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寬泛圍PCR和宏基因組二代測序方法在人工關(guān)節(jié)感染微生物診斷中的應(yīng)用

發(fā)布時間:2021-02-16 00:46
  人工關(guān)節(jié)感染(PJI)是人工關(guān)節(jié)置換術(shù)后最嚴(yán)重的并發(fā)癥之一,PJI需要多次手術(shù)和長時間抗生素治療,給患者和社會帶來嚴(yán)重負(fù)擔(dān)。及時、準(zhǔn)確的微生物診斷是PJI治療成功的關(guān)鍵。由于微生物在假體表面形成生物膜、浮游菌量少、微生物培養(yǎng)困難以及采樣使用抗生素等原因,傳統(tǒng)的微生物培養(yǎng)方法對病原微生物檢出的陽性率低,且培養(yǎng)時間較長。臨床常用的廣譜的微生物分子診斷方法包括寬泛圍PCR(BR-PCR)和宏基因組二代測序(mNGS),可不依賴培養(yǎng)、快速檢出PJI標(biāo)本中的病原微生物。這兩種方法對關(guān)節(jié)液、假體周圍組織及超聲裂解液中病原微生物檢出能力以及對PJI的診斷價值如何仍未明確。第一章寬泛圍PCR方法對人工關(guān)節(jié)感染的微生物診斷價值【目的】研究寬泛圍PCR(BR-PCR)方法對人工關(guān)節(jié)感染(PJI)患者關(guān)節(jié)液、假體周圍組織和超聲裂解液標(biāo)本中的病原菌檢出能力和對PJI的診斷價值!痉椒ā炕仡櫺约{入人工關(guān)節(jié)翻修患者67例,分為PJI組和無菌性失。ˋF)組。采樣前均停用抗生素2周以上,每例患者均采集關(guān)節(jié)液、假體周圍組織以及取出的假體的超聲裂解液,所有標(biāo)本類型均分別行微生物培養(yǎng)和BR-PCR,BRPCR擴增產(chǎn)物使用... 

【文章來源】:福建醫(yī)科大學(xué)福建省

【文章頁數(shù)】:119 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

寬泛圍PCR和宏基因組二代測序方法在人工關(guān)節(jié)感染微生物診斷中的應(yīng)用


超聲裂解過程示意圖

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20ABCDEF圖1.1超聲裂解過程示意圖。圖A取出的假體放入無菌可密封盒中,滅菌生理鹽水沒過假體表面;圖B密封盒置于振蕩儀上振蕩,間歇性轉(zhuǎn)動方向;圖C密封盒置于超聲清洗機的水浴槽內(nèi)行超聲裂解,間歇性轉(zhuǎn)動方向;圖D取超聲裂解液離心后,棄上清取沉渣液;圖E沉渣液行血平板培養(yǎng);圖F沉渣液行血培養(yǎng)瓶培養(yǎng)3.2微生物培養(yǎng)與鑒定液體標(biāo)本(關(guān)節(jié)液、超聲裂解液)取0.1ml使用血平板在培養(yǎng)箱行需氧和厭氧培養(yǎng)(35-37°C,5-7%CO2),需氧培養(yǎng)5-6天,厭氧培養(yǎng)10-14天(每日觀測,培養(yǎng)陽性即停止)。余下的標(biāo)本依次打入BD厭氧瓶、需氧瓶,在BD自動培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)(35-37°C,5-7%CO2,需氧培養(yǎng)5-6天,厭氧培養(yǎng)10-14天),報警后取出肉湯在血平板次代培養(yǎng)。假體周圍組織剪碎并加入肉湯研磨后涂片行需氧菌、厭氧菌培養(yǎng),培養(yǎng)條件與液體標(biāo)本相同。使用MALDI-TOF質(zhì)譜和VITEKII生化鑒定系統(tǒng)行微生物種屬和藥敏鑒定。血平板或血培養(yǎng)瓶培養(yǎng)陽性定義為:2份以上關(guān)節(jié)液或組織培養(yǎng)出相同微生物;超聲裂解液培養(yǎng)陽性定義為:培養(yǎng)出如金黃色葡萄球菌、大腸埃希菌、鏈球菌屬等高

分析圖,分析圖,凝膠電泳


PCR擴增產(chǎn)物凝膠電泳分析圖

【參考文獻】:
期刊論文
[1]二代測序技術(shù)在人工關(guān)節(jié)感染關(guān)節(jié)液病原菌檢測中的應(yīng)用[J]. 王啟金,黃子達,方心俞,白國昌,李孟慶,張澤宇,李文波,張文明.  中華骨科雜志. 2018 (11)
[2]人工關(guān)節(jié)假體周圍感染的微生物學(xué)分析[J]. 邵宏翊,郭宇,周一新,鄭漢龍.  骨科臨床與研究雜志. 2017(04)
[3]髖關(guān)節(jié)置換術(shù)后感染的微生物特點及藥敏分析[J]. 孫長鮫,周勇剛,柴偉,王巖.  中華醫(yī)學(xué)雜志. 2014 (21)
[4]超聲裂解在人工關(guān)節(jié)置換術(shù)后假體周圍感染診斷中的作用[J]. 白國昌,曾慧意,李文波,黃子達,楊濱,林建華,張怡元,李煒明,王武煉,張文明.  中華骨科雜志. 2014 (06)
[5]膝關(guān)節(jié)置換術(shù)后感染病原菌分布及耐藥性分析[J]. 賀占坤,楊勇,許丹,沈杰威.  中華醫(yī)院感染學(xué)雜志. 2014(01)



本文編號:3035830

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