蛋白質(zhì)是一種以氨基酸為基本單位的生物大分子。金屬蛋白質(zhì)是生物體內(nèi)可以結(jié)合金屬離子的蛋白質(zhì)。蛋白酶是生命體中由細胞產(chǎn)生的催化劑,具有高度選擇性和催化活性,是一類特殊的蛋白質(zhì)。生命體中的部分金屬離子是以金屬蛋白酶的形式表現(xiàn)生物功能的。根據(jù)蛋白酶的組成不同分類,可分為單純蛋白質(zhì)和結(jié)合蛋白質(zhì)。其中,結(jié)合蛋白質(zhì)是由蛋白質(zhì)成分的酶蛋白和非蛋白質(zhì)成分的輔助因子組成,兩者結(jié)合稱之為全酶,且只有全酶具有催化活性。非血紅素鐵酶是一類重要的金屬蛋白酶,在化學(xué)、生物、環(huán)境和醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域應(yīng)用廣泛。盡管實驗可以確定部分反應(yīng)產(chǎn)物,但非血紅素鐵酶詳細的反應(yīng)機理,不同反應(yīng)底物的反應(yīng)中間體和過渡態(tài)僅僅通過實驗方法是無法得到的。所以,本論文主要利用密度泛函理論研究了三種代表性非血紅素鐵金屬蛋白酶——龍膽酸-1,2-雙加氧酶,AsqJ雙加氧酶和AlkB酶。（一）龍膽酸-1,2-雙加氧酶（GDO）,屬cupin超家族,是非血紅素鐵酶的一種。GDO催化芳香族化合物龍膽酸中的芳香環(huán)結(jié)構(gòu),生成順丁烯二�；�,發(fā)生氧化分解裂解反應(yīng)。氧分子作為氧化劑參與反應(yīng),底物結(jié)合氧氣中的兩個氧原子,在GDO的參與下反應(yīng),形成最終裂解產(chǎn)物。對該反應(yīng)... 

【文章來源】：魯東大學(xué)山東省

【文章頁數(shù)】：87 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
致謝
摘要
Abstract
第1章 引言
    1.1 金屬蛋白酶
    1.2 非血紅素鐵加氧酶
    1.3 仿生催化反應(yīng)應(yīng)用前景
    1.4 本論文的研究內(nèi)容及意義
第2章 基礎(chǔ)理論和計算方法
    2.1 Schr?dinger方程
    2.2 Hohenberg–Kohn定理
    2.3 Kohn–Sham方程
    2.4 密度泛函理論
    2.5 B3LYP泛函
第3章 非血紅素鐵復(fù)合物龍膽酸-1,2-雙加氧酶催化芳香環(huán)斷裂反應(yīng)機理
    3.1 前言
    3.2 計算模型和研究方法
    3.3 結(jié)果討論
        3.3.1 去質(zhì)子化氧化
        3.3.2 第一步氫質(zhì)子轉(zhuǎn)移
        3.3.3 第二步氫質(zhì)子轉(zhuǎn)移
        3.3.4 水解過程
    3.4 小結(jié)
第4章 喹諾酮類抗菌藥生物合成機理研究
    4.1 前言
        4.1.1 喹諾酮和喹諾酮類生物堿
        4.1.2 AsqJ雙加氧酶催化作用
    4.2 計算模型和研究方法
    4.3 結(jié)果討論
        4.3.1 高價鐵氧代物的形成
        4.3.2 去飽和反應(yīng)
        4.3.3 環(huán)氧化反應(yīng)過程
        4.3.4 消除重排反應(yīng)過程
    4.4 小結(jié)
第5章 AlkB酶修復(fù)突變DNA腺嘌呤的反應(yīng)機理研究
    5.1 前言
    5.2 計算模型和研究方法
    5.3 結(jié)果討論
        5.3.1 高價鐵氧代物的形成機理
        5.3.2 氫質(zhì)子轉(zhuǎn)移
        5.3.3 第二步高價鐵氧代物的形成機理
        5.3.4 去甲基化作用
    5.4 小結(jié)
第6章 結(jié)論和展望
參考文獻
作者簡歷



本文編號：3270634