目的:探討膽總管結(jié)石患者膽道菌群的結(jié)構(gòu)組成、多樣性及其與膽總管結(jié)石復(fù)發(fā)的關(guān)系。方法:選取2018年9月至2018年11月因膽總管結(jié)石在蘭州大學(xué)第一醫(yī)院ERCP診療中心接受ERCP手術(shù)治療的患者23例,其中初發(fā)性膽總管結(jié)石患者14例,復(fù)發(fā)性膽總管結(jié)石患者9例。收集所有患者的基本資料、病史資料以及術(shù)前檢驗(yàn)結(jié)果,并于ERCP術(shù)中采集膽總管膽汁樣本。提取所有樣本的微生物DNA,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,采用16S rDNA高通量測序技術(shù)進(jìn)行測序分析,鑒定細(xì)菌OTU。通過物種分類注釋,揭示膽總管結(jié)石患者膽道菌群的結(jié)構(gòu)組成及其多樣性,對比分析復(fù)發(fā)性與初發(fā)性膽總管結(jié)石患者膽道菌群的差異。結(jié)果:膽總管結(jié)石患者膽總管膽汁中細(xì)菌DNA檢出率為100%。研究共獲得579 599個高質(zhì)量tags,平均每個樣本25 200±11 429個tags,其中初發(fā)性膽總管結(jié)石獲得325 559個tags,復(fù)發(fā)性膽總管結(jié)石獲得個254 040個tags。經(jīng)鑒定獲得1075個細(xì)菌OTUs,平均每個樣本191±66個OTUs,其中初發(fā)性膽總管結(jié)石獲得830個OTUs,復(fù)發(fā)性膽總管結(jié)石獲得824個OTUs。依據(jù)物種分類注釋結(jié)果,所有OT... 

【文章來源】：蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：61 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

所有樣本序列長度分布

位論文 膽總管結(jié)石患者其與膽總管結(jié)石續(xù)表 2.2 所有樣本測序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)w Tags Raw Bases Valid Tags Valid Bases(M315 18.25M 29726 12.32 957 16.83M 24956 9.99 512 17.16M 27718 11.49 067 10.88M 17458 7.23 345 14.05M 22791 9.45 528 9.95M 13874 5.65 803 10.12M 16457 6.84

圖 2.2 兩組樣本 α 多樣性指數(shù)比較（Chao l 和 Shannon 指數(shù)）圖 2.3 各樣本及組間比較的稀釋曲線（Observed species 指數(shù)）。橫坐標(biāo)表示隨機(jī)抽取的序列數(shù)，縱坐標(biāo)表示與之對應(yīng)的 OTU 數(shù)，用以反映測序深度。

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本文編號：3534919