骨肉瘤中APC基因突變及其與臨床病理因素的相關(guān)性研究
發(fā)布時(shí)間:2021-08-15 13:16
【目的】本研究旨在檢測(cè)骨肉瘤組織中APC基因突變情況,分析APC基因突變與骨肉瘤患者的臨床病理特征及預(yù)后的相關(guān)性。評(píng)價(jià)其對(duì)骨肉瘤的診斷價(jià)值;是否可以作為骨肉瘤預(yù)后分子標(biāo)志物,以期尋找出有助于準(zhǔn)確評(píng)估并改善患者預(yù)后的基因靶點(diǎn),為骨肉瘤的預(yù)后評(píng)估及治療探索新的途徑!痉椒ā渴褂肐on Torrent測(cè)序技術(shù)檢測(cè)30例骨肉瘤組織及10例骨軟骨瘤組織APC基因突變;分析工具是由Life Technologies公司的提供的PGM服務(wù)器測(cè)序分析一體的工具分析進(jìn)行數(shù)據(jù)分析;由PGM服務(wù)器ampliseq官方軟件處理,進(jìn)行SNV及InDel檢測(cè)得到vcf結(jié)果文件,經(jīng)過(guò)文本處理和annovar軟件注釋后得到最終的結(jié)果文件;應(yīng)用卡方檢驗(yàn)(Fisher確切概率)分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果,探討基因APC基因突變情況與骨肉瘤患者的性別、年齡、腫瘤部位、病理類(lèi)型、肺部轉(zhuǎn)移、臨床分期、病理性骨折、堿性磷酸酶水平、復(fù)發(fā)以及生存狀態(tài)等因素的關(guān)系,采用Kaplan-Meier及l(fā)og-rank檢驗(yàn)分析APC基因突變情況與5年總體生存期的關(guān)系,并應(yīng)用GraphPad Prism6.0軟件作生存函數(shù)曲線(xiàn)圖!窘Y(jié)果】1.30例骨肉瘤組織...
【文章來(lái)源】:安徽醫(yī)科大學(xué)安徽省
【文章頁(yè)數(shù)】:61 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中英文縮略詞簡(jiǎn)表
中文摘要
Abstract
1.引言
1.1 骨肉瘤研究背景
1.2 APC研究背景
1.3 Ion Torrent測(cè)序研究背景
1.4 課題的主要內(nèi)容及研究意義
2.材料與方法
2.1 材料
2.1.1 研究對(duì)象
2.1.2 隨訪(fǎng)
2.1.3 倫理
2.2 實(shí)驗(yàn)試劑與儀器
2.2.1 主要試劑
2.2.2 主要儀器
2.3 基于Ion Torrent檢測(cè)實(shí)驗(yàn)步驟與方法
2.3.1 冰凍組織樣本DNA的提取
2.3.2 文庫(kù)構(gòu)建
2.3.3 測(cè)序模板的制備與富集
2.3.4 Ion Torrent測(cè)序
2.3.5 測(cè)序結(jié)果的數(shù)據(jù)分析方法
2.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
3.結(jié)果
3.1 基于Ion Torrent測(cè)序的相關(guān)數(shù)據(jù)結(jié)果
3.1.1 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)控結(jié)果
3.1.2 基因組對(duì)比
3.1.3 APC基因測(cè)序結(jié)果
3.2 APC基因突變與骨肉瘤患者臨床病理因素的關(guān)系
3.3 APC基因突變與患者生存狀態(tài)的關(guān)系
3.4 APC基因各突變位點(diǎn)與患者5年總體生存期的關(guān)系
4.討論
5.結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
綜述
參考文獻(xiàn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]86例常見(jiàn)惡性腫瘤患者腫瘤內(nèi)科治療規(guī)范化程度回顧性調(diào)查分析[J]. 劉敏,李敏,劉東利. 心理月刊. 2018(07)
[2]地西他濱誘導(dǎo)宮頸癌細(xì)胞凋亡分子機(jī)制探討[J]. 宋汶珂,唐彩霞,黃彤輝,孫曉紅. 中華腫瘤防治雜志. 2017(08)
[3]宮頸癌組織中APC、E-cadherin、ASC及FHIT基因啟動(dòng)子區(qū)域甲基化觀察[J]. 王淑琴,黃利鳴,錢(qián)洪鑫,李紅月. 山東醫(yī)藥. 2016(07)
[4]骨肉瘤相關(guān)基因的研究[J]. 于洪文,麥威,宋春雨,魏天犁,包俊杰,曲國(guó)蕃. 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2015(05)
[5]APC基因表達(dá)和甲基化與HPV感染在子宮頸癌及癌前病變中的相關(guān)性研究[J]. 任念,訾聃,楊英捷. 貴州醫(yī)藥. 2013(05)
[6]APC與Wnt/β-catenin信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑[J]. 王健楠,王文,鄭夢(mèng)夢(mèng). 醫(yī)學(xué)信息(上旬刊). 2010(06)
