本文選題：丙型肝炎病毒　切入點(diǎn)：肝硬化　出處：《天津醫(yī)科大學(xué)》2017年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：目的丙型肝炎病毒(Hepatitis C Virus,HCV)感染是引發(fā)肝硬化及肝細(xì)胞肝癌(Hepatocellular Carcinoma,HCC)的一種重要的危險(xiǎn)因素,病毒與宿主之間的相互作用在疾病的發(fā)生發(fā)展中起著重要作用。數(shù)個(gè)與丙型肝炎病毒感染相關(guān)肝硬化及肝癌易感性相關(guān)單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)在國(guó)外人群中已被廣泛研究報(bào)道,如“主要組織相容性復(fù)合體Ι類多肽相關(guān)序列A(MHC class I polypeptide-related sequence A,MICA,rs2596542)、DEPDC5 rs1012068、含patatin樣磷脂酶域3(patatin-like phospholipase domain containing 3,PNPLA3,rs738409)、維生素D受體(vitamin D receptor,VDR,rs7975232)和表皮生長(zhǎng)因子(epidermal growth factor,EGF,rs4444903)”。這些SNPs的等位基因頻率分布在不同地區(qū)種族人群之間有很大的差異性,且在中國(guó)人群中尚沒有上述SNPs與丙型肝炎病毒感染相關(guān)肝硬化、肝癌易感性的研究報(bào)道,因此我們選取了之前國(guó)外報(bào)道過的5個(gè)SNPs,在中國(guó)漢族人群中研究是否與HCV感染相關(guān)肝硬化、肝癌易感性也存在相關(guān)性。方法本實(shí)驗(yàn)研究分為兩個(gè)部分進(jìn)行,第一部分通過檢索美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)數(shù)據(jù)庫中與HCV感染相關(guān)肝硬化、肝癌易感性相關(guān)的SNPs,然后通過病例-對(duì)照研究的方法收集了62例肝硬化患者(病例組)和79例慢性丙型肝炎患者(對(duì)照組)。應(yīng)用基質(zhì)輔助激光解吸電離-飛行時(shí)間質(zhì)譜(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)分型技術(shù)對(duì)所有患者5個(gè)SNPs進(jìn)行測(cè)定,然后應(yīng)用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法分析這些SNPs在我國(guó)漢族人群是否與HCV感染相關(guān)肝硬化易感性相關(guān)。第二部分我們收集了46例丙肝肝癌患者,測(cè)定SNPs并統(tǒng)計(jì)分析了這些SNPs是否與HCV感染相關(guān)肝癌易感性相關(guān)。結(jié)果第一部分實(shí)驗(yàn)中的5個(gè)SNPs與HCV感染相關(guān)肝硬化易感性研究結(jié)果顯示:(1)在本實(shí)驗(yàn)人群中未發(fā)現(xiàn)MICA rs2596542與HCV感染相關(guān)肝硬化易感性相關(guān)聯(lián):肝硬化組中基因型GG、GA和AA的頻率分別為46.77%、41.94%和11.29%,與肝炎組(58.23%、34.18%、7.59%)相比,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。肝硬化組中等位基因G的分布頻率為67.74%,較肝炎組(75.32%),差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。隨后在經(jīng)校正年齡、性別等影響因素的多因素Logistic回歸分析各遺傳模型中未發(fā)現(xiàn)rs2596542與HCV感染相關(guān)肝硬化易感性存在關(guān)聯(lián)性。(2)在本實(shí)驗(yàn)人群中未發(fā)現(xiàn)DEPDC5 rs1012068與HCV感染相關(guān)肝硬化易感性相關(guān)聯(lián):肝硬化組基因型TT、TG和GG的頻率分別為54.84%、35.48%和9.68%,與肝炎組(60.76%、36.71%、2.53%)比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。肝硬化組中等位基因T的分布頻率為72.58%,較肝炎組(79.11%),差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。隨后在經(jīng)校正年齡、性別等影響因素的多因素Logistic回歸分析各遺傳模型中未發(fā)現(xiàn)rs1012068與HCV感染相關(guān)肝硬化易感性存在關(guān)聯(lián)性。