[目的]探討可變剪切事件與黑色素瘤預(yù)后的相關(guān)性。[方法] 471例黑色素瘤患者的臨床信息下載自TCGA數(shù)據(jù)庫(kù),與患者對(duì)應(yīng)的可變剪切事件下載自TCGA SpliceSep數(shù)據(jù)庫(kù)。采用單因素Cox回歸分析篩選預(yù)后相關(guān)的可變剪切事件;采用Lasso回歸分析構(gòu)建預(yù)后模型,并計(jì)算黑色素瘤患者的風(fēng)險(xiǎn)值,對(duì)高低風(fēng)險(xiǎn)組繪制生存曲線,ROC曲線和風(fēng)險(xiǎn)曲線;隨后采用單因素和多因素Cox回歸分析進(jìn)行獨(dú)立預(yù)后分析。采用Metascape在線工具對(duì)預(yù)后相關(guān)的可變剪切基因進(jìn)行富集分析。[結(jié)果]設(shè)置閾值為P<0.05,篩選得到的預(yù)后相關(guān)的可變剪切事件共有1238例。Lasso回歸表明,采用MTMR14│63114│ES和BATF2│16723│AP的可變剪切事件PSI值作為預(yù)后模型,高風(fēng)險(xiǎn)組患者的生存時(shí)間減少,死亡人數(shù)增加。此外,預(yù)后模型作為獨(dú)立預(yù)后因子可準(zhǔn)確預(yù)測(cè)黑色素瘤患者的預(yù)后狀況。與預(yù)后相關(guān)的可變剪切基因富集的生物學(xué)功能主要包括細(xì)胞死亡的調(diào)節(jié),蛋白復(fù)合體組裝的調(diào)節(jié),GTP酶活性的調(diào)節(jié),核質(zhì)運(yùn)輸和DNA修復(fù)。[結(jié)論]預(yù)后相關(guān)的可變剪切事件可作為預(yù)后模型,較準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)黑色素瘤的預(yù)后狀況。 

【文章來(lái)源】：腫瘤學(xué)雜志. 2020,26(10)

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 數(shù)據(jù)收集
    1.2 預(yù)后相關(guān)的可變剪切事件的篩選
    1.3 構(gòu)建預(yù)后模型
    1.4 預(yù)后模型的檢驗(yàn)
    1.5 生存相關(guān)可變剪切基因的富集分析
2 結(jié)果
    2.1 預(yù)后相關(guān)可變剪切事件的篩選
    2.2 黑色素瘤患者預(yù)后模型的構(gòu)建
    2.3 預(yù)后模型的檢驗(yàn)
    2.4 預(yù)后相關(guān)可變剪切的富集分析
3 討論



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