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活化的大鼠肝星狀細(xì)胞賴氨酸乙;鞍踪|(zhì)組學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-05-16 17:53

  本文選題:肝星狀細(xì)胞 + 賴氨酸乙;; 參考:《復(fù)旦學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版)》2016年05期


【摘要】:目的對(duì)活化的大鼠肝星狀細(xì)胞(hepatic stellate cells,HSCs)進(jìn)行賴氨酸乙;(lysine acetylation,Kac)蛋白質(zhì)組學(xué)分析。方法于清潔級(jí)雄性SD大鼠中提取并培養(yǎng)原代HSCs,分為對(duì)照組(培養(yǎng)2天)和活化組(培養(yǎng)≥10天)。對(duì)兩組細(xì)胞進(jìn)行裂解,iTRAQ/TMT標(biāo)記后的成對(duì)肽段樣品采用乙酰化抗體進(jìn)行親和富集,應(yīng)用高分辨率LC-MS/MS技術(shù)進(jìn)行質(zhì)譜鑒定。最后對(duì)質(zhì)譜鑒定的乙;鞍踪|(zhì)進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果應(yīng)用LC-MS/MS技術(shù)、GO注釋和KEGG通路等生物信息學(xué)分析方法,共確定309種蛋白質(zhì)中的470個(gè)Kac位點(diǎn)。對(duì)其中150個(gè)蛋白質(zhì)的231個(gè)Kac位點(diǎn)進(jìn)行肽段定量研究,與靜息的HSCs相比,在活化的HSCs中有109個(gè)蛋白質(zhì)的乙酰化肽段數(shù)目增加,18個(gè)蛋白質(zhì)的乙;亩螖(shù)目減少,并涉及多種GO分類和KEGG通路。乙;鞍踪|(zhì)廣泛定位于胞質(zhì)(38.1%)和線粒體(30.2%);贕O富集的聚類分析顯示Kac位點(diǎn)主要與能量代謝相關(guān);基于KEGG通路的聚類分析顯示這些蛋白質(zhì)廣泛參與三羧酸循環(huán),與線粒體關(guān)系密切。結(jié)論首次對(duì)HSCs的Kac蛋白質(zhì)進(jìn)行質(zhì)譜分析,并對(duì)發(fā)生乙;牡鞍踪|(zhì)位點(diǎn)進(jìn)行量化鑒定,為揭示蛋白質(zhì)乙;贖SCs活化過(guò)程中的作用提供了一定的基礎(chǔ),并為抑制肝纖維化提供了潛在的分子靶標(biāo)。
[Abstract]:Objective to study the proteomics of lysine acetylated rat hepatic stellate cells (HSCs). Methods Primary HSCs were isolated from clean male SD rats and divided into two groups: control group (culture for 2 days) and activated group (culture 鈮,

本文編號(hào):1897835

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