(3)在本實(shí)驗(yàn)人群中未發(fā)現(xiàn)PNPLA3 rs738409與HCV感染相關(guān)肝硬化易感性相關(guān)聯(lián):肝硬化組中CC、CG和GG基因型頻率分別為37.10%、46.77%、16.13%,與肝炎組(44.30%、43.04%、12.66%)相比,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。肝硬化組中等位基因C的頻率分布為60.48%,較肝炎組(65.82%),差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。隨后在經(jīng)校正年齡、性別等影響因素的多因素Logistic回歸分析各遺傳模型中未發(fā)現(xiàn)rs738409與HCV感染相關(guān)肝硬化易感性存在關(guān)聯(lián)性。(4)在本實(shí)驗(yàn)人群中未發(fā)現(xiàn)VDR rs7975232與HCV感染相關(guān)肝硬化易感性相關(guān)聯(lián):肝硬化組基因型CC、CA和AA的頻率分別為58.06%、38.71%和3.23%,與肝炎組(49.37%、45.57%、5.06%)相比,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。肝硬化組中等位基因C的分布頻率為77.42%,較肝炎組(72.15%),差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。隨后在經(jīng)校正年齡、性別等影響因素的多因素Logistic回歸分析各遺傳模型中未發(fā)現(xiàn)rs7975232與HCV感染相關(guān)肝硬化易感性存在關(guān)聯(lián)性。(5)在本實(shí)驗(yàn)人群中發(fā)現(xiàn)EGF rs4444903與HCV感染相關(guān)肝硬化易感性存在關(guān)聯(lián)性:肝硬化組基因型GG、AG和AA的頻率分別為61.30%、31.25%、6.45%,與肝炎組(40.50%、51.90%、7.60%)相比,兩組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.045);肝硬化組和肝炎組中等位基因G的頻率分別為77.42%和66.46%,兩組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.043);隨后在經(jīng)校正年齡、性別等影響因素的多因素Logistic分析隱性遺傳模型中發(fā)現(xiàn):攜帶基因型GG的肝炎患者發(fā)生肝硬化的風(fēng)險(xiǎn)為AA+AG患者的2.188倍(OR=2.188,95%CI=1.072-4.465,P=0.031)。第二部分結(jié)果顯示:(1)在本實(shí)驗(yàn)人群中未發(fā)現(xiàn)位點(diǎn)rs2596542、rs1012068、rs738409和rs7975232與HCV感染相關(guān)肝癌易感性存在關(guān)聯(lián)性。(2)EGF rs4444903與HCV感染相關(guān)肝癌易感性相關(guān):肝癌組中基因型GG、AG和AA的頻率分別為60.87%、32.61%和6.52%,較肝炎組(40.50%、51.90%、7.60%)差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.083)。肝癌組等位基因G的頻率為77.17%,與肝炎組(66.46%)相比,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.073)。隨后在經(jīng)校正年齡、性別等影響因素的多因素Logistic回歸中研究發(fā)現(xiàn),等位基因G為發(fā)生肝癌的風(fēng)險(xiǎn)等位基因(OR=1.944,95%CI:1.023-3.695,P=0.042);攜帶基因型GG的肝炎患者發(fā)生肝癌的風(fēng)險(xiǎn)為AA+AG基因型患者的3.104倍(OR=3.104,95%=1.319-7.30,P=0.01)。結(jié)論(1)EGF rs4444903與HCV感染相關(guān)肝硬化、肝癌易感性相關(guān)。(2)在本實(shí)驗(yàn)研究人群中未發(fā)現(xiàn)MICA rs2596542,DEPDC5 rs1012068,PNPLA3rs738409和VDR rs7975232與HCV感染相關(guān)肝硬化、肝癌易感性相關(guān)。
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【學(xué)位授予單位】：天津醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：R512.63;R575.2;R735.7

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 嚴(yán)衛(wèi)麗;;復(fù)雜疾病全基因組關(guān)聯(lián)研究進(jìn)展——遺傳統(tǒng)計(jì)分析[J];遺傳;2008年05期

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本文編號(hào)：1595761