目的:通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)高通量測序方法,探索骨組織的差異基因表達(dá)在股骨頭缺血性壞死的發(fā)生發(fā)展過程中的分子機(jī)制及預(yù)測股骨頭壞死的診療相關(guān)的生物標(biāo)志物。方法:（1）以骨組織為研究對象,分別選取5例股骨頭壞死患者的壞死區(qū)骨組織（ONBT）和相對正常區(qū)骨組織（ANBT）,以及5例股骨頸骨折患者骨組織（對照組）,利用高通量轉(zhuǎn)錄組測序篩選差異表達(dá)基因;（2）利用生物信息學(xué)軟件分析、預(yù)測可能參與ONFH發(fā)生發(fā)展的生物過程及信號通路;（3）利用QPCR、WB對篩選的差異表達(dá)基因進(jìn)行驗證;（4）利用預(yù)測軟件及ChIP技術(shù)檢測HIF-1α對差異表達(dá)基因的調(diào)控作用。結(jié)果:（1）高通量測序發(fā)現(xiàn)與對照組相比,壞死區(qū)骨組織中存在2297個差異基因（1032個基因上調(diào),1265個基因下調(diào)）,患者的相對正常區(qū)骨組織存在1523個差異基因（744個基因上調(diào)799個基因下調(diào)）;（2）差異表達(dá)基因在GO分析中主要富集于細(xì)胞外基質(zhì)組織、細(xì)胞外結(jié)構(gòu)組織等。差異基因KEGG分析主要富集于ECM受體相互作用、PPARs信號通路。其中脂質(zhì)運載蛋白2（LCN2）、過氧化物酶體增殖物激活受體γ（PPARγ）在壞死患者骨組織的表達(dá)顯著降低;（3... 

【文章來源】：重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市

【文章頁數(shù)】：58 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

壞死組和對照組的股骨頭樣本圖片

28 1B 股骨頭樣本 HE 染色的病理切片（▲代表骨小梁組織中的空骨陷窩，●代表壞死的組織）Figure 1B：Histological sections of bone tissues from femur fracture (control),ANBT anNBT patients, stained with hematoxylin and eosin. ( ▲Triangle indicate empty lacunae inbone trabecula ●Circles show necrotic mesenchyme tissue.)

DEFA1 -9.582554451 1.72E-06 0.00015366 下調(diào)PRG3 -9.324250806 3.74E-05 0.001849214 下調(diào)MS4A3 -9.066054183 4.91E-06 0.000346429 下調(diào)LCN2 -8.788114163 6.02E-08 8.38E-06 下調(diào)PRTN3 -8.69300922 1.78E-07 2.17E-05 下調(diào)EPYC 8.341951415 6.43E-05 0.002825459 上調(diào)OGN 8.25867374 2.58E-29 2.07E-25 上調(diào)CEACAM6 -8.234356408 1.09E-05 0.000671281 下調(diào)CEACAM8 -8.098070419 4.21E-05 0.002011392 下調(diào)MPO -8.055323745 1.63E-08 2.61E-06 下調(diào)CAMP -7.990918276 1.41E-08 2.30E-06 下調(diào)CLC -7.685671519 0.000331214 0.009755644 下調(diào)


本文編號：3363444