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ceRNA網(wǎng)絡(luò)與內(nèi)耳毛細(xì)胞突觸調(diào)節(jié)的相關(guān)性研究

發(fā)布時間:2022-02-17 17:45
  研究背景感音神經(jīng)性聾(Sensorineural hearing loss,SNHL)占耳聾很大部分,主要是因感覺毛細(xì)胞丟失或傳入神經(jīng)到聽覺皮層傳導(dǎo)通路受損引起的聽力閾值的升高。內(nèi)耳突觸數(shù)量改變或功能障礙導(dǎo)致毛細(xì)胞與螺旋神經(jīng)節(jié)細(xì)胞之間的信號傳遞異常,是引起感音神經(jīng)性聾重要原因之一;蛲蛔兒铜h(huán)境因素,都可造成毛細(xì)胞的不可逆損傷或?qū)е聝?nèi)毛細(xì)胞突觸的退化,導(dǎo)致聽力喪失!岸佂挥|病”(cochlear synaptopathy,CS)指毛細(xì)胞數(shù)量保持不變的情況下,內(nèi)耳毛細(xì)胞與聽神經(jīng)纖維之間的傳遞遞質(zhì)的突觸減少,可能是感音神性聾尤其是老年性聾重要的發(fā)病機(jī)制之一。課題組既往研究發(fā)現(xiàn)Dynamin1蛋白是維持突觸囊泡內(nèi)吞的關(guān)鍵蛋白,并受到miR-30b和miR-140的調(diào)控;同時Dynamin1及miR-30b和miR-140在不同年齡段內(nèi)耳差異表達(dá)。即Dynamin1在老年鼠表達(dá)下降,miR-30b和miR-140在老年鼠表達(dá)上調(diào)。但Dynamin蛋白更深入的調(diào)控機(jī)制及其他參與突觸調(diào)控的基因尚不清楚。競爭性內(nèi)源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)指lncRNA... 

【文章來源】:中國人民解放軍陸軍軍醫(yī)大學(xué)重慶市

【文章頁數(shù)】:55 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

ceRNA網(wǎng)絡(luò)與內(nèi)耳毛細(xì)胞突觸調(diào)節(jié)的相關(guān)性研究


樣品測序質(zhì)量評估2.3.3成年鼠與老年鼠差異表達(dá)分析

網(wǎng)絡(luò)圖,網(wǎng)絡(luò)圖,分子


陸軍軍醫(yī)大學(xué)碩士學(xué)位論文15計(jì)有335個節(jié)點(diǎn)分子,2595條ceRNA網(wǎng)絡(luò)關(guān)系(圖2)。其中紅色節(jié)點(diǎn)代表上調(diào),藍(lán)色代表下調(diào);紅色線條代表正向關(guān)系,藍(lán)色代表負(fù)向關(guān)系,灰色代表miRNA調(diào)控其它分子;圓點(diǎn)節(jié)點(diǎn)代表mRNA分子,圓點(diǎn)加外圈黃色代表lncRNA分子,三角形代表miRNA分子。圖形整體結(jié)構(gòu):1號區(qū)域是mRNA,2號區(qū)域是lncRNA,1、2號區(qū)域總體受到miR-30b-3p的調(diào)控(都是miR-30b的靶向分子);3號區(qū)域是mRNA,4號區(qū)域是lncRNA,3、4號區(qū)域總體受到miR-140-3p的調(diào)控(都是miR-140b的靶向分子)。圖2Dnm1,miR-140、miR-30b與差異RNA共表達(dá)CeRNA網(wǎng)絡(luò)圖以Dnm1,miR-140、miR-30b為核心構(gòu)建的ceRNA網(wǎng)絡(luò)圖:篩選閾值高于0.9且與Dnm1,miR-30b及miR-140有共表達(dá)關(guān)系的RNA分子為:Gm10684,2900079G21Rik,1700036A12Rik,B830012L14Rik,Gm11815,Gm19967。詳細(xì)調(diào)控關(guān)系見圖3。

網(wǎng)絡(luò)圖,網(wǎng)絡(luò)圖,閾值,突觸


陸軍軍醫(yī)大學(xué)碩士學(xué)位論文16圖3Dnm1、miR-30b及miR-140ceRNA網(wǎng)絡(luò)圖(閾值>0.9)2.4討論內(nèi)吞作用(endocytosis)即胞吞,是通過包圍細(xì)胞外物質(zhì)形成內(nèi)吞泡,隨后脫離質(zhì)膜進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)的過程。突觸將信號從感覺細(xì)胞或者神經(jīng)元傳遞至其他神經(jīng)元或者不同的靶細(xì)胞是通過釋放神經(jīng)遞質(zhì)實(shí)現(xiàn)的,而神經(jīng)遞質(zhì)釋放是在突觸前膜活性域進(jìn)行的,每個內(nèi)毛細(xì)胞含有5-30個活性域,其數(shù)目因物種及部位不同有差異。內(nèi)毛細(xì)胞是耳蝸內(nèi)主要的聽覺感受細(xì)胞,與外毛細(xì)胞分別受不同的螺旋神經(jīng)元(spiralganglionNeuron,SGN)支配[23],每一個Ⅰ型螺旋神經(jīng)元發(fā)出一條無髓鞘、無突起的神經(jīng)突與單個內(nèi)毛細(xì)胞形成突觸連接,因在透射鏡下呈帶狀排列,故稱為帶狀突觸(ribbonsynapse)[24]。CME是突觸前膜主要的胞吞方式之一[25]。在這個過程中,Dynamin蛋白可使網(wǎng)格蛋白包被小窩與質(zhì)膜分開[8]。為深入研究Dnm1在內(nèi)耳的功能及其調(diào)控機(jī)制,我們采用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),尋找可能參與Dnm1,miR-30b,miR-140調(diào)控的lncRNA。轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的迅速發(fā)展使得轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究取得了空前的突破,用于發(fā)現(xiàn)和表征各種新的RNA分子,包括microRNAs,內(nèi)源性siRNAs,circRNAs及l(fā)ncRNA[8]。從結(jié)構(gòu)上看,lncRNA與mRNA非常相似,具有剪接、聚腺苷酸化和帽狀結(jié)構(gòu),但是它們不是編碼RNA,不能翻譯成蛋白質(zhì)。越來越多的研究表明lncRNA與多種器官及疾病如心臟[27]和眼睛[28],癌癥[29]等有關(guān),在細(xì)胞發(fā)育、分化、增殖、遷移、轉(zhuǎn)移等多種生理過程中發(fā)揮重要作用[30]。lncRNA對神經(jīng)系統(tǒng)的影響也得到了廣泛的研究,lncRNA在發(fā)育階段和成年的大腦中高表達(dá),可影響神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育過程,如神經(jīng)發(fā)生、突觸發(fā)生、細(xì)胞遷移、細(xì)胞類型分化、神經(jīng)突生長、突觸可塑性等[31]。在時空上,lncRNA在特定位點(diǎn)(

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號:3629844

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