本文選題：乳腺癌 + DNA損傷修復(fù)通路相關(guān)基因　； 參考：《河北醫(yī)科大學(xué)》2015年博士論文

【摘要】：目的:乳腺癌作為女性中最常見的一種惡性腫瘤,已成為當(dāng)今社會的重大公共衛(wèi)生問題,其發(fā)病率有明顯攀升趨勢,全球乳腺癌的致死率和5年患病率分別為13.7%和33.9%。在我國,乳腺癌已經(jīng)成為女性的第一殺手,其發(fā)病率正以每年3%的速度遞增,且發(fā)病年齡呈年輕化趨勢。業(yè)已證實,乳腺癌發(fā)生具有明顯的家族聚集性和遺傳傾向性。據(jù)報道,一級親屬中有一個乳腺癌患者的子代發(fā)生乳腺癌的相對危險度是一般人群的2倍。目前,乳腺癌的確切病因尚未完全清楚,研究者認為是遺傳與環(huán)境等多因素相互作用的復(fù)雜性狀疾病。大量研究表明DNA損傷修復(fù)在乳腺癌發(fā)生進展中發(fā)揮關(guān)鍵作用。因此,本研究在中國北方漢族女性人群中采用基于通路的病例-對照關(guān)聯(lián)研究方法,闡釋與DNA修復(fù)通路相關(guān)的5個基因及7個常見單核苷酸多態(tài)位點的單獨和聯(lián)合作用與乳腺癌發(fā)病風(fēng)險的關(guān)系,研究有望從遺傳水平上闡釋DNA損傷修復(fù)通路對乳腺癌發(fā)生的預(yù)測及潛在的分子調(diào)控機制。方法:本研究采用以醫(yī)院為基礎(chǔ)的病例-對照關(guān)聯(lián)研究設(shè)計。所有樣本取自承德醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院從2009年9月至2013年5月連續(xù)入選的漢族無血緣關(guān)系的女性散發(fā)型乳腺癌患者作為病例(n=606);同時在醫(yī)院收集經(jīng)過乳腺癌篩查確診無乳腺癌、一級親屬無癌癥病史、且無血緣關(guān)系的漢族健康個體作為對照(n=633)。入選前所有研究對象均接受�？漆t(yī)生的臨床檢查以獲取乳腺癌相關(guān)臨床資料,包括基線年齡、癌癥家族史、月經(jīng)初潮、經(jīng)期狀態(tài)、腫瘤大小(T1到T4)、腫瘤分級(G1到G3)、淋巴結(jié)(陽性或陰性)。本研究通過承德醫(yī)學(xué)院倫理委員會批準,且每位研究對象在研究開始前均已簽署知情同意書。基于已報道的前期研究結(jié)果,本研究以DNA修復(fù)通路基因為基礎(chǔ),主要選取了X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 1(XRCC1)基因(位點:rs1799782和rs25487)、X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 2(XRCC2)基因(位點:rs3218536)、X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 3(XRCC3)基因(位點:rs861539)、xeroderma pigmentosum,complementation group A(XPA)基因(位點:rs1800975)和PEX nuclease multifunctional DNA repair enzyme 1(APEX1)基因(位點:rs1760944和rs1130409)。采用北京天根生物技術(shù)公司生產(chǎn)的TIANamp Blood DNA Kit全血基因組DNA提取試劑盒進行DNA提取和多重聚合酶連接反應(yīng)-連接酶檢測反應(yīng)(PCR LDP)進行基因分型。統(tǒng)計分析采用SAS軟件(8.1版)和STATA軟件(12.0版),以及Haplo.Stats軟件(1.6.11版)、Haploview軟件(4.2版)、表達數(shù)量性狀基因座分析軟件Genevar(3.3.0版)和多因子降維MDR軟件(2.0版)。結(jié)果:本研究共納入1,239例研究對象,包括606例乳腺癌患者作為病例組和633例健康個體作為對照組。全部研究對象為中國漢族女性。病例組(平均年齡54.36歲,標準差12.33)和對照組(平均年齡55.15歲,標準差9.38)的平均年齡相匹配(P0.05)。病例組中10.56%的乳腺癌患者具有癌癥家族史,對照組無癌癥家族史。乳腺癌患者的平均初潮年齡為14.60歲(標準差1.63)。經(jīng)卡方檢驗,所有多態(tài)位點的基因型分布在對照組中符合哈迪-溫伯格平衡(P值0.05)。單位點分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),XRCC1基因rs25487位點的基因型(P0.0005)和等位基因(P值=0.004)頻率在兩組間的分布具有顯著統(tǒng)計學(xué)差異,其中基因型GG、GA和AA的頻率在病例組中分別為52.48%、34.49%和13.04%,在對照組中分別為54.82%、40.13%和5.06%;突變等位基因A在病例組中的頻率顯著高于對照組(30.28%vs.25.12%),且經(jīng)過錯誤檢出率FDR和Bonferroni方法(P值0.05/7,這里7代表7個多態(tài)位點)校正后仍然具有統(tǒng)計學(xué)差異。此外,XPA基因rs1800975位點的基因型AA、AG和GG頻率在病例組中分別為33.17%、44.22%和22.61%,在對照組中分別為24.80%、47.24%和27.96%,且兩組比較具有顯著性統(tǒng)計學(xué)差異(P值=0.003);其突變等位基因A的頻率在對照組中顯著高于病例組(51.58%vs.44.72%,P值=0.001),且經(jīng)過錯誤檢出率FDR和Bonferroni方法校正后具有統(tǒng)計學(xué)意義。