發(fā)布時(shí)間：2024-04-20 03:16

　　目的探討消皮素D(GSDMD)基因及其異構(gòu)體在皮膚黑色素瘤中的表達(dá)及預(yù)后意義。方法應(yīng)用基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)動(dòng)態(tài)分析(GEPIA)在線工具分析來自癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫和基因型-組織表達(dá)(GTEx)項(xiàng)目中各類腫瘤及對(duì)應(yīng)正常組織GSDMD表達(dá)情況,篩選差異表達(dá)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的癌種。同時(shí)分析GSDMD與各類腫瘤的預(yù)后的相關(guān)性,篩選有預(yù)后相關(guān)性的癌種。進(jìn)一步分析GSDMD表達(dá)與皮膚黑色素瘤分期的關(guān)系,及其異構(gòu)體與皮膚黑色素瘤預(yù)后的關(guān)系。然后從TCGA數(shù)據(jù)庫下載皮膚黑色素瘤(RNA-seq)基因表達(dá)數(shù)據(jù),對(duì)GSDMD基因高低表達(dá)組間的差異基因進(jìn)行基因本體(GO)富集及京都基因與基因組百科全書(KEGG)富集分析。結(jié)果 GSDMD基因在皮膚黑色素瘤中高表達(dá)(P<0.05),且GSDMD與皮膚黑色素瘤患者的OS及DFS具有相關(guān)性(P<0.05),其中異構(gòu)體002、004、005、007、011、012的表達(dá)與預(yù)后相關(guān)(P<0.05)。富集分析表明差異基因主要集中于免疫和炎性反應(yīng)相關(guān)的功能集及信號(hào)通路。結(jié)論 GSDMD基因在皮膚黑色素瘤中高表達(dá),且與患者預(yù)后相關(guān)。

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【部分圖文】：

圖1GSDMD在不同類型腫瘤中的表達(dá)情況

mRNA因可變剪切會(huì)出現(xiàn)不同的異構(gòu)體，在此除了觀察GSDMD基因，還對(duì)其不同的異構(gòu)體與皮膚黑色素瘤生存的相關(guān)性進(jìn)行了觀察。GSDMD基因與患者的OS及RFS均有相關(guān)性，基因的高表達(dá)往往預(yù)示患者有更好的預(yù)后。同樣在對(duì)其異構(gòu)體的深入研究中發(fā)現(xiàn)002、004、005、007、011、0....

圖2GSDMD的表達(dá)與各個(gè)類型腫瘤OS和DFS的關(guān)系

圖1GSDMD在不同類型腫瘤中的表達(dá)情況圖3GSDMD不同異構(gòu)體與OS及DFS的關(guān)系

圖3GSDMD不同異構(gòu)體與OS及DFS的關(guān)系

圖2GSDMD的表達(dá)與各個(gè)類型腫瘤OS和DFS的關(guān)系2.4GSDMD表達(dá)與腫瘤分期的相關(guān)性

圖4GSDMD表達(dá)與腫瘤分期的相關(guān)性

對(duì)GSDMD基因與皮膚黑色素瘤分期的相關(guān)性進(jìn)行分析，結(jié)果發(fā)現(xiàn)整體水平上GSDMD基因與分期無相關(guān)性，見圖4。2.5差異基因的GO富集分析

本文編號(hào)：3958791