[7]APC的結(jié)構(gòu)與功能的研究進(jìn)展[J]. 肖忠盛,梁慶模. 現(xiàn)代醫(yī)藥衛(wèi)生. 2010(04)
[8]pCS2-MT/Axin及pEGFP-N3/APC重組質(zhì)粒在結(jié)腸癌細(xì)胞系SW480中的表達(dá)[J]. 徐玫麗,霍繼榮,呂梁. 中國(guó)現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志. 2009(08)
[9]β-catenin和APC蛋白在子宮內(nèi)膜腺癌中的表達(dá)及意義[J]. 周留林,楊繼實(shí),陳友國(guó),朱正龍. 實(shí)用臨床醫(yī)藥雜志. 2008(12)
[10]APC在腸上皮穩(wěn)態(tài)及腫瘤中的作用[J]. 周曉霞,楊瑩,付賀飛. 中國(guó)實(shí)用醫(yī)藥. 2008(23)
本文編號(hào):3344623
【文章來(lái)源】:安徽醫(yī)科大學(xué)安徽省
【文章頁(yè)數(shù)】:61 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中英文縮略詞簡(jiǎn)表
中文摘要
Abstract
1.引言
1.1 骨肉瘤研究背景
1.2 APC研究背景
1.3 Ion Torrent測(cè)序研究背景
1.4 課題的主要內(nèi)容及研究意義
2.材料與方法
2.1 材料
2.1.1 研究對(duì)象
2.1.2 隨訪(fǎng)
2.1.3 倫理
2.2 實(shí)驗(yàn)試劑與儀器
2.2.1 主要試劑
2.2.2 主要儀器
2.3 基于Ion Torrent檢測(cè)實(shí)驗(yàn)步驟與方法
2.3.1 冰凍組織樣本DNA的提取
2.3.2 文庫(kù)構(gòu)建
2.3.3 測(cè)序模板的制備與富集
2.3.4 Ion Torrent測(cè)序
2.3.5 測(cè)序結(jié)果的數(shù)據(jù)分析方法
2.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
3.結(jié)果
3.1 基于Ion Torrent測(cè)序的相關(guān)數(shù)據(jù)結(jié)果
3.1.1 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)控結(jié)果
3.1.2 基因組對(duì)比
3.1.3 APC基因測(cè)序結(jié)果
3.2 APC基因突變與骨肉瘤患者臨床病理因素的關(guān)系
3.3 APC基因突變與患者生存狀態(tài)的關(guān)系
3.4 APC基因各突變位點(diǎn)與患者5年總體生存期的關(guān)系
4.討論
5.結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
綜述
參考文獻(xiàn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]86例常見(jiàn)惡性腫瘤患者腫瘤內(nèi)科治療規(guī)范化程度回顧性調(diào)查分析[J]. 劉敏,李敏,劉東利. 心理月刊. 2018(07)
[2]地西他濱誘導(dǎo)宮頸癌細(xì)胞凋亡分子機(jī)制探討[J]. 宋汶珂,唐彩霞,黃彤輝,孫曉紅. 中華腫瘤防治雜志. 2017(08)
[3]宮頸癌組織中APC、E-cadherin、ASC及FHIT基因啟動(dòng)子區(qū)域甲基化觀察[J]. 王淑琴,黃利鳴,錢(qián)洪鑫,李紅月. 山東醫(yī)藥. 2016(07)
[4]骨肉瘤相關(guān)基因的研究[J]. 于洪文,麥威,宋春雨,魏天犁,包俊杰,曲國(guó)蕃. 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2015(05)
[5]APC基因表達(dá)和甲基化與HPV感染在子宮頸癌及癌前病變中的相關(guān)性研究[J]. 任念,訾聃,楊英捷. 貴州醫(yī)藥. 2013(05)
[6]APC與Wnt/β-catenin信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑[J]. 王健楠,王文,鄭夢(mèng)夢(mèng). 醫(yī)學(xué)信息(上旬刊). 2010(06)
[7]APC的結(jié)構(gòu)與功能的研究進(jìn)展[J]. 肖忠盛,梁慶模. 現(xiàn)代醫(yī)藥衛(wèi)生. 2010(04)
[8]pCS2-MT/Axin及pEGFP-N3/APC重組質(zhì)粒在結(jié)腸癌細(xì)胞系SW480中的表達(dá)[J]. 徐玫麗,霍繼榮,呂梁. 中國(guó)現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志. 2009(08)
[9]β-catenin和APC蛋白在子宮內(nèi)膜腺癌中的表達(dá)及意義[J]. 周留林,楊繼實(shí),陳友國(guó),朱正龍. 實(shí)用臨床醫(yī)藥雜志. 2008(12)
[10]APC在腸上皮穩(wěn)態(tài)及腫瘤中的作用[J]. 周曉霞,楊瑩,付賀飛. 中國(guó)實(shí)用醫(yī)藥. 2008(23)
本文編號(hào):3344623
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