發(fā)布時間：2017-05-23 14:18

  本文關鍵詞：前列腺癌拷貝數目變異的生物信息學分析，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：前列腺癌是一種嚴重威脅男性健康的惡性腫瘤,其致病機理尚未明確�？截悢的孔儺�(copy number variations)作為一種染色體結構變異,廣泛分布于人類基因組中。由于在發(fā)生變異的區(qū)段內包含重要的遺傳信息,目前已有大量的研究表明拷貝數目變異對于前列腺癌的發(fā)生發(fā)展有著重要的影響。本文系統(tǒng)的探究了拷貝數目變異對前列腺癌的影響機制,為臨床上癌癥的治療提供幫助。在本文中,我們利用PubMed和EmBase數據庫進行文獻檢索,篩選出53篇相關文獻。通過深入的文獻挖掘,對拷貝數目變異位點的遺傳信息、樣本信息、檢測方法、文獻信息進行了全面注釋,最終記錄了345個前列腺癌拷貝數目變異位點,包含895個基因。我們對記錄的數據進行統(tǒng)計分析,包括前列腺癌拷貝數目變異的檢測方法分析、染色體分布分析、變異類型分析等。結果表明：全基因組芯片技術和下一代測序技術使用最為廣泛,大大提高了拷貝數目變異的檢測率；8號染色體上分布的拷貝數目位點的個數所占的比例最大；缺失型拷貝數目變異占大部分。利用生物信息學方法,對前列腺癌拷貝數目變異基因進行了基因本體論分析,生物通過分析,驅動變異分析。我們發(fā)現在前列腺癌拷貝數目變異基因富集的生物過程中,前10條生物通路都是與程序性細胞死亡,細胞凋亡,細胞增殖,細胞組件大小相關,表明了基因的拷貝數目變異影響了前列腺癌的發(fā)生發(fā)展。此外,在拷貝數目變異分布最多的8號染色上,其發(fā)生拷貝數目變異的基因,通過與周圍基因的相互作用,影響了生物體內的重要信號通路,對于癌癥的發(fā)生起到了驅動作用。
【關鍵詞】：前列腺癌 拷貝數目變異 統(tǒng)計分析 生物功能分析
【學位授予單位】：蘇州大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2015
【分類號】：R737.25;Q811.4
【目錄】：

• 摘要4-5
• Abstract5-8
• 第一章 引言8-18
• 1.1 前列腺癌研究背景及意義8-9
• 1.2 拷貝數目變異的研究現狀9-15
• 1.2.1 拷貝數目變異(CNV)9-10
• 1.2.2 CNV的形成和作用機制10-12
• 1.2.3 應用于前列腺癌治療中CNV的檢測技術12-15
• 1.3 拷貝數目變異對前列腺癌的影響15-17
• 1.3.1 拷貝數目變異在前列腺癌中的染色體分布15
• 1.3.2 拷貝數目變異在前列腺癌的診斷和治療中的作用15-17
• 1.4 本文課題的研究目的及工作流程17-18
• 第二章 前列腺癌拷貝數目變異基因數據收集與分析方法介紹18-30
• 2.1 變異數據收集18-19
• 2.1.1 文獻檢索方法18
• 2.1.2 數據收集內容18-19
• 2.2 分析方法介紹19-30
• 2.2.1 數據庫介紹19-20
• 2.2.2 基因本體論分析20-24
• 2.2.3 通路分析方法24-25
• 2.2.4 驅動突變(driver mutation)分析方法25-30
• 第三章 前列腺癌拷貝數目變異數據收集結果與統(tǒng)計分析30-36
• 3.1 前列腺癌基因拷貝數目變異的研究趨勢分析30-32
• 3.2 前列腺癌基因拷貝數目變異的類型分析32-33
• 3.3 前列腺癌基因拷貝數目變異的檢測方法分析33-34
• 3.4 前列腺癌基因拷貝數目變異的種族分布分析34-35
• 3.5 前列腺癌基因拷貝數目變異的染色體分布分析35-36
• 第四章 前列腺癌拷貝數目變異基因生物功能分析36-47
• 4.1 前列腺癌拷貝數目變異基因的Gene Ontology分析36-39
• 4.2 前列腺癌拷貝數目變異基因的生物通路功能分析39-42
• 4.3 前列腺癌拷貝數目變異基因的驅動變異分析42-47
• 第五章 結果與展望47-49
• 參考文獻49-55
• 附錄一55-66
• 附錄二66-67
• 致謝67-68

【參考文獻】

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1 馬天駿;鄧禎祥;陳詩哲;周文琪;李金明;;DNA拷貝數變異及其研究進展[J];中華臨床醫(yī)師雜志(電子版);2013年14期

  本文關鍵詞：前列腺癌拷貝數目變異的生物信息學分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號：388207