LncRNA及RNA m6A甲基化在肢端型黑色素瘤中發(fā)病機(jī)制的初步研究
發(fā)布時(shí)間:2021-02-23 00:32
CMM是高度惡性的皮膚腫瘤,其發(fā)生和發(fā)展歸因于獨(dú)立或聯(lián)合的遺傳和表觀遺傳事件。在遺傳改變方面,對(duì)了解CMM發(fā)病機(jī)制取得了顯著進(jìn)展。最近的研究揭示了 RNA相關(guān)表觀遺傳機(jī)制在基因表達(dá)調(diào)控中的重要參與,包括非編碼RNA的多種活性以及RNA甲基化;谡n題組前期研究結(jié)果,本課題對(duì)THOC2 RNAi的A375細(xì)胞進(jìn)行IncRNA表達(dá)譜分析,發(fā)現(xiàn)了包括Lnc-PKNOX1-1在內(nèi)的一系列相關(guān)lncRNA存在表達(dá)差異,并在亞洲人好發(fā)的CMM亞型ALM的腫瘤組織中得到了驗(yàn)證。此外,RNA甲基化修飾相關(guān)研究在腫瘤領(lǐng)域取得了突破性進(jìn)展,其參與了多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展過(guò)程,與免疫治療耐受的發(fā)生密切相關(guān),基于此,本課題分析了RNA甲基化修飾與ALM的相關(guān)性,并測(cè)定了甲基化修飾相關(guān)酶在ALM組織中的表達(dá)情況。為接下來(lái)的Lnc-PKNOX 1-1及RNA甲基化修飾參與ALM發(fā)病機(jī)制的深入研究指明了方向。第一部分:LncRNA表達(dá)譜芯片篩選ALM相關(guān)LncRNA目的:探討lncRNA在ALM中的作用和相關(guān)機(jī)制。方法:構(gòu)建THOC2 RNAi的A375細(xì)胞系,以未處理的A375細(xì)胞系作為對(duì)照組進(jìn)行l(wèi)ncRNA表達(dá)譜分...
【文章來(lái)源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:49 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.轉(zhuǎn)染后各組細(xì)胞中THOC2表達(dá)水平??3.2?IncRNA表達(dá)譜分析??
3.2?IncRNA表達(dá)譜分析??選取?THOC2-2147siRNA?的?A375?細(xì)胞進(jìn)行?IncRNA?芯片分析,THOC2-2147??siRNA及對(duì)照組A375細(xì)胞表達(dá)譜之間相對(duì)差異的聚類(lèi)分析見(jiàn)圖2,其中包括??lnc-PKNOXl-1在內(nèi)的IncRNA表達(dá)顯著下調(diào)。此外,KEGG信號(hào)通路富集圖顯??示THOC2沉默后A375細(xì)胞PTEN/PI3K/AKT信號(hào)通路顯著衰減。(圖3)??15??
siRNA及對(duì)照組A375細(xì)胞表達(dá)譜之間相對(duì)差異的聚類(lèi)分析見(jiàn)圖2,其中包括??lnc-PKNOXl-1在內(nèi)的IncRNA表達(dá)顯著下調(diào)。此外,KEGG信號(hào)通路富集圖顯??示THOC2沉默后A375細(xì)胞PTEN/PI3K/AKT信號(hào)通路顯著衰減。(圖3)??15??
本文編號(hào):3046766
【文章來(lái)源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:49 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.轉(zhuǎn)染后各組細(xì)胞中THOC2表達(dá)水平??3.2?IncRNA表達(dá)譜分析??
3.2?IncRNA表達(dá)譜分析??選取?THOC2-2147siRNA?的?A375?細(xì)胞進(jìn)行?IncRNA?芯片分析,THOC2-2147??siRNA及對(duì)照組A375細(xì)胞表達(dá)譜之間相對(duì)差異的聚類(lèi)分析見(jiàn)圖2,其中包括??lnc-PKNOXl-1在內(nèi)的IncRNA表達(dá)顯著下調(diào)。此外,KEGG信號(hào)通路富集圖顯??示THOC2沉默后A375細(xì)胞PTEN/PI3K/AKT信號(hào)通路顯著衰減。(圖3)??15??
siRNA及對(duì)照組A375細(xì)胞表達(dá)譜之間相對(duì)差異的聚類(lèi)分析見(jiàn)圖2,其中包括??lnc-PKNOXl-1在內(nèi)的IncRNA表達(dá)顯著下調(diào)。此外,KEGG信號(hào)通路富集圖顯??示THOC2沉默后A375細(xì)胞PTEN/PI3K/AKT信號(hào)通路顯著衰減。(圖3)??15??
本文編號(hào):3046766
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