目的應(yīng)用公開數(shù)據(jù)庫(kù)尋找可能與梅尼埃�。∕eniere’s disease, MD）發(fā)病機(jī)制相關(guān)的基因和分子途徑,以及篩選MD潛在治療藥物。方法通過(guò)Gene Expression Omnibus（GEO）數(shù)據(jù)庫(kù)獲取GSE109558數(shù)據(jù)集,篩選MD與正常樣本間外周單核細(xì)胞的差異表達(dá)基因,并進(jìn)行功能注釋、通路分析和蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用PPI（Proteinprotein interaction, PPI）網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建。最后應(yīng)用Connectivity map（cMAP）數(shù)據(jù)庫(kù)篩選潛在治療MD的小分子藥物。結(jié)果差異表達(dá)基因顯著富集在對(duì)病毒的反應(yīng)、防御反應(yīng)、趨化、MHC II類蛋白結(jié)合等生物過(guò)程,以及Influenza A和Herpes simplex infection信號(hào)通路。網(wǎng)絡(luò)分析發(fā)現(xiàn)一些核心基因,如CXCL10、IFI44L。篩選出33個(gè)治療MD的候選小分子藥物,如賴諾普利、柚皮素等。結(jié)論 MD可能具有自身炎癥性內(nèi)耳疾病,外周單核細(xì)胞中CXCL10、IFI44L、IFI44、XAF1、OAS2、HERC5、EIF2AK2表達(dá)水平的升高和POTEE表達(dá)水平的降低可能與MD發(fā)病機(jī)制有關(guān)。篩... 

【文章來(lái)源】：中華耳科學(xué)雜志. 2020,18(04)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【部分圖文】：

Influenza A信號(hào)傳導(dǎo)通路示意圖（標(biāo)注五星的位置為本研究中蛋白）

Herpes simplex infection信號(hào)傳導(dǎo)通路示意圖（標(biāo)注五星的位置為本研究中蛋白）

從STRING數(shù)據(jù)庫(kù)獲取得分≥0.4的PPI數(shù)據(jù)，利用Cytoscape3.7可視化分析顯示，該網(wǎng)絡(luò)由21個(gè)節(jié)點(diǎn)和35個(gè)邊緣組成（如圖3）。用插件CentiScaPe計(jì)算節(jié)點(diǎn)度，根據(jù)節(jié)點(diǎn)度≥5獲得8個(gè)關(guān)鍵基因，分別為CXCL10(CXC趨化因子配體10）、IFI44L、POTEE(POTE錨蛋白結(jié)構(gòu)域家族成員E）、IFI44（干擾素誘導(dǎo)蛋白44）、XAF1(X染色體連鎖凋亡抑制蛋白相關(guān)因子1）、OAS2(2′,5′-寡聚腺苷酸合成酶）、HERC5(HECT類E3連接酶5）、EIF2AK2（蛋白激酶PKR）（如表2）。2.4 藥物篩選

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]柚皮素:新一代免疫調(diào)節(jié)劑[J]. 曾文峰,張發(fā)云,杜剛軍,金凌濤,秦蕾,董文娟,張超,王洛洋,尹曉哲,張春玲,梁偉.  生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2018(09)
[2]活血通絡(luò)清腦方聯(lián)合阿司匹林治療短暫性腦缺血發(fā)作性眩暈效果分析[J]. 李恒,歐陽(yáng)福,李湘海,師國(guó)軍.  山東醫(yī)藥. 2018(02)
[3]梅尼埃病的基因?qū)W研究新進(jìn)展[J]. 徐舒舒,袁進(jìn),趙洪春,王延飛.  中華耳科學(xué)雜志. 2017(05)
[4]反復(fù)發(fā)作性眩暈豚鼠前庭內(nèi)側(cè)核毒蕈堿受體M2、M3表達(dá)的研究[J]. 饒秀麗,尹時(shí)華,侯濤,朱子昂,龍吉.  中華耳科學(xué)雜志. 2016(05)
[5]梅尼埃病的基因研究進(jìn)展[J]. 王家莉,王武慶.  中華耳科學(xué)雜志. 2016(04)
[6]類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎患者血清C-X-C配體10與疾病的相關(guān)性[J]. 教婷,張寧.  中國(guó)醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(11)
[7]系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者血清中趨化因子CXCL9,CXCL10及CXCL11的檢測(cè)[J]. 王倩,劉偉,盧葳,胡靜,張麗霞,段西凌.  中國(guó)皮膚性病學(xué)雜志. 2015(02)

碩士論文
[1]基于RNA-seq技術(shù)的散發(fā)性梅尼埃病患者外周血單核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究[D]. 孫瑩.山東大學(xué) 2018



本文編號(hào)：3251094