[N];科技日報;2011年

4 記者 顧泳;[N];解放日報;2011年

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 楊軍;軟骨分化過程中的microRNA的功能研究[D];上海交通大學(xué);2011年

2 朱丹霞;microRNA在慢性淋巴細胞白血病凋亡抑制通路中的作用研究[D];南京醫(yī)科大學(xué);2012年

3 高雪;血漿microRNA作為肝癌及慢性乙肝肝損傷分子標(biāo)記物的研究[D];復(fù)旦大學(xué);2012年

4 鮑習(xí)琛;MicroRNA-302-367簇促進體細胞重編程和microRNA-145抑制肺癌細胞增殖的研究[D];中國科學(xué)技術(shù)大學(xué);2011年

5 蔣婷婷;microRNA在腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中的異常表達及其功能研究[D];浙江大學(xué);2012年

6 阮靈偉;深海熱液區(qū)管狀蠕蟲的分子特征及對蝦microRNA的初探[D];廈門大學(xué);2009年

7 徐鳳丹;microRNA基因表達調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的動力學(xué)與功能研究[D];上海大學(xué);2010年

8 楊云嬌;microRNA作為原發(fā)性膽汁性肝硬化新的疾病標(biāo)志物及其功能的初步研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2013年

9 顏興起;MicroRNA功能的生物信息學(xué)分析及相關(guān)平臺的建立[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué);2008年

10 付極;microRNA-451對胰腺癌細胞化療敏感性的影響[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2012年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 陳旭;玉米microRNA的計算機預(yù)測與克隆及在干旱下的差異表達分析[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年

2 史菊;基于qRT-PCR檢測ESCC組織/血清microRNA的方法建立及其應(yīng)用的研究[D];蘇州大學(xué);2012年

3 朱小舟;microRNA在胚胎血發(fā)生中的功能及調(diào)控研究[D];華東師范大學(xué);2011年

4 龐鑫;microRNA分離制備方法的研究[D];蘭州大學(xué);2012年

5 范心廷;鑒別三種肺癌亞型的microRNA數(shù)學(xué)模型在支氣管刷檢樣本中的驗證[D];復(fù)旦大學(xué);2012年

6 何沉峰;一種基于能量和結(jié)構(gòu)的microRNA成熟體預(yù)測方法[D];南京大學(xué);2011年

7 周冬根;犬類microRNA的計算機鑒定及分析[D];南昌大學(xué);2007年

8 李世風(fēng);馬鈴薯microRNA及其靶基因的預(yù)測與功能分析[D];甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年

9 劉曉玲;基于等溫放大反應(yīng)檢測microRNA[D];河北大學(xué);2013年

10 邊黎穎;水稻microRNA過表達轉(zhuǎn)化植株的獲得及表型與功能分析[D];揚州大學(xué);2010年

  本文關(guān)鍵詞：IBS患者結(jié)腸組織中microRNA表達譜分析及其意義研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

，

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