研究背景白癜風(fēng)（vitiligo）是一種臨床常見的色素脫失性疾病,臨床上主要表現(xiàn)為邊界較為清晰的白色斑片,不同年齡和不用性別均可發(fā)生。皮損可發(fā)生于任何部位,尤其以暴露部位、摩擦部位好發(fā)。該病色素脫失的斑片是由于相關(guān)區(qū)域的黑素細(xì)胞逐漸減少和缺失所致。由于其具有損容性,嚴(yán)重影響患者的生活質(zhì)量。白癜風(fēng)的治療方法眾多,且不同個(gè)體對治療反應(yīng)的差異較大。對于白癜風(fēng)的發(fā)病機(jī)制,近年來的研究表明遺傳因素在白癜風(fēng)的發(fā)生發(fā)展過程中起到了十分重要的作用,除此之外,還包括自身免疫假說、氧化應(yīng)激、黑素細(xì)胞凋亡、角質(zhì)形成細(xì)胞功能異常等。白癜風(fēng)的病因尚不明確,它是一種涉及遺傳和環(huán)境因素的多因素疾病,多種因素都有可能導(dǎo)致疾病的發(fā)生,發(fā)病機(jī)理涉及到細(xì)胞生物學(xué)、神經(jīng)內(nèi)分泌學(xué)以及免疫學(xué)等領(lǐng)域,其中很多問題尚待解決。近幾十年來,許多遺傳學(xué)研究已被用來確定白癜風(fēng)的遺傳因素,如候選基因分析和連鎖研究等。近十年來,復(fù)雜疾病遺傳研究熱點(diǎn)主要集中于全基因組關(guān)聯(lián)分析（Genome-Wide Association Studies,GWAS）,并已應(yīng)用于白癜風(fēng),根據(jù)GWAS目錄發(fā)現(xiàn)了大約100種遺傳變異,然而部分基因或DNA元件在疾病發(fā)生... 

【文章來源】：安徽醫(yī)科大學(xué)安徽省

【文章頁數(shù)】：45 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

白癜風(fēng)RPS26和SUOX基因座基因和調(diào)控元件的優(yōu)先順序上圖顯示了白癜風(fēng)患者GWAS中SNPs的-log10（P值）

安徽醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文21Fig1.PrioritizinggenesandregulatoryelementsattheRPS26andSUOXlocusforvitiligo.Thetopplotshowslog10(P-values)ofSNPsfromGWASforvitiligo.Thereddiamondsandbluecirclesrepresentlog10(P-values)fromSMRtestsforassociationsofgeneexpressionandDNAmprobeswithvitiligo,respectively.ThesoliddiamondsandcirclesaretheprobesnotrejectedbytheHEIDItest.Thesecondplotshowslog10(P-values)oftheSNPassociationforgeneexpressionprobeENSG00000139531.8(taggingSUOX)andENSG00000197728.5(taggingRPS26)fromtheeQTLanalysisofGTExproject(useddatafromblood).Thethirdplotshowslog10(P-values)oftheSNPassociationsforDNAmprobecg08627212,cg00907267andcg22580629fromthemQTLstudy.Thebottomplotshowschromatinstatepredictionsacrossprimarycellsandtissuetypes.圖2.在白癜風(fēng)的GZMB位點(diǎn)基因和調(diào)控元件的優(yōu)先順序上圖顯示了來自GWAS的白癜風(fēng)的SNP的-log10（P值）。紅色菱形和藍(lán)色圓點(diǎn)分別代表來自SMR測試的-log10（P值），用于基因表達(dá)和DNA甲基化探針與白癜風(fēng)的關(guān)聯(lián)。實(shí)心標(biāo)注的是HEIDI方法未拒絕的探針。第二個(gè)圖顯示了來自CAGEeQTL分析的基因表達(dá)探針I(yè)LMN_2109489（標(biāo)記GZMB）的SNP關(guān)聯(lián)

.Thereddiamondsandbluecirclesrepresentlog10(P-values)fromSMRtestsforassociationsofgeneexpressionandDNAmprobeswithvitiligo,respectively.ThesoliddiamondsandcirclesaretheprobesnotrejectedbytheHEIDItest.Thesecondplotshowslog10(P-values)oftheSNPassociationforgeneexpressionprobeILMN_1706511(taggingTEF)fromtheCAGEeQTLanalysis.Thethirdplotshowslog10(P-values)oftheSNPassociationsforDNAmprobecg14911204fromthemQTLstudy.Thebottomplotshowschromatinstatepredictionsacrossprimarycellsandtissuetypes.圖4.白癜風(fēng)潛在調(diào)節(jié)機(jī)制的推斷甲基化的cg08343075存在于上調(diào)DEF8基因表達(dá)的增強(qiáng)子區(qū)。DEF8在白癜風(fēng)中下調(diào)，cg08343075在白


本文編號：3573503