HBV相關(guān)慢加急性肝衰竭后肝細(xì)胞再生相關(guān)miRNA的篩選
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【摘要】:目的:本研究旨在獲得不同轉(zhuǎn)歸HBV相關(guān)慢加急性肝衰竭患者(ACLF)組間以及組內(nèi)病情變化前后血漿miRNA的差異表達(dá)譜;篩選出與ACLF后肝細(xì)胞再生相關(guān)的miRNA及其靶基因,為進(jìn)一步探索miRNA在ACLF后肝細(xì)胞再生中作用及機(jī)制提供理論基礎(chǔ)。方法:收集西南醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院住院部HBV相關(guān)慢加急性肝衰竭早期患者初診時(shí)的血漿標(biāo)本;治療過程中病情無好轉(zhuǎn)甚至惡化且診斷為晚期時(shí)再次收集血漿標(biāo)本;病情好轉(zhuǎn)者隨訪至肝功能正常時(shí)再次收集血漿標(biāo)本。所有未死亡患者隨訪至少24周,同時(shí)收集患者人口學(xué)資料及臨床資料。根據(jù)臨床轉(zhuǎn)歸分為存活組和死亡組,根據(jù)各組各指標(biāo)中位數(shù)情況,選取存活組、死亡組各3例2個(gè)時(shí)間點(diǎn)血漿標(biāo)本,通過miRNA基因芯片技術(shù)分析不同轉(zhuǎn)歸ACLF患者組間以及組內(nèi)病情變化前后血漿miRNA表達(dá)譜的差異;根據(jù)基因芯片分析結(jié)果篩選出不同轉(zhuǎn)歸ACLF患者組間以及組內(nèi)病情變化前后差異表達(dá)的miRNA(上調(diào)或者下調(diào)超過1.5倍,p0.05),利用miRBase、PUBMED,Medline等數(shù)據(jù)庫進(jìn)行生物信息學(xué)分析,篩選出可能與ACLF后肝再生相關(guān)的miRNA及其靶基因。結(jié)果:miRNA基因芯片結(jié)果顯示,存活組ACLF基線(初診為早期)時(shí)miRNA表達(dá)水平與隨訪至肝功能正常時(shí)miRNA表達(dá)水平相比較,共有41個(gè)差異表達(dá)的miRNA;其中hsa-miR-4468、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-4732-5p、hsa-miR-200c-3p、hsa-miR-541-5p、hsa-miR-660-3p、hsa-miR-4777-5p等共27個(gè)miRNA表達(dá)上調(diào);hsa-miR-30b-5p、hsa-let-7f-2-3p、hsa-miR-1297、hsa-miR-548y、hsa-miR-4451等共14個(gè)miRNA表達(dá)下調(diào)。存活組ACLF基線(初診為早期)時(shí)miRNA表達(dá)水平與死亡組ACLF基線(初診為早期)時(shí)miRNA表達(dá)水平相比較,共有57個(gè)差異表達(dá)的miRNA;其中hsa-miR-491-3p、hsa-miR-27b-3p、hsa-miR-4532、hsa-miR-125a-5p、hsa-miR-4456、hsa-miR-222-3p、hsa-miR-298、hsa-miR-222-3p、hsa-miR-3940-5p等共35個(gè)miRNA表達(dá)上調(diào),hsa-miR-146b-5p、hsa-miR-1297、hsa-miR-142-5p、hsa-miR-223-3p、hsa-let-7f-2-3p、hsa-miR-4739等共22個(gè)miRNA表達(dá)下調(diào)。死亡組ACLF基線(初診為早期)時(shí)miRNA表達(dá)水平與隨訪診斷為晚期時(shí)miRNA表達(dá)水平相比較,共有8個(gè)差異表達(dá)miRNA;其中hsa-miR-142-3p、hsa-miR-1827共2個(gè)miRNA表達(dá)上調(diào),hsa-miR-875-3p、hsa-miR-4521、hsa-miR-5579-3p、hsa-miR-641、hsa-miR-548a-5p、hsa-miR-4796-3p共6個(gè)miRNA表達(dá)下調(diào)。通過Medline、Pubmed、miRbase數(shù)據(jù)庫對(duì)差異表達(dá)的miRNA進(jìn)行初步的生物信息學(xué)分析,hsa-miR-148a-3p、hsa-miR-1297、hsa-miR-142a-3p、hsa-miR-125a-5p等10個(gè)miRNA可能與ACLF后肝再生相關(guān),其生物學(xué)功能涉及參與各類細(xì)胞的增殖及凋亡的調(diào)控;此外,EGFR、SMAD4、CXCR4、PTEN等共34個(gè)靶基因可能與ACLF后肝再生相關(guān),其生物學(xué)功能涉及參與各類細(xì)胞的增殖及凋亡的調(diào)控。結(jié)論:(1)不同轉(zhuǎn)歸HBV相關(guān)慢加急性肝衰竭存在差異表達(dá)的miRNA,可能參與不同轉(zhuǎn)歸HBV相關(guān)慢加急性肝衰竭發(fā)生過程。(2)hsa-miR-148a-3p、hsa-miR-1297、hsa-miR-142a-3p、hsa-miR-125a-5p等10個(gè)miRNA可能參與HBV相關(guān)慢加急性肝衰竭后肝再生過程,其具體作用機(jī)制需進(jìn)一步研究。
【學(xué)位授予單位】:西南醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R512.62;R575.3
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6 譚善忠;張e,
本文編號(hào):1230607
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