Piezo2蛋白的生物信息學(xué)分析及其在腸道中的表達(dá)
本文關(guān)鍵詞:Piezo2蛋白的生物信息學(xué)分析及其在腸道中的表達(dá) 出處:《重慶醫(yī)學(xué)》2016年15期 論文類型:期刊論文
更多相關(guān)文章: 腸神經(jīng)系統(tǒng) 腸黏膜 機(jī)械門控離子通道 Piezo
【摘要】:目的對(duì)Piezo2性質(zhì)、結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行預(yù)測(cè)分析,并檢測(cè)其在腸道的表達(dá)。方法利用Protparam程序預(yù)測(cè)人Piezo2蛋白基本理化性質(zhì);TMHMM Serve 2.0預(yù)測(cè)跨膜結(jié)構(gòu)域;ProtComp Version 9.0分析亞細(xì)胞定位;用SOPMA程序預(yù)測(cè)其二級(jí)結(jié)構(gòu);SWISS-MODEL服務(wù)器生成其三維模型。免疫組織化學(xué)染色確定Piezo2在腸道組織的表達(dá)位置,以實(shí)時(shí)定量熒光PCR檢測(cè)Piezo2在不同腸段的表達(dá)量及與Epac1表達(dá)的相關(guān)性。結(jié)果 Piezo2蛋白分子式為C14539H22436N3662O4087S130,相對(duì)分子質(zhì)量為318.092×103,等電點(diǎn)pI=5.82。Piezo2蛋白存在35個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域,并有多個(gè)蛋白修飾位點(diǎn)。免疫組織化學(xué)染色發(fā)現(xiàn)Piezo2蛋白表達(dá)于腸道上皮與神經(jīng)節(jié),其在結(jié)腸表達(dá)水平較回腸豐富(P0.01),其中結(jié)腸Piezo2與Epac1在mRNA水平表達(dá)呈正相關(guān)(r2=0.65,P0.01)。結(jié)論 Piezo2在結(jié)腸表達(dá)豐富,可能通過Epac1通路參與腸道機(jī)械力感知與調(diào)控。
[Abstract]:Objective to predict the nature, structure and function of Piezo2 and to detect its expression in the intestinal tract. Methods the basic physical and chemical properties of human Piezo2 protein were predicted by Protparam program, TMHMM Serve 2 was used to predict transmembrane domain, ProtComp Version 9 was used to analyze subcellular location, SOPMA program was used to predict its secondary structure, SWISS-MODEL server generated its 3D model. Immunohistochemical staining was used to determine the expression of Piezo2 in intestinal tissue. Real-time quantitative fluorescence PCR was used to detect the expression of Piezo2 in different intestinal segments and its correlation with Epac1 expression. Results the molecular formula of Piezo2 protein was C14539H22436N3662O4087S130, the relative molecular weight was 318.092 x 103, and the isoelectric point was pI=5.82. There are 35 transmembrane domains in the Piezo2 protein, and there are several protein modification sites. Immunohistochemical staining showed that Piezo2 protein was expressed in intestinal epithelium and ganglion, and its expression level in colon was more abundant than that in ileum (P0.01). The expression of Piezo2 in colon was positively correlated with Epac1 expression at mRNA level (r2=0.65, P0.01). Conclusion the expression of Piezo2 is abundant in the colon and may be involved in the perception and regulation of intestinal mechanical force through the Epac1 pathway.
【作者單位】: 華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院附屬協(xié)和醫(yī)院消化內(nèi)科;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(81200271)
【分類號(hào)】:R57
【正文快照】: 2010年Coste等[1]發(fā)現(xiàn)并定義了Piezo2蛋白。通過細(xì)胞系中的體外siRNA篩選及電生理實(shí)驗(yàn)的方法,證實(shí)Piezo2是機(jī)械門控離子通道蛋白。Piezo2是非選擇性陽(yáng)離子通道蛋白,受機(jī)械信號(hào)刺激,通道開放,將機(jī)械刺激信號(hào)轉(zhuǎn)化為生物電信號(hào)。Piezo2表達(dá)于傳入神經(jīng)節(jié)(如三叉神經(jīng)節(jié)及背根神經(jīng)節(jié)
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本文編號(hào):1343390
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