活化的大鼠肝星狀細胞賴氨酸乙酰化蛋白質組學分析
發(fā)布時間:2018-05-16 17:53
本文選題:肝星狀細胞 + 賴氨酸乙;; 參考:《復旦學報(醫(yī)學版)》2016年05期
【摘要】:目的對活化的大鼠肝星狀細胞(hepatic stellate cells,HSCs)進行賴氨酸乙酰化(lysine acetylation,Kac)蛋白質組學分析。方法于清潔級雄性SD大鼠中提取并培養(yǎng)原代HSCs,分為對照組(培養(yǎng)2天)和活化組(培養(yǎng)≥10天)。對兩組細胞進行裂解,iTRAQ/TMT標記后的成對肽段樣品采用乙酰化抗體進行親和富集,應用高分辨率LC-MS/MS技術進行質譜鑒定。最后對質譜鑒定的乙酰化蛋白質進行生物信息學分析。結果應用LC-MS/MS技術、GO注釋和KEGG通路等生物信息學分析方法,共確定309種蛋白質中的470個Kac位點。對其中150個蛋白質的231個Kac位點進行肽段定量研究,與靜息的HSCs相比,在活化的HSCs中有109個蛋白質的乙酰化肽段數(shù)目增加,18個蛋白質的乙;亩螖(shù)目減少,并涉及多種GO分類和KEGG通路。乙;鞍踪|廣泛定位于胞質(38.1%)和線粒體(30.2%);贕O富集的聚類分析顯示Kac位點主要與能量代謝相關;基于KEGG通路的聚類分析顯示這些蛋白質廣泛參與三羧酸循環(huán),與線粒體關系密切。結論首次對HSCs的Kac蛋白質進行質譜分析,并對發(fā)生乙;牡鞍踪|位點進行量化鑒定,為揭示蛋白質乙酰化在HSCs活化過程中的作用提供了一定的基礎,并為抑制肝纖維化提供了潛在的分子靶標。
[Abstract]:Objective to study the proteomics of lysine acetylated rat hepatic stellate cells (HSCs). Methods Primary HSCs were isolated from clean male SD rats and divided into two groups: control group (culture for 2 days) and activated group (culture 鈮,
本文編號:1897835
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