本文關(guān)鍵詞： 發(fā)育性髖關(guān)節(jié)發(fā)育不良 單核苷酸多態(tài)性 多態(tài) 時(shí)間飛行質(zhì)譜 HOXD基因 DLX 基因 髖骨幾何結(jié)構(gòu)相關(guān)基因　出處：《天津醫(yī)科大學(xué)》2015年博士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：目的:本課題旨在研究發(fā)育性髖關(guān)節(jié)發(fā)育不良(developmental dysplasia of the hip,DDH)的可能候選基因,分別選取了病患樣本中HOXD基因簇5’端基因,DLX3,4,5基因和髖骨幾何結(jié)構(gòu)相關(guān)基因的若干單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位點(diǎn),采用時(shí)間飛行質(zhì)譜技術(shù)進(jìn)行基因分型分析,與健康對(duì)照組及數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比較,探討其與DDH發(fā)生的相關(guān)性,希望為進(jìn)一步揭示DDH的遺傳學(xué)病因,為疾病的早期預(yù)防和診斷提供依據(jù)。方法:1.本研究結(jié)合目前在肢體發(fā)育機(jī)制方面的研究進(jìn)展和DDH的主要病理改變,推測(cè)HOXD基因簇5’端基因可能是DDH相關(guān)的候選基因,運(yùn)用飛行時(shí)間質(zhì)譜的方法對(duì)HOXD基因簇5’端的的HOXD9,HOXD10,HOXD11和HOXD12等4個(gè)基因,共9個(gè)多態(tài)位點(diǎn)在210個(gè)DDH和174個(gè)匹配對(duì)照樣本中進(jìn)行基因分型分析。2.本研究結(jié)合連鎖分析發(fā)現(xiàn)的DDH易感區(qū)域,區(qū)域內(nèi)已知基因的分子生物學(xué)功能及DDH的主要病理改變推測(cè)有可能與DDH相關(guān)的候選基因,我們推測(cè)DLX家族成員可能是DDH的候選基因。運(yùn)用飛行時(shí)間質(zhì)譜的方法對(duì)DLX基因家族的3個(gè)基因:DLX 3,DLX4和DLX5,共8個(gè)多態(tài)位點(diǎn)在192個(gè)DDH和188個(gè)匹配對(duì)照樣本中進(jìn)行基因分型分析。3.本研究基于以往在骨研究領(lǐng)域與髖骨幾何結(jié)構(gòu)相關(guān)的全基因組關(guān)聯(lián)分析(Genome Wide Association Study,GWAS)的研究結(jié)果,推測(cè)髖骨幾何結(jié)構(gòu)相關(guān)的基因可能是DDH的候選基因。我們選擇選取與髖部骨骼發(fā)育相關(guān)的5個(gè)可能易感基因中的9個(gè)多態(tài)位點(diǎn)作為候選基因,運(yùn)用飛行時(shí)間質(zhì)譜的方法對(duì)這些多態(tài)位點(diǎn)在192個(gè)DDH和188個(gè)匹配對(duì)照樣本中進(jìn)行基因分型分析。結(jié)果:1.在9個(gè)SNPs位點(diǎn)中,5個(gè)位點(diǎn)與DDH密切相關(guān),它們是HOXD9基因rs711819多態(tài),HOXD10基因rs7601234多態(tài),HOXD11基因rs6745764多態(tài),HOXD11基因rs711815多態(tài)及HOXD12基因rs35817516多態(tài)。另外4個(gè)多態(tài)位點(diǎn)均與DDH不相關(guān),它們分別是HOXD9基因rs711822多態(tài),HOXD10基因rs78466921多態(tài),HOXD10基因rs4972803多態(tài)及HOXD12基因rs711812多態(tài)。2.在8個(gè)SNPs位點(diǎn)中,5個(gè)位點(diǎn)與DDH密切相關(guān),它們分別是DLX3基因的3個(gè)SNPs位點(diǎn)(rs2278163多態(tài),rs12452477多態(tài)和rs2303466多態(tài))和DLX4的2個(gè)SNPs位點(diǎn)(rs1058564多態(tài)和rs3760415多態(tài))。另外,DLX5基因的3個(gè)單SNPs位點(diǎn)(rs12077335多態(tài),rs9769385多態(tài)和rs35273378多態(tài))均與DDH不相關(guān)。3.在9個(gè)SNPs位點(diǎn)中,4個(gè)位點(diǎn)與DDH密切相關(guān),它們分別是VAMP1基因rs10492096,ZNF366基因rs10515148多態(tài),PHACTR1基因rs4715166多態(tài)和PLCL1基因rs3771362多態(tài)。另外,RTP3基因rs10514713多態(tài),RTP3基因rs7430431多態(tài),PLCL1基因rs4850820多態(tài),PLCL1基因rs4850833多態(tài)和PLCL1基因rs9789480多態(tài)均與DDH不相關(guān)。結(jié)論:1.我們首次發(fā)現(xiàn)HOXD9基因rs711819多態(tài),HOXD10基因rs7601234多態(tài),HOXD11基因rs6745764多態(tài),HOXD11基因rs711815多態(tài)及HOXD12基因rs35817516多態(tài)等5個(gè)SNPSs位點(diǎn)與DDH密切相關(guān)。首次證明HOXD基因簇5’端基因(HOXD9,HOXD10,HOXD11及HOXD12)與DDH的相關(guān)性。2.我們首次發(fā)現(xiàn)DLX3的3個(gè)SNPs位點(diǎn)(rs2278163多態(tài),rs12452477多態(tài)和rs2303466多態(tài))和DLX4的2個(gè)SNPs位點(diǎn)(rs1058564多態(tài)和rs3760415多態(tài)),共5個(gè)SNPs位點(diǎn)與DDH密切相關(guān)。首次證明DLX3和DLX4基因可能與DDH的相關(guān)性。3.我們首次發(fā)現(xiàn)VAMP1基因rs10492096,ZNF366基因rs10515148多態(tài),PHACTR1基因rs4715166多態(tài)和PLCL1基因rs3771362多態(tài)等4個(gè)SNPs位點(diǎn)與DDH密切相關(guān)。首次證明髖骨幾何結(jié)構(gòu)相關(guān)基因可能與DDH的相關(guān)性。
[Abstract]:Objective : To study the possible candidate genes of DDH , and to investigate the relationship between DDH and DDH . It is suggested that the 5 ' end gene of HOXD gene cluster may be a candidate gene of DDH . The polymorphisms of rs10492096 , rs12452477 polymorphism and rs3771362 polymorphism of the gene rs3771362 were closely related to DDH .

【學(xué)位授予單位】：天津醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：R681.1

【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1457356