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基于STM32的核酸檢測系統(tǒng)研究

發(fā)布時間:2017-07-19 09:14

  本文關(guān)鍵詞:基于STM32的核酸檢測系統(tǒng)研究


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【摘要】:目前,疾病預防和治療往往基于生物樣品如血液和尿液中的化學參數(shù)的測量。通常,樣品需要送到中心實驗室由熟練的技術(shù)人員進行分析,檢測結(jié)果也需要幾個小時甚至幾天才可以得到。因此,需要小型、快速和易于操作的設備來降低成本和提高效率。床旁快速檢測(POCT),一種緊湊和靈活的臨床檢測設備,把疾病診斷從中心實驗室?guī)У讲∪松磉叢⒛芸焖俚墨@得檢測結(jié)果。核酸檢測可以為傳染性和遺傳性疾病提供快速、靈敏和特異的檢測。聚合酶鏈反應(PCR)為核酸擴增提供了一種簡單和優(yōu)雅的方法。這種方法通過使用耐高溫的聚合酶和溫度循環(huán)使DNA鏈變性和復性。不幸的是,PCR反應所需要的溫度循環(huán)使設計變得復雜、耗能和笨重,,從而使微觀尺度的PCR不能很好的集成到POCT平臺上。為了克服傳統(tǒng)PCR擴增的局限性,等溫的核酸擴增成為最新的研究方向。它避免了由核酸擴增階段的溫度循環(huán)帶來的額外復雜性和相關(guān)的控制機制,從而為基于POCT平臺的核酸擴增提供了強大的支持。本論文主要設計一種基于滑移芯片技術(shù)和環(huán)介導等溫擴增(LAMP)技術(shù)的POCT設備,該設備包含了核酸擴增、光學檢測和溫度控制。 本文完成了基于STM32的核酸檢測系統(tǒng)的設計。該系統(tǒng)主要由微流控芯片、溫控模塊和光學模塊組成。本文在滑移芯片上實現(xiàn)了環(huán)介導等溫擴增;微流控芯片采用了滑移芯片技術(shù),為核酸擴增提供反應平臺,實現(xiàn)了對微量試樣的靈活操作,通過旋轉(zhuǎn)即可反應并得到結(jié)果的特點使其具有使用簡單、快速和高效的優(yōu)點;核酸擴增采用環(huán)介導等溫擴增,使溫控模塊的設計得到簡化。溫控模塊對核酸反應的溫度進行控制,為了簡化加工工藝和便于產(chǎn)品化,采用了基于熱電制冷器(TEC)的接觸式加熱方法,通過改變熱電制冷器的電流方向來改變其制冷和加熱的工作狀態(tài)。光學模塊主要對試樣中的熒光染料進行激發(fā)并檢測其發(fā)射光從而判斷目標檢測物的有無。 系統(tǒng)的硬件設計以基于Cortex-M3內(nèi)核的STM32F103ZET6為核心,實現(xiàn)了溫度采集、溫度控制、光電信號檢測、LCD顯示、串口、按鍵等功能。系統(tǒng)的軟件設計使用了標準外設庫從而大大提高了開發(fā)效率。溫控精度是核酸擴增成功與否的關(guān)鍵,本文采用了增量式PID溫控算法和PWM技術(shù)實現(xiàn)了對溫度的精確控制,并通過遺傳算法和粒子群算法實現(xiàn)在線PID參數(shù)自整定。 本系統(tǒng)的溫控解決方案能夠?qū)怂岱磻臏囟冗M行精確控制,并能夠在線對微弱的熒光信號進行檢測,實現(xiàn)了用于核酸檢測的便攜式的POCT設備。
【關(guān)鍵詞】:POCT 微流控芯片 STM32 溫度控制
【學位授予單位】:華中科技大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:TP274;R197.39
【目錄】:
  • 摘要4-6
  • Abstract6-10
  • 1 緒論10-19
  • 1.1 引言10
  • 1.2 床旁快速檢測(POCT)10-11
  • 1.3 環(huán)介導等溫核酸擴增(LAMP)11-12
  • 1.4 微流控 PCR 芯片12-15
  • 1.5 微流控 PCR 芯片的溫度控制系統(tǒng)15-18
  • 1.6 本文的主要工作18-19
  • 2 系統(tǒng)總體設計方案19-24
  • 2.1 溫控模塊19-20
  • 2.2 光學模塊20-22
  • 2.3 微流控 LAMP 芯片22-24
  • 3 系統(tǒng)硬件設計24-45
  • 3.1 ARM Cortex-M3 內(nèi)核24-26
  • 3.2 STM32F103 微處理器26-27
  • 3.3 最小系統(tǒng)設計27-32
  • 3.4 溫度采集模塊設計32-34
  • 3.5 溫度控制模塊設計34-42
  • 3.6 光電信號檢測模塊42-43
  • 3.7 TFT-LCD 顯示模塊43-45
  • 4 系統(tǒng)軟件設計45-52
  • 4.1 系統(tǒng)軟件總體設計45-46
  • 4.2 溫度采集模塊設計46-48
  • 4.3 溫度控制模塊設計48-49
  • 4.4 光電信號檢測模塊49-50
  • 4.5 TFT-LCD 顯示模塊50-52
  • 5 溫度控制算法的研究52-63
  • 5.1 PID 控制的基本原理52-54
  • 5.2 增量式 PID 控制54-55
  • 5.3 PID 控制算法的改進55-56
  • 5.4 基于遺傳算法的 PID 控制器參數(shù)整定56-59
  • 5.5 基于粒子群算法的 PID 控制器參數(shù)整定59-63
  • 6 實驗和結(jié)論63-71
  • 7 總結(jié)與展望71-73
  • 致謝73-74
  • 參考文獻74-76

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