基于Python的兒童腦圖譜工具箱的設計與實現(xiàn)
發(fā)布時間:2021-08-28 22:53
在完成了兒童功能性腦圖譜的構(gòu)建后,需要考慮的問題就是如何將它直觀地呈現(xiàn)出來。目前,已經(jīng)有適用于打開和呈現(xiàn)NIFTI圖像文件的Python模塊或是MATLAB工具包。但是,他們對于不熟悉腳本操作和編程的研究者來說不是很方便,需要經(jīng)過專門的學習才能運用自如。我們考慮開發(fā)一個基于Python的工具箱來適配兒童功能性腦圖譜的呈現(xiàn)和后續(xù)的分析,用戶可以直接在GUI界面上進行點擊即可完成自己的研究操作,避免直接與腳本進行交互,方便了沒有編程基礎的用戶的使用。
【文章來源】:軟件. 2020,41(07)
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
FWE:0.005圖譜呈現(xiàn)
FDR:0.005圖譜呈現(xiàn)
DBFA工具箱是作為兒童功能性腦發(fā)育圖譜的可視化工具而開發(fā)的,但是它不應只具有可視化這么一個功能,這樣開發(fā)成本太高而可使用性又太低。我們考慮,DBFA工具箱應該具有能夠可視化.nii(標準NIFTI圖像的擴展名是.nii,包含了頭文件及圖像資料)的文件功能,它不僅僅只用于開發(fā)的腦圖譜的文件,用戶自己的.nii文件也可以使用該工具箱來打開并且可視化。用戶有兩種方式可以打開nii圖譜文件,一種通過打開菜單在電腦磁盤中選擇要處理的文件;另一種是根據(jù)工具箱提供的篩選功能,選擇年齡,認知任務和狀態(tài)來篩選出對應的nii文件來打開。打開后,對應的nii文件的可視化腦圖將會顯示在主界面上,用戶可以根據(jù)自己的需求來直接將圖片保存下來,或者是使用FDR、FPR、FWE矯正得到更加嚴格的腦圖譜后再保存。同時也可以設置Voxels的數(shù)目來決定激活腦區(qū)的最小大;設置Cut_coords的坐標來獲得不同位置的腦切片圖譜。完成后,用戶可以將該處理完的腦圖譜存儲為一個新的nii文件,今后可以隨時進行查看和再操作。DBFA工具箱的系統(tǒng)功能流程圖如圖1所示。2 核心部分
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于Qt繪圖系統(tǒng)的圖形應用優(yōu)化研究與實現(xiàn)[J]. 鄧子強,王玉玫,鄧紅艷,張宇. 軟件. 2016(12)
[2]基于Qt開源框架的跨平臺圖像修復系統(tǒng)設計與實現(xiàn)[J]. 蘭林濤,桂彥,鄭鎮(zhèn)潮,柳鄧一漫,羅京,王朦. 軟件. 2016(08)
本文編號:3369380
【文章來源】:軟件. 2020,41(07)
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
FWE:0.005圖譜呈現(xiàn)
FDR:0.005圖譜呈現(xiàn)
DBFA工具箱是作為兒童功能性腦發(fā)育圖譜的可視化工具而開發(fā)的,但是它不應只具有可視化這么一個功能,這樣開發(fā)成本太高而可使用性又太低。我們考慮,DBFA工具箱應該具有能夠可視化.nii(標準NIFTI圖像的擴展名是.nii,包含了頭文件及圖像資料)的文件功能,它不僅僅只用于開發(fā)的腦圖譜的文件,用戶自己的.nii文件也可以使用該工具箱來打開并且可視化。用戶有兩種方式可以打開nii圖譜文件,一種通過打開菜單在電腦磁盤中選擇要處理的文件;另一種是根據(jù)工具箱提供的篩選功能,選擇年齡,認知任務和狀態(tài)來篩選出對應的nii文件來打開。打開后,對應的nii文件的可視化腦圖將會顯示在主界面上,用戶可以根據(jù)自己的需求來直接將圖片保存下來,或者是使用FDR、FPR、FWE矯正得到更加嚴格的腦圖譜后再保存。同時也可以設置Voxels的數(shù)目來決定激活腦區(qū)的最小大;設置Cut_coords的坐標來獲得不同位置的腦切片圖譜。完成后,用戶可以將該處理完的腦圖譜存儲為一個新的nii文件,今后可以隨時進行查看和再操作。DBFA工具箱的系統(tǒng)功能流程圖如圖1所示。2 核心部分
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于Qt繪圖系統(tǒng)的圖形應用優(yōu)化研究與實現(xiàn)[J]. 鄧子強,王玉玫,鄧紅艷,張宇. 軟件. 2016(12)
[2]基于Qt開源框架的跨平臺圖像修復系統(tǒng)設計與實現(xiàn)[J]. 蘭林濤,桂彥,鄭鎮(zhèn)潮,柳鄧一漫,羅京,王朦. 軟件. 2016(08)
本文編號:3369380
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