基于Python的兒童腦圖譜工具箱的設(shè)計(jì)與實(shí)現(xiàn)
發(fā)布時(shí)間:2021-08-28 22:53
在完成了兒童功能性腦圖譜的構(gòu)建后,需要考慮的問(wèn)題就是如何將它直觀地呈現(xiàn)出來(lái)。目前,已經(jīng)有適用于打開(kāi)和呈現(xiàn)NIFTI圖像文件的Python模塊或是MATLAB工具包。但是,他們對(duì)于不熟悉腳本操作和編程的研究者來(lái)說(shuō)不是很方便,需要經(jīng)過(guò)專門(mén)的學(xué)習(xí)才能運(yùn)用自如。我們考慮開(kāi)發(fā)一個(gè)基于Python的工具箱來(lái)適配兒童功能性腦圖譜的呈現(xiàn)和后續(xù)的分析,用戶可以直接在GUI界面上進(jìn)行點(diǎn)擊即可完成自己的研究操作,避免直接與腳本進(jìn)行交互,方便了沒(méi)有編程基礎(chǔ)的用戶的使用。
【文章來(lái)源】:軟件. 2020,41(07)
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【部分圖文】:
FWE:0.005圖譜呈現(xiàn)
FDR:0.005圖譜呈現(xiàn)
DBFA工具箱是作為兒童功能性腦發(fā)育圖譜的可視化工具而開(kāi)發(fā)的,但是它不應(yīng)只具有可視化這么一個(gè)功能,這樣開(kāi)發(fā)成本太高而可使用性又太低。我們考慮,DBFA工具箱應(yīng)該具有能夠可視化.nii(標(biāo)準(zhǔn)NIFTI圖像的擴(kuò)展名是.nii,包含了頭文件及圖像資料)的文件功能,它不僅僅只用于開(kāi)發(fā)的腦圖譜的文件,用戶自己的.nii文件也可以使用該工具箱來(lái)打開(kāi)并且可視化。用戶有兩種方式可以打開(kāi)nii圖譜文件,一種通過(guò)打開(kāi)菜單在電腦磁盤(pán)中選擇要處理的文件;另一種是根據(jù)工具箱提供的篩選功能,選擇年齡,認(rèn)知任務(wù)和狀態(tài)來(lái)篩選出對(duì)應(yīng)的nii文件來(lái)打開(kāi)。打開(kāi)后,對(duì)應(yīng)的nii文件的可視化腦圖將會(huì)顯示在主界面上,用戶可以根據(jù)自己的需求來(lái)直接將圖片保存下來(lái),或者是使用FDR、FPR、FWE矯正得到更加嚴(yán)格的腦圖譜后再保存。同時(shí)也可以設(shè)置Voxels的數(shù)目來(lái)決定激活腦區(qū)的最小大。辉O(shè)置Cut_coords的坐標(biāo)來(lái)獲得不同位置的腦切片圖譜。完成后,用戶可以將該處理完的腦圖譜存儲(chǔ)為一個(gè)新的nii文件,今后可以隨時(shí)進(jìn)行查看和再操作。DBFA工具箱的系統(tǒng)功能流程圖如圖1所示。2 核心部分
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于Qt繪圖系統(tǒng)的圖形應(yīng)用優(yōu)化研究與實(shí)現(xiàn)[J]. 鄧子強(qiáng),王玉玫,鄧紅艷,張宇. 軟件. 2016(12)
[2]基于Qt開(kāi)源框架的跨平臺(tái)圖像修復(fù)系統(tǒng)設(shè)計(jì)與實(shí)現(xiàn)[J]. 蘭林濤,桂彥,鄭鎮(zhèn)潮,柳鄧一漫,羅京,王朦. 軟件. 2016(08)
本文編號(hào):3369380
【文章來(lái)源】:軟件. 2020,41(07)
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【部分圖文】:
FWE:0.005圖譜呈現(xiàn)
FDR:0.005圖譜呈現(xiàn)
DBFA工具箱是作為兒童功能性腦發(fā)育圖譜的可視化工具而開(kāi)發(fā)的,但是它不應(yīng)只具有可視化這么一個(gè)功能,這樣開(kāi)發(fā)成本太高而可使用性又太低。我們考慮,DBFA工具箱應(yīng)該具有能夠可視化.nii(標(biāo)準(zhǔn)NIFTI圖像的擴(kuò)展名是.nii,包含了頭文件及圖像資料)的文件功能,它不僅僅只用于開(kāi)發(fā)的腦圖譜的文件,用戶自己的.nii文件也可以使用該工具箱來(lái)打開(kāi)并且可視化。用戶有兩種方式可以打開(kāi)nii圖譜文件,一種通過(guò)打開(kāi)菜單在電腦磁盤(pán)中選擇要處理的文件;另一種是根據(jù)工具箱提供的篩選功能,選擇年齡,認(rèn)知任務(wù)和狀態(tài)來(lái)篩選出對(duì)應(yīng)的nii文件來(lái)打開(kāi)。打開(kāi)后,對(duì)應(yīng)的nii文件的可視化腦圖將會(huì)顯示在主界面上,用戶可以根據(jù)自己的需求來(lái)直接將圖片保存下來(lái),或者是使用FDR、FPR、FWE矯正得到更加嚴(yán)格的腦圖譜后再保存。同時(shí)也可以設(shè)置Voxels的數(shù)目來(lái)決定激活腦區(qū)的最小大。辉O(shè)置Cut_coords的坐標(biāo)來(lái)獲得不同位置的腦切片圖譜。完成后,用戶可以將該處理完的腦圖譜存儲(chǔ)為一個(gè)新的nii文件,今后可以隨時(shí)進(jìn)行查看和再操作。DBFA工具箱的系統(tǒng)功能流程圖如圖1所示。2 核心部分
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于Qt繪圖系統(tǒng)的圖形應(yīng)用優(yōu)化研究與實(shí)現(xiàn)[J]. 鄧子強(qiáng),王玉玫,鄧紅艷,張宇. 軟件. 2016(12)
[2]基于Qt開(kāi)源框架的跨平臺(tái)圖像修復(fù)系統(tǒng)設(shè)計(jì)與實(shí)現(xiàn)[J]. 蘭林濤,桂彥,鄭鎮(zhèn)潮,柳鄧一漫,羅京,王朦. 軟件. 2016(08)
本文編號(hào):3369380
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/swyx/3369380.html
最近更新
教材專著