本研究所納入的1,239例樣本分別有81.9%和92.8%的把握度檢出XRCC1基因rs25487位點和XPA基因rs1800975位點的等位基因頻率在乳腺癌患者組和對照組間的顯著差異。XRCC1基因rs25487位點在加性模型(校正前:OR=1.29;95%CI:1.08 1.53;P值=0.005;校正后:OR=1.28;95%CI:1.07 1.51;P值=0.006)和隱性模型(校正前:OR=2.86;95%CI:1.81 4.39;P值0.001;校正后:OR=2.82;95%CI:1.84 4.32;P值0.001)下與乳腺癌的發(fā)病風(fēng)險易感強相關(guān),獨立于對混雜危險因素的校正,且經(jīng)錯誤檢出率FDR和Bonferroni方法校正后仍然具有明顯統(tǒng)計學(xué)差異。同樣,對XPA基因rs1800975位點,在加性模型(校正前:OR=0.78;95%CI:0.68 0.92;P值=0.001;校正后:OR=0.77;95%CI:0.67 0.90;P值=0.001)和顯性模型(校正前:OR=0.65;95%CI:0.51 0.83;P值=0.001;校正后:OR=0.66;95%CI:0.52 0.85;P值=0.001)下的預(yù)測經(jīng)錯誤檢出率FDR和Bonferroni方法校正后具有顯著統(tǒng)計學(xué)意義,在隱性模型下具有邊緣統(tǒng)計學(xué)差異(校正前P值=0.040;校正后P值=0.031)。APEX1基因rs1130409位點對乳腺癌發(fā)病風(fēng)險的預(yù)測僅在隱性模型下有顯著統(tǒng)計學(xué)意義(校正前:OR=1.94;95%CI:1.20 3.48;P值=0.006;校正后:OR=1.90;95%CI:1.18 3.07;P值=0.009)。表達數(shù)量性狀基因座e QTL預(yù)測分析發(fā)現(xiàn),XRCC1基因rs25487位點野生純合基因型CC所對應(yīng)的XRCC1基因表達水平略高于突變純合基因型TT(P值=0.0713);APEX1基因rs1760944位點的突變純合基因型TT所對應(yīng)的APEX1基因表達水平略高于野生純合基因型GG(P值=0.079)。基因聯(lián)合分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),最常見的等位基因組合C-G-G-C-G-G G(等位基因依rs1799782、rs25487、rs3218536、rs861539、rs1800975、rs1760944和rs1130409位點的順序排列)的頻率在對照組(6.66%)中顯著高于病例組(2.96%,P值=0.002),且經(jīng)過錯誤檢出率FDR和Bonferroni方法(P值0.05/11,這里11代表符合條件的等位基因組合數(shù)目)校正后仍然具有明顯統(tǒng)計學(xué)差異。多基因交互效應(yīng)分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),單因子最佳多因子降維MDR模型包括XPA基因rs1800975位點,但其交叉驗證一致性較差(n=7);在所有探索的7個模型中,兩因子多因子降維MDR模型具有最高的檢測精度0.654和最大的交叉驗證一致性系數(shù)(n=10),且具有最顯著的統(tǒng)計學(xué)意義(P值=0.001)。結(jié)論:經(jīng)過單位點分析、表達數(shù)量性狀基因座e QTL預(yù)測分析、連鎖不平衡分析、等位基因組合分析及交互效應(yīng)分析,我們的研究結(jié)果表明,XRCC1基因rs25487位點與XPA基因rs1800975位點不僅可獨立預(yù)測乳腺癌的發(fā)病風(fēng)險,而且其交互效應(yīng)在乳腺癌的發(fā)生進展中亦起重要作用。乳腺癌是一種多因素復(fù)雜性狀疾病,進一步的研究需要大量精心設(shè)計的前瞻性研究比較,從而解釋多層次的基因 基因和基因 環(huán)境相互作用,以及需要體外和體內(nèi)研究的進一步驗證,旨在尋求DNA修復(fù)通路基因在在乳腺癌的易感性方面的生物或臨床意義。
[Abstract]:Objective : Breast cancer is the most common malignant tumor in women . It has become a major public health problem in today ' s society . The incidence of breast cancer has been increasing . The incidence of breast cancer has been increasing at 3 % per year . X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 3(XRCC3)鍩哄洜(浣嶇偣:rs861539),xeroderma pigmentosum,complementation group A(XPA)鍩哄洜(浣嶇偣:rs1800975)鍜孭EX nuclease multifunctional DNA repair enzyme 1(APEX1)鍩哄洜(浣嶇偣:rs1760944鍜宺s1130409). 閲囩敤鍖椾含澶╂牴鐢熺墿鎶，

本文編號：1851834