目的:應用16S rRNA測序?qū)︺y屑病患者以及健康對照組腸道菌群特征進行分析和比較,初步探討銀屑病患者腸道菌群結(jié)構(gòu)及多樣性特征,為尋找銀屑病病因及新的治療方法提供依據(jù)。方法:收集2019年7月至2020年1月間就診的符合納入標準的銀屑病患者(P組)及在本院進行健康體檢人群(C組)的新鮮糞便標本。共納入12例銀屑病患者及12例健康人。采用CTAB法提取糞便細菌總DNA,PCR擴增,用Illumina Nova Seq平臺測序,測序后進行OTUs聚類,并對其進行物種注釋及組間差異分析。結(jié)果:1.兩組在性別、年齡及BMI指數(shù)無統(tǒng)計學差異(P>0.05)。2.經(jīng)OTU聚類共獲得1225個OTU,521個兩組共有,293個P組特有,408個C組特有。3.α-多樣性分析顯示,研究樣本量足,兩組腸道菌群豐度無統(tǒng)計學差異(P>0.05)。4.β-多樣性分析顯示,兩組間菌群結(jié)構(gòu)有統(tǒng)計學差異(P<0.05)。5.LEf Se分析發(fā)現(xiàn),13個物種的豐度在組間有差異。P組增加的主要有巨單胞菌屬(megamonas)、大腸桿菌(escherichia coli)和韋榮球菌科(veillonel...

【文章頁數(shù)】：39 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖1韋恩圖

11結(jié)果1一般臨床資料本研究納入的12例銀屑病患者以及12名健康對照者，在性別、年齡、BMI指數(shù)上無統(tǒng)計學差異(P均＞0.05)。2物種注釋2.1OTU數(shù)目對得到的有效序列以97%相似度進行OTUs聚類分析，兩組樣本共獲得1225個OTU，其中P組獲得個814個OTU，C組獲得9....

圖2門水平上兩組樣本的物種相對豐度Fig.2therelativespeciesabundanceatphylumlevel

12歧桿菌目（bifidobacteriales）；在科水平上的優(yōu)勢物種為毛螺旋菌科（lachnospiraceae）、擬桿菌科（bacteroidaceae）、消化鏈球菌科（peptostreptococcaceae）；在屬水平上的優(yōu)勢物種為類桿菌（bacteroides）、a....

圖3科水平上兩組樣本的物種相對豐度

12歧桿菌目（bifidobacteriales）；在科水平上的優(yōu)勢物種為毛螺旋菌科（lachnospiraceae）、擬桿菌科（bacteroidaceae）、消化鏈球菌科（peptostreptococcaceae）；在屬水平上的優(yōu)勢物種為類桿菌（bacteroides）、a....

圖4屬水平上兩組樣本的物種相對豐度Fig.4therelativespeciesabundanceatgenuslevel

13Fig.3therelativespeciesabundanceatfamilylevel圖4屬水平上兩組樣本的物種相對豐度Fig.4therelativespeciesabundanceatgenuslevel3物種多樣性分析3.1樣本復雜度分析（alphadiversit....

本文編號：3946063