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實(shí)時熒光環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增檢測毛癬菌屬方法的建立

發(fā)布時間:2021-03-13 03:06
  目的建立實(shí)時熒光環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增(Real-time Loop-mediated Isothermal Amplification,LAMP)技術(shù)檢測皮膚癬的方法,實(shí)現(xiàn)皮膚癬菌病的快速實(shí)驗(yàn)室診斷。方法通過在NCBI官網(wǎng)查找下載皮膚癬菌中毛癬菌屬、小孢子菌屬和表皮癬菌屬臨床分離率較高的菌種rRNA序列(18S rRNA,ITS1,5.8S rRNA,ITS2和28S rRNA),運(yùn)用DNASTAR Lasergene軟件進(jìn)行分析比對,尋找出毛癬菌屬內(nèi)高度保守的靶序列,且該段靶序列要與其他屬存在差異,運(yùn)用Primer Explorer V5設(shè)計LAMP引物。提取須癬毛癬菌NBRC6202基因組DNA作為模板篩選引物以及建立LAMP檢測毛癬菌屬的反應(yīng)體系,以紅色毛癬菌ATCC28188基因組DNA作為模板測試其敏感性和穩(wěn)定性,以毛癬菌屬以外的其他真菌、細(xì)菌基因組DNA驗(yàn)證LAMP反應(yīng)體系的特異性。結(jié)果篩選的4套引物里,primer2的擴(kuò)增效果較好,可在22 min檢測出須癬毛癬菌,且可以特異地檢測出紅色毛癬菌、指間毛癬菌、疣狀毛癬菌、許蘭毛癬菌、紫色毛癬菌。本研究建立的毛癬菌屬RT-LAMP檢... 

【文章來源】:中華臨床實(shí)驗(yàn)室管理電子雜志. 2020,8(04)

【文章頁數(shù)】:6 頁

【部分圖文】:

實(shí)時熒光環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增檢測毛癬菌屬方法的建立


毛癬菌屬4套引物擴(kuò)增曲線圖

實(shí)時熒光環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增檢測毛癬菌屬方法的建立


Primer2毛癬菌擴(kuò)增曲線圖

實(shí)時熒光環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增檢測毛癬菌屬方法的建立


Primer2非毛癬菌擴(kuò)增曲線圖


本文編號:3079466

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