WNT/Ca 2+ 通路在皮膚鱗狀細(xì)胞癌的作用及UVB調(diào)控ID4基因DNA甲基化的機(jī)制研究
發(fā)布時間:2021-03-10 20:33
皮膚鱗狀細(xì)胞癌是起源于表皮角質(zhì)所形成的皮膚附屬結(jié)構(gòu)的一種惡性腫瘤,皮膚鱗狀細(xì)胞癌發(fā)病率在皮膚惡性腫瘤中僅次于基底細(xì)胞癌占居第二位,且近年來發(fā)病率呈增高趨勢。盡管早期CSCC手術(shù)切除預(yù)后較好,但轉(zhuǎn)移性CSCC病例因病灶位置及轉(zhuǎn)移程度不同而難以治療,部分病例死亡率超過70%。另外,對于好發(fā)于頭面部的鱗癌患者,面臨著創(chuàng)面缺損修補(bǔ)、美容要求及器官功能障礙等多方面挑戰(zhàn)。因此,仍然急需研究其發(fā)病機(jī)理尋找新的生物學(xué)標(biāo)記及治療方法來診斷、縮小瘤體大小、抑制腫瘤侵襲和復(fù)發(fā)CSCC。WNT5a主要通過WNT/Ca2+和WNT/PCP途徑參與非經(jīng)典WNT通路。然而,WNT5a及其同源受體在癌癥中的作用一直備受爭議。依據(jù)不同的癌癥類型,WNT5a具有促進(jìn)或抑制腫瘤的作用。已有報(bào)道運(yùn)用微陣列技術(shù)發(fā)現(xiàn),與日光角化和正常皮膚相比,WNT5a在CSCC中表達(dá)升高。但是其具體作用及機(jī)制仍然不清。本研究利用全基因組RNA測序(RNA-seq)得出非經(jīng)典WNT通路上的FZD4、PLCβ4、NFATc4基因在癌癥中表達(dá)降低,而WNT5amRNA表達(dá)水平未見顯著差異。本研究首先通過擴(kuò)大組織樣本對測序結(jié)果進(jìn)...
【文章來源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:148 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1差異基因的聚類分析
2.3?GO功能性分析??Go富集性分析包括生物學(xué)過程、細(xì)胞組分和分子功能三個層面。從生物過??程方面(圖3),差異表達(dá)基因主要富集在細(xì)胞粘附,生物粘附和細(xì)胞-細(xì)胞信??號傳導(dǎo);從細(xì)胞組分(圖3)方面,差異基因主要富集在通過質(zhì)膜固有成分,蛋??白質(zhì)細(xì)胞外基質(zhì)和質(zhì)膜固有;從分子功能方面(圖3),差異表達(dá)基因主要富集??在與鈣離子結(jié)合,離子結(jié)合,陽離子結(jié)合相關(guān)功能。??Biological?Process?Cellular?Component??.?intrinsic?to?membrane?二m:?。?nn-TT??organic?add?metabolic?process?plasma?membrane??systemOevelopmen.?_?cell?penphery? ̄?????mumcellularorganismal?development?L',一..—?一??single-multicelluiar?organism?process?ion?channel?complex??multicellular?organismal?process?plasma?membrane?part??nervcxjs?system?development?extracellular?region?part??developmental?process?extracellular?matrix??cell-cell?signaling?intrinsic?to?plasma?membrane??biologica
中發(fā)生?18460?個低甲基化(Hypo-DMC)和?31724個高甲基化(Hyper-DMC)位??點(diǎn)(表2);冢模停眉谆垲惙治霭l(fā)現(xiàn),所有的癌旁組織與癌癥組織可以??顯著地分成兩簇(圖5)。不同基因組元件類型的DMC對基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)影響不??同,CpG島(CGI)甲基化與基因表達(dá)負(fù)相關(guān),而重復(fù)序列(repeat)甲基化與??基因表達(dá)正相關(guān)(圖6)。挑選DMC-CGI甲基化與差異基因表達(dá)呈負(fù)相關(guān)的基??因,DMC-repeat甲基化與差異基因表達(dá)呈正相關(guān)的基因,進(jìn)一步對這些基因的??20??
本文編號:3075243
【文章來源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:148 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1差異基因的聚類分析
2.3?GO功能性分析??Go富集性分析包括生物學(xué)過程、細(xì)胞組分和分子功能三個層面。從生物過??程方面(圖3),差異表達(dá)基因主要富集在細(xì)胞粘附,生物粘附和細(xì)胞-細(xì)胞信??號傳導(dǎo);從細(xì)胞組分(圖3)方面,差異基因主要富集在通過質(zhì)膜固有成分,蛋??白質(zhì)細(xì)胞外基質(zhì)和質(zhì)膜固有;從分子功能方面(圖3),差異表達(dá)基因主要富集??在與鈣離子結(jié)合,離子結(jié)合,陽離子結(jié)合相關(guān)功能。??Biological?Process?Cellular?Component??.?intrinsic?to?membrane?二m:?。?nn-TT??organic?add?metabolic?process?plasma?membrane??systemOevelopmen.?_?cell?penphery? ̄?????mumcellularorganismal?development?L',一..—?一??single-multicelluiar?organism?process?ion?channel?complex??multicellular?organismal?process?plasma?membrane?part??nervcxjs?system?development?extracellular?region?part??developmental?process?extracellular?matrix??cell-cell?signaling?intrinsic?to?plasma?membrane??biologica
中發(fā)生?18460?個低甲基化(Hypo-DMC)和?31724個高甲基化(Hyper-DMC)位??點(diǎn)(表2);冢模停眉谆垲惙治霭l(fā)現(xiàn),所有的癌旁組織與癌癥組織可以??顯著地分成兩簇(圖5)。不同基因組元件類型的DMC對基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)影響不??同,CpG島(CGI)甲基化與基因表達(dá)負(fù)相關(guān),而重復(fù)序列(repeat)甲基化與??基因表達(dá)正相關(guān)(圖6)。挑選DMC-CGI甲基化與差異基因表達(dá)呈負(fù)相關(guān)的基??因,DMC-repeat甲基化與差異基因表達(dá)呈正相關(guān)的基因,進(jìn)一步對這些基因的??20??
本文編號:3075243
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