[目的]采用高通量RNA測序（RNA-seq）技術(shù),檢測成人退變性脊柱側(cè)凸（ADS）、腰椎間盤突出癥（LDH）和健康成人（Normal）的長鏈非編碼RNA（lncRNA）基因表達(dá)譜,對照分析成人退變性脊柱側(cè)凸的lncRNA差異基因表達(dá)譜,探尋成人退變性脊柱側(cè)凸的lncRNA可能關(guān)鍵差異表達(dá)基因及相關(guān)分子功能和生物學(xué)信號通路,為進(jìn)一步研究成人退變性脊柱側(cè)凸的發(fā)生發(fā)展機(jī)制及開發(fā)特定的分子生物標(biāo)志物和精準(zhǔn)靶向治療提供理論基礎(chǔ)。[方法]1.采用高通量RNA測序（RNA-Seq）技術(shù),對通過倫理審核后采取的ADS組（n=3）、LDH組（n=3）、Normal組（n=3）三組共九個外周全血樣本進(jìn)行l(wèi)ncRNA測序。將上述三組樣本測序結(jié)果分別進(jìn)行兩兩組間比較,然后將上述三組兩兩組間比較結(jié)果及ADS_vs_Normal和ADS_vs_LDH兩組組間比較結(jié)果利用維恩圖描繪交集,篩選共同差異表達(dá)基因,以描繪ADS的差異基因表達(dá)譜,最終篩選ADS可能的關(guān)鍵差異表達(dá)基因。2.對篩選出的ADS差異表達(dá)基因進(jìn)行進(jìn)一步的生物信息學(xué)分析,... 

【文章來源】：昆明醫(yī)科大學(xué)云南省

【文章頁數(shù)】：64 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１?ＬｎｃＲＮＡ篩選統(tǒng)計圖??３．２編碼潛能篩選維恩圖??

圖２篩選結(jié)果維恩圖??

ＦＰＫＭ?ｄｅｎｓｉｔｙ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ??１．５?ｉ??ｌ?Ｇｒｏｕｐ??？＾１．０－?＼?Ｎｏｒｍａｌ??Ｉ?＼?部ＨＳ??－Ｖ??０．０－：??＾?ｌｏｇ，〇＜ＦＰＫＭ＋”“??圖５：?ＦＰＫＭ密度分布圖??注：由圖４、５可以看出，Ｎｏｒｍａｌ、ＬＤＨ、ＡＤＳ三組ＩｎｃＲＮＡ表達(dá)水平差異??不大。??４．４樣品間表達(dá)相關(guān)性檢查??相關(guān)系數(shù)越接近１，表明樣品之間表達(dá)模式的相似度越高。檢查結(jié)果如圖６??所示：??Ｐｅａｒｓｏｎ?ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏ門?ｂｅｔｗｅｅｎ?ｓａｍｐｌｅｓ??Ｎｏｒｍａｌ?３－?０．８１９?０．８１６?０．７７１?０．８１６?０，８３１?０．８２５?０．８１?０．８２３｜?１??Ｎｏｒｍａｌ?２－?０．８０８?０．７９６?０．７６?０．８３３?０．８２１?０．８０３?０．７９３１?１?Ｉ０－８２３??Ｎｏｒｍａｌ?１?－?０．８２?０．８１７?０．７３１?０．７７６?０．８２１?０．８２?１?１?０．７９３?０．８１??ＬＤＨ＿３－?０．８２４?０．８２６?０．７４４?０．７９８?０．８２９?０．８２?０．８０３?０．８２５?＿?１０??ＬＤＨ?２－?０．８３２?０．８１８?０．７４６?０．８１?丨?１?０．８２９?０．８２１?０．８２１?０．８３１?０?９??ＬＤＨ—ｉ?０．７９７?０．７７７?０．７６３?｜?１?０．８１?０．７９８?０．７７６?０．８３３?０．８１６?°＇８??ＡＤＳ＿３?－?０．７２６?０．７５４?Ｉ?１?Ｉ?０．７６３?０．７４６?０．７４４?０．７３１?０．７６?０．７７１??ＡＤＳ?２?０．８１７?１?Ｉ?０．７５４?０．７

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Noncoding RNAs in cancer and cancer stem cells[J]. Tianzhi Huang,Angel Alvarez,Bo Hu,Shi-Yuan Cheng.  Chinese Journal of Cancer. 2013(11)



本文編號：3064117