發(fā)布時(shí)間：2017-05-05 14:19

  本文關(guān)鍵詞：基于生物信息技術(shù)對(duì)代謝酶基因多態(tài)性與肺癌易感性關(guān)系的研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：摘要：國(guó)內(nèi)外對(duì)于代謝酶的基因多態(tài)性與肺癌易感性有很多研究報(bào)道,但結(jié)果不一致。本文基于生物信息技術(shù)研究Ⅰ相代謝酶CYP2A6、CYP1A1、CYP2D6的基因多態(tài)性在湖南漢族人群中的分布頻率,探討其基因多態(tài)性與肺癌易感性之間的關(guān)系。旨在為確定肺癌易感性遺傳標(biāo)記,為肺癌的病因?qū)W研究和早期預(yù)防提供一定的實(shí)驗(yàn)研究依據(jù)。 本文采取病例-對(duì)照研究方法,選取湖南省漢族168例肺癌患者及201例健康者作為對(duì)照,用蛋白酶K消化法提取外周血基因組DNA,用Primer Premier5.0軟件設(shè)計(jì)PCR引物,采用兩步法等位基因特異性PCR分析CYP2A6的基因多態(tài)性；采取PCR及PCR-RFLP技術(shù)檢測(cè)代謝酶CYP1A1、CYP2D6基因型。對(duì)測(cè)序結(jié)果采用Chromas version2.22軟件進(jìn)行分析。對(duì)收集的數(shù)據(jù)采用SPSS16.0進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,用χ2檢驗(yàn)基因型的頻率在正常對(duì)照組和肺癌組之間的分布差異,并進(jìn)行多因素非條件logistic回歸分析；采用MDR Soft-ware程序包(2.0_Beta版)進(jìn)行基因-基因交互分析。 研究結(jié)果表明,病例組和對(duì)照組之間CYP2A6基因型：野生型(WW),雜合型缺失(WD)和缺失基因型(DD)的頻率沒(méi)有顯著差異(P0.05)；病例組和對(duì)照組之間CYP1A1, CYP2D6的野生型(WW),突變型(MM)和雜合突變型(WM)的基因頻率無(wú)顯著性差異(P0.05)。然后進(jìn)行多因素非條件logistic回歸分析,CYP2A6、CYP1A1、CYP2D6基因多態(tài)性與肺癌患病風(fēng)險(xiǎn)無(wú)明顯相關(guān)性。利用MDR(多因子降維分析法)檢測(cè)環(huán)境與3個(gè)基因之間的交互作用,結(jié)果顯示：CYP2A6、CYP1A1、CYP2D6三基因座交互模型為最佳模型,具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P值0.0004),交叉驗(yàn)證一致性10/10,檢驗(yàn)樣本準(zhǔn)確度0.572。中國(guó)湖南漢族人群CYP2A6、 CYP1A1、CYP2D6三個(gè)基因不存在獨(dú)立效應(yīng),但是存在三階交互作用。CYP2A6、CYP1A1、CYP2D6基因型的改變對(duì)肺癌的發(fā)生不存在獨(dú)立效應(yīng),但是,CYP2A6、CYP1A1、CYP2D6之間具有交互作用,增加肺癌遺傳易感性。
【關(guān)鍵詞】：細(xì)胞色素P450 生物信息技術(shù) 基因多態(tài)性 肺癌 遺傳易感性
【學(xué)位授予單位】：中南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2013
【分類(lèi)號(hào)】：R734.2;Q811.4
【目錄】：

• 摘要4-6
• Abstract6-10
• 符號(hào)說(shuō)明10-11
• 1 緒論11-15
• 1.1 研究背景11-12
• 1.2 國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀12-13
• 1.3 研究?jī)?nèi)容與意義13-14
• 1.4 本論文的組織結(jié)構(gòu)14-15
• 2 提取基因組DNA15-19
• 2.1 樣本收集15-16
• 2.2 主要儀器設(shè)備、試劑及生產(chǎn)廠(chǎng)家16-17
• 2.3 基因組DNA提取17-18
• 2.4 小結(jié)18-19
• 3. 采用PRIMER PREMIER 5.0軟件設(shè)計(jì)PCR引物技術(shù)控制19-27
• 3.1 采用PRIMER PREMIER軟件設(shè)計(jì)PCR引物的流程19-20
• 3.2 采用PRIMER PREMIER 5.0軟件設(shè)計(jì)PCR引物具體的步驟及技巧20-24
• 3.3 三個(gè)基因引物的核苷酸序列24-25
• 3.4 擴(kuò)增的三個(gè)基因目的序列25-26
• 3.5 小結(jié)26-27
• 4 三個(gè)代謝酶基因多態(tài)位點(diǎn)的檢測(cè)27-34
• 4.1 三個(gè)代謝酶基因的基因型檢測(cè)27-33
• 4.1.1 CYP2A6基因多態(tài)性分析27-30
• 4.1.2 CYP1A1基因MspⅠ多態(tài)分析30-31
• 4.1.3 CYP2D6基因多態(tài)性分析31-33
• 4.2 小結(jié)33-34
• 5 采用CHROMAS VERSION 2.22軟件分析基因測(cè)序結(jié)果34-40
• 5.1 采用軟件分析測(cè)序結(jié)果34-39
• 5.1.1 CYP2A6基因第二次PCR產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果34-35
• 5.1.2 CYP1A1基因PCR產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果35-37
• 5.1.3 CYP2D6基因PCR產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果37-39
• 5.2 小結(jié)39-40
• 6 運(yùn)用生物信息軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析40-49
• 6.1 代謝酶基因多態(tài)的分布與肺癌患病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系41-48
• 6.1.1 對(duì)照組中基因型H-W平衡檢驗(yàn)41
• 6.1.2 代謝酶CYP2A6基因多態(tài)的分布與肺癌患病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系41-43
• 6.1.3 代謝酶CYP1A1基因多態(tài)的分布與肺癌患病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系43-45
• 6.1.4 代謝酶CYP2D6基因多態(tài)的分布與肺癌患病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系45-47
• 6.1.5 利用MDR檢測(cè)3個(gè)基因之間的交互作用47-48
• 6.2 小結(jié)48-49
• 7 工作總結(jié)與展望49-51
• 7.1 研究總結(jié)49-50
• 7.2 研究展望50-51
• 參考文獻(xiàn)51-56
• 攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的SCI論文56-57
• 致謝57

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前4條

1 張文慧;郭華;王偉利;劉明;錢(qián)愛(ài)東;;禽流感病毒H5亞型及H7亞型基因的引物設(shè)計(jì)與多重RT-PCR擴(kuò)增[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2008年16期

2 顧艷斐,張樹(shù)才,賴(lài)百塘,汪惠,湛秀萍;代謝酶基因多態(tài)性與肺癌易感性關(guān)系的研究[J];中國(guó)肺癌雜志;2004年02期

3 郭占林,周清華,朱文,李代蓉,袁天柱,王艷萍,陳曉禾,劉倫旭,伍佇,楊俊杰;代謝酶CYP2D6基因多態(tài)性與肺癌易感性的病例對(duì)照研究[J];中國(guó)肺癌雜志;2005年02期

4 顧艷斐,張樹(shù)才,賴(lài)百塘,湛秀萍,張毅;CYP2A6基因多態(tài)性與肺癌易感性關(guān)系的研究[J];中國(guó)肺癌雜志;2005年04期

  本文關(guān)鍵詞：基于生物信息技術(shù)對(duì)代謝酶基因多態(tài)性與肺癌易感性關(guān)系的研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

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本文編號(hào)：346524