目的：明確新疆KS感染HHV-8的k12/T0.7基因亞型的分類，初步探討HHV-8k12/T0.7亞型與新疆KS不同臨床分型及臨床表現(xiàn)的相關(guān)性。 方法：使用酚-氯仿-異戊醇法對新疆維吾爾自治區(qū)人民醫(yī)院收集的30例KS石蠟包埋組織進(jìn)行HHV-8DNA抽提，并使用巢式PCR擴(kuò)增k12/T0.7基因片段并雙向測序，采用DNAMAN軟件把測序結(jié)果裝配成重疊；然后使用Clustal W軟件對該重疊群進(jìn)行序列比對，再采用PHYLIP軟件包對比對結(jié)果進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)生學(xué)分析，從而確定HHV-8k12/T0.7基因的亞型分類；最后運(yùn)用Fisher確切概率法對結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。 結(jié)果：1.30例新疆KS中22例HHV-8感染為陽性，陽性率為73.33%，其中7例AIDS-KS患者HHV-8感染均為陽性，陽性率為100%；2.基于k12/T0.7基因位點(diǎn)進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹分析發(fā)現(xiàn)：分為兩種亞型A和A/C，其中10例為A亞型，12例為A/C型；3.新疆HHV-8各病毒株k12/T0.7基因核苷酸序列（407bp）間的差異性為0～0.35%，A亞型和C亞型病毒株k12/T0.7核苷酸序列間差異性為0.16%～0.3...

【文章頁數(shù)】：50 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
英文縮略語表
前言
材料與方法
    1 材料
        1.1 組織標(biāo)本的收集
        1.2 試劑來源
        1.3 實(shí)驗(yàn)溶液配制
        1.4 PCR 引物來源
        1.5 主要的實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備
    2 方法
        2.1 病毒 DNA 提取
        2.2 巢式 PCR 擴(kuò)增
        2.3 電泳鑒定
        2.4 雙向測序
        2.5 DNA 序列編輯
        2.6 系統(tǒng)發(fā)生學(xué)分析
        2.7 參照的核苷酸序列 GenBank 編碼
    3 數(shù)據(jù)處理
結(jié)果
    1. KS 的臨床表現(xiàn)及組織學(xué)特點(diǎn)
    2. k12/T0.7 基因位點(diǎn)擴(kuò)增產(chǎn)物電泳結(jié)果
    3. k12/T0.7 基因位點(diǎn) PCR 產(chǎn)物測序結(jié)果
    4. 實(shí)驗(yàn)所需的參考序列（灰色部分為本研究擴(kuò)增片段區(qū)）
    5. 系統(tǒng)進(jìn)化樹
    6. HHV-8 k12/T0.7 基因核苷酸序列和氨基酸序列之間的差異性
    7. HHV-8 k12/T0.7 基因亞型與新疆 KS 相關(guān)因素的關(guān)系分析
討論
    1. 新疆 KS 及其感染 HHV-8 的流行病學(xué)狀況
    2. 新疆 KS 感染 HHV-8 的 k12/T0.7 基因亞型
    3. HHV-8 k12/T0.7 基因亞型與新疆 KS 臨床損害的相關(guān)性
    4. HHV-8 k12 基因亞型與新疆 KS 臨床類型的相關(guān)性
    5. HHV-8 k12 基因亞型與新疆 AIDS-KS 發(fā)病的相關(guān)性
    6. 小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
文獻(xiàn)綜述
    參考文獻(xiàn)
附 1 新疆 KS 患者臨床資料及感染的 HHV-8 k12 基因亞型情況一覽表
致謝
作者簡介
石河子大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文導(dǎo)師評閱表



本文編號：3817405