背景:骨肉瘤（osteosarcoma）是好發(fā)于青少年的原發(fā)性骨惡性腫瘤中最多見的一種,是從間質(zhì)細(xì)胞系發(fā)展而來,生存率低下,臨床表現(xiàn)為:全身狀況較差,有發(fā)熱、不適、體重下降、貧血以至器官衰竭等明顯的表現(xiàn),治療效果不理想;個(gè)別病例腫瘤增長很快,早期可能發(fā)生肺部轉(zhuǎn)移,會(huì)導(dǎo)致全身狀況惡化,即使行截肢及化療后仍有約40%患者會(huì)死于腫瘤肺轉(zhuǎn)移。大量研究發(fā)現(xiàn),80-9O%的患者確診前已經(jīng)發(fā)生了全身的微病灶轉(zhuǎn)移,其中,上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化（Epithelial-mesenchymal transition,EMT）可以通過影響多種基因及通路來影響多種腫瘤的侵襲和轉(zhuǎn)移,骨肉瘤細(xì)胞作為骨腫瘤中轉(zhuǎn)移性較強(qiáng)的一種,其轉(zhuǎn)移性與EMT的關(guān)系密切相關(guān)。但是至今還未發(fā)現(xiàn)癌癥轉(zhuǎn)移的具體機(jī)制,基于大數(shù)據(jù)生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),基質(zhì)金屬蛋白酶家族（matrix mettalloproteinases,MMPs）是細(xì)胞外基質(zhì)降解的主要酶類,與腫瘤的浸潤、轉(zhuǎn)移及預(yù)后密切相關(guān)。MMP13是MMPs家族的重要成員之一,它是診斷乳腺癌特異性最高的基因之一,在細(xì)胞外基質(zhì)的降解、賦予癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移潛能等方面有重要作用,而在骨肉瘤中MMP13的表達(dá)情... 

【文章來源】：南華大學(xué)湖南省

【文章頁數(shù)】：57 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

火山圖顯示GSE12865和GSE16088數(shù)據(jù)集中的基因差異性表達(dá)

南華大學(xué)碩士學(xué)位論文圖4.2韋恩圖顯示GSE12865和GSE16088數(shù)據(jù)集中的共表達(dá)差異基因（P<0.05&|FDR|>2）表1.韋恩圖篩選的差異表達(dá)基因基因表達(dá)變化基因名稱上調(diào)MMP13CD36LEF1SATB2OMDSPP1CD93MCAMDOCK4PTCH1IBSPGPC4DPTPTPRDMS4A4AIFI44LZEB2HEY1CADM1CA3PTBP2CPEPLEKHA5ALPLMEF2CMMP9下調(diào)CXCL12為了進(jìn)一步驗(yàn)證差異表達(dá)基因在正常組織中的表達(dá)情況，繪制基因熱圖后，發(fā)現(xiàn)這27個(gè)差異表達(dá)基因在正常組織中表達(dá)與骨肉瘤中的表達(dá)情況剛好相反上調(diào)基因下調(diào)基因11

第4章實(shí)驗(yàn)結(jié)果（圖4.3）。這些結(jié)果說明，這27個(gè)差異性表達(dá)基因?qū)侨饬龅陌l(fā)生發(fā)展有著一定的作用。圖4.3基因熱圖顯示正常組織中的27個(gè)差異性表達(dá)基因的表達(dá)情況（P<0.05&|FDR|>2）4.1.2DatabaseforAnnotation,VisualizationandIntegratedDiscovery（DAVID）數(shù)據(jù)庫中27個(gè)差異表達(dá)基因的GO富集分析以及KEGG富集分析通過登錄DAVID數(shù)據(jù)庫（https://david.ncifcrf.gov/）下載27個(gè)差異性表達(dá)基因的GO分析結(jié)果，通過R語言中的ggplot等數(shù)據(jù)包進(jìn)行數(shù)據(jù)分析并實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)結(jié)果分析的可視化，其中差異表達(dá)基因的條形圖如圖所示（圖4.4），其結(jié)果提示，27個(gè)差異表達(dá)基因在生物學(xué)進(jìn)程（BiologicalProcess）中主要富集于biologicaladhesion,developmentalprocess,multicellularorganismalprocess,growth,pigmentation,multi-organismprocess,responsetostimulus,locomotion,reproductiveprocess,reproduction,cellproliferation,cellularcomponentorganizationorbiogenesis,localization,positiveregulationofbiologicalprocess,negativeregulationofbiologicalprocess,immunesystemprocess,signaling,regulationofbiologicalprocess,detoxification,behavior,biologicalregulation,cellkilling,cellularprocess,metabolicprocess。12

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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本文編號：2991172