本文選題：權(quán)重基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析 + 高通量技術(shù)　； 參考：《生物工程學(xué)報(bào)》2017年11期

【摘要】：高通量生物監(jiān)測(cè)方法可以同時(shí)檢測(cè)同一樣本的上千個(gè)參數(shù),其在生物醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用越來越廣泛,但如何系統(tǒng)地分析并從高通量數(shù)據(jù)中挖掘有用信息,仍是一項(xiàng)重要的課題。網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)的出現(xiàn)使人們對(duì)復(fù)雜生物系統(tǒng)有了更深刻的理解,組織/細(xì)胞功能執(zhí)行具有模塊化特點(diǎn)。目前,相關(guān)網(wǎng)絡(luò)(Correlation network)被越來越多地應(yīng)用于生物信息學(xué),權(quán)重基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(Weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)是描述樣品基因表達(dá)相關(guān)模式的一種系統(tǒng)生物學(xué)工具。在此,對(duì)WGCNA在疾病分型及預(yù)后、發(fā)病機(jī)制和其他相關(guān)領(lǐng)域研究進(jìn)展作一個(gè)較為系統(tǒng)的綜述。首先,對(duì)WGCNA的原理、分析流程和優(yōu)勢(shì)缺點(diǎn)進(jìn)行總結(jié)。其次,介紹如何用WGCNA研究疾病、正常組織、藥物、進(jìn)化和基因組注釋。最后,結(jié)合新高通量技術(shù)展望WGCNA應(yīng)用新空間。以期科研工作者能夠?qū)GCNA的應(yīng)用有所了解。
[Abstract]:High-throughput biological monitoring method can detect thousands of parameters of the same sample at the same time, and its application in biomedicine is more and more extensive. However, how to systematically analyze and mine useful information from high-throughput data is still an important subject. The emergence of network biology makes people have a deeper understanding of complex biological systems, and the execution of tissue / cell functions has the characteristics of modularization. At present, correlation network is more and more used in bioinformatics. Weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) is a systematic biological tool to describe the related patterns of gene expression in samples. In this paper, the progress of WGCNA in disease classification and prognosis, pathogenesis and other related fields is reviewed systematically. Firstly, the principle, analysis flow and advantages and disadvantages of WGCNA are summarized. Secondly, it introduces how to use WGCNA to study disease, normal tissue, medicine, evolution and genome annotation. Finally, the new space of WGCNA application is prospected with new high flux technology. It is expected that the researchers will be able to understand the application of WGCNA.
【作者單位】： 福建農(nóng)林大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院衛(wèi)生勤務(wù)與醫(yī)學(xué)情報(bào)研究所;寧波市醫(yī)療中心李惠利醫(yī)院消化內(nèi)科;德州A&M健康醫(yī)學(xué)中心;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(No.81502091) 浙江省自然科學(xué)基金(No.LQ14H030001) 寧波市自然科學(xué)基金(No.2013A610232)資助~~
【分類號(hào)】：R318

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本文編號(hào)：2052547