人類皰疹病毒8型K12/T0.7亞型與新疆Kaposi肉瘤的相關(guān)性研究
發(fā)布時(shí)間:2023-05-14 06:52
目的:明確新疆KS感染HHV-8的k12/T0.7基因亞型的分類,初步探討HHV-8k12/T0.7亞型與新疆KS不同臨床分型及臨床表現(xiàn)的相關(guān)性。 方法:使用酚-氯仿-異戊醇法對(duì)新疆維吾爾自治區(qū)人民醫(yī)院收集的30例KS石蠟包埋組織進(jìn)行HHV-8DNA抽提,并使用巢式PCR擴(kuò)增k12/T0.7基因片段并雙向測(cè)序,采用DNAMAN軟件把測(cè)序結(jié)果裝配成重疊;然后使用Clustal W軟件對(duì)該重疊群進(jìn)行序列比對(duì),再采用PHYLIP軟件包對(duì)比對(duì)結(jié)果進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)生學(xué)分析,從而確定HHV-8k12/T0.7基因的亞型分類;最后運(yùn)用Fisher確切概率法對(duì)結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。 結(jié)果:1.30例新疆KS中22例HHV-8感染為陽(yáng)性,陽(yáng)性率為73.33%,其中7例AIDS-KS患者HHV-8感染均為陽(yáng)性,陽(yáng)性率為100%;2.基于k12/T0.7基因位點(diǎn)進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析發(fā)現(xiàn):分為兩種亞型A和A/C,其中10例為A亞型,12例為A/C型;3.新疆HHV-8各病毒株k12/T0.7基因核苷酸序列(407bp)間的差異性為0~0.35%,A亞型和C亞型病毒株k12/T0.7核苷酸序列間差異性為0.16%~0.3...
【文章頁(yè)數(shù)】:50 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略語(yǔ)表
前言
材料與方法
1 材料
1.1 組織標(biāo)本的收集
1.2 試劑來(lái)源
1.3 實(shí)驗(yàn)溶液配制
1.4 PCR 引物來(lái)源
1.5 主要的實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備
2 方法
2.1 病毒 DNA 提取
2.2 巢式 PCR 擴(kuò)增
2.3 電泳鑒定
2.4 雙向測(cè)序
2.5 DNA 序列編輯
2.6 系統(tǒng)發(fā)生學(xué)分析
2.7 參照的核苷酸序列 GenBank 編碼
3 數(shù)據(jù)處理
結(jié)果
1. KS 的臨床表現(xiàn)及組織學(xué)特點(diǎn)
2. k12/T0.7 基因位點(diǎn)擴(kuò)增產(chǎn)物電泳結(jié)果
3. k12/T0.7 基因位點(diǎn) PCR 產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果
4. 實(shí)驗(yàn)所需的參考序列(灰色部分為本研究擴(kuò)增片段區(qū))
5. 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)
6. HHV-8 k12/T0.7 基因核苷酸序列和氨基酸序列之間的差異性
7. HHV-8 k12/T0.7 基因亞型與新疆 KS 相關(guān)因素的關(guān)系分析
討論
1. 新疆 KS 及其感染 HHV-8 的流行病學(xué)狀況
2. 新疆 KS 感染 HHV-8 的 k12/T0.7 基因亞型
3. HHV-8 k12/T0.7 基因亞型與新疆 KS 臨床損害的相關(guān)性
4. HHV-8 k12 基因亞型與新疆 KS 臨床類型的相關(guān)性
5. HHV-8 k12 基因亞型與新疆 AIDS-KS 發(fā)病的相關(guān)性
6. 小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
文獻(xiàn)綜述
參考文獻(xiàn)
附 1 新疆 KS 患者臨床資料及感染的 HHV-8 k12 基因亞型情況一覽表
致謝
作者簡(jiǎn)介
石河子大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文導(dǎo)師評(píng)閱表
本文編號(hào):3817405
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【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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前言
材料與方法
1 材料
1.1 組織標(biāo)本的收集
1.2 試劑來(lái)源
1.3 實(shí)驗(yàn)溶液配制
1.4 PCR 引物來(lái)源
1.5 主要的實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備
2 方法
2.1 病毒 DNA 提取
2.2 巢式 PCR 擴(kuò)增
2.3 電泳鑒定
2.4 雙向測(cè)序
2.5 DNA 序列編輯
2.6 系統(tǒng)發(fā)生學(xué)分析
2.7 參照的核苷酸序列 GenBank 編碼
3 數(shù)據(jù)處理
結(jié)果
1. KS 的臨床表現(xiàn)及組織學(xué)特點(diǎn)
2. k12/T0.7 基因位點(diǎn)擴(kuò)增產(chǎn)物電泳結(jié)果
3. k12/T0.7 基因位點(diǎn) PCR 產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果
4. 實(shí)驗(yàn)所需的參考序列(灰色部分為本研究擴(kuò)增片段區(qū))
5. 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)
6. HHV-8 k12/T0.7 基因核苷酸序列和氨基酸序列之間的差異性
7. HHV-8 k12/T0.7 基因亞型與新疆 KS 相關(guān)因素的關(guān)系分析
討論
1. 新疆 KS 及其感染 HHV-8 的流行病學(xué)狀況
2. 新疆 KS 感染 HHV-8 的 k12/T0.7 基因亞型
3. HHV-8 k12/T0.7 基因亞型與新疆 KS 臨床損害的相關(guān)性
4. HHV-8 k12 基因亞型與新疆 KS 臨床類型的相關(guān)性
5. HHV-8 k12 基因亞型與新疆 AIDS-KS 發(fā)病的相關(guān)性
6. 小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
文獻(xiàn)綜述
參考文獻(xiàn)
附 1 新疆 KS 患者臨床資料及感染的 HHV-8 k12 基因亞型情況一覽表
致謝
作者簡(jiǎn)介
石河子大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文導(dǎo)師評(píng)閱表
本文編號(hào):3817405
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