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黃韌帶骨化過(guò)程中ncRNA與mRNA的交互作用網(wǎng)絡(luò)及miR-342-3p促成骨分化的作用機(jī)制

發(fā)布時(shí)間:2021-04-16 08:21
  已有研究表明非編碼RNA可參與多種生理病理過(guò)程,其在疾病的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用。黃韌帶骨化癥及骨質(zhì)疏松癥是常見的慢性骨科疾病,如不能得到及時(shí)的診斷和治療,將嚴(yán)重影響患者的生存質(zhì)量。目前,鮮有報(bào)道非編碼RNA在黃韌帶骨化癥或骨質(zhì)疏松癥中的功能及機(jī)制。本研究旨在通過(guò)基因芯片或測(cè)序篩選出骨化黃韌帶組織(Ossification of ligamentum flavum,OLF)中顯著差異表達(dá)的m RNA、lnc RNA、mi RNA及circ RNA,并對(duì)差異RNA進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析及功能探究;同時(shí)明確mi R-342-3p在成骨分化中的功能及機(jī)制,為黃韌帶骨化和骨質(zhì)疏松癥的診斷和治療提供新思路。方法:1.標(biāo)本采集:收集術(shù)中取出的新鮮骨化的黃韌帶組織和正常黃韌帶組織。用液氮研磨法快速提取組織樣本RNA,并通過(guò)RNA電泳和2100質(zhì)量檢測(cè)法進(jìn)行檢測(cè)。從中分別選4個(gè)合格的正常黃韌帶組織和4個(gè)合格的骨化黃韌帶組織的RNA進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)。2.篩選OLF中差異表達(dá)的m RNA:通過(guò)基因芯片分析,OLF與正常黃韌帶組織(ligamentum flavum,LF)相比,篩選出差異倍數(shù)>2,p<0.05... 

【文章來(lái)源】:天津醫(yī)科大學(xué)天津市 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】:129 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

黃韌帶骨化過(guò)程中ncRNA與mRNA的交互作用網(wǎng)絡(luò)及miR-342-3p促成骨分化的作用機(jī)制


骨化黃韌帶組織中差異mRNAs的表達(dá)譜

黃韌帶骨化過(guò)程中ncRNA與mRNA的交互作用網(wǎng)絡(luò)及miR-342-3p促成骨分化的作用機(jī)制


OLF中差異mRNAs的GO和KEGG分析

表達(dá)譜,黃韌帶,驗(yàn)證結(jié)果,芯片


在擴(kuò)大樣本中,進(jìn)一步 qPCR 驗(yàn)證。上述 10 個(gè)差異 lncRNAs 在芯片結(jié)果中的差異如表 1.2,qPCR 驗(yàn)證結(jié)果如圖1.3 B,結(jié)果表明驗(yàn)證結(jié)果與芯片結(jié)果一致,說(shuō)明芯片結(jié)果可信。進(jìn)一步對(duì)差異 lncRNA 種類進(jìn)行分析,結(jié)果如圖 1.3 C 所示,intergeniclncRNA 占總差異 lncRNAs 的 62.45%、intronic antisense 占 13.28%、naturalantisense 占 11.38%、bidirectional 占 6.16%、intron sense-overlapping 占 4.95%及exon sense-overlapping 占 1.79%。根據(jù)不同長(zhǎng)度,對(duì)差異 lncRNA 進(jìn)行分類,結(jié)果如圖 1.3 D 所示,差異 lncRNA 主要集中在 200 至 1000bp 之間。已有研究表明,染色質(zhì)分布失衡與多種疾病相關(guān)[53]。我們依據(jù)每條染色體上差異 lncRNA和 mRNA 的數(shù)目對(duì)相應(yīng)染色體的長(zhǎng)度分別做標(biāo)準(zhǔn)化后

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Culture conditions for equine bone marrow mesenchymal stem cells and expression of key transcription factors during their differentiation into osteoblasts[J]. Elizabeth R A Glynn,Alfredo Sanchez Londono,Steven A Zinn,Thomas A Hoagl,Kristen E Govoni.  Journal of Animal Science and Biotechnology. 2014(02)
[2]Mesenchymal stem cells: Molecular characteristics and clinical applications[J]. Farbod Rastegar,Deana Shenaq,Eric R Wagner,Stephanie H Kim,Russell R Reid,Hue H Luu,Rex C Haydon.  World Journal of Stem Cells. 2010(04)



本文編號(hào):3141080

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