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LncRNA及RNA m6A甲基化在肢端型黑色素瘤中發(fā)病機制的初步研究

發(fā)布時間:2021-02-23 00:32
  CMM是高度惡性的皮膚腫瘤,其發(fā)生和發(fā)展歸因于獨立或聯(lián)合的遺傳和表觀遺傳事件。在遺傳改變方面,對了解CMM發(fā)病機制取得了顯著進展。最近的研究揭示了 RNA相關表觀遺傳機制在基因表達調控中的重要參與,包括非編碼RNA的多種活性以及RNA甲基化�;谡n題組前期研究結果,本課題對THOC2 RNAi的A375細胞進行IncRNA表達譜分析,發(fā)現(xiàn)了包括Lnc-PKNOX1-1在內的一系列相關lncRNA存在表達差異,并在亞洲人好發(fā)的CMM亞型ALM的腫瘤組織中得到了驗證。此外,RNA甲基化修飾相關研究在腫瘤領域取得了突破性進展,其參與了多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展過程,與免疫治療耐受的發(fā)生密切相關,基于此,本課題分析了RNA甲基化修飾與ALM的相關性,并測定了甲基化修飾相關酶在ALM組織中的表達情況。為接下來的Lnc-PKNOX 1-1及RNA甲基化修飾參與ALM發(fā)病機制的深入研究指明了方向。第一部分:LncRNA表達譜芯片篩選ALM相關LncRNA目的:探討lncRNA在ALM中的作用和相關機制。方法:構建THOC2 RNAi的A375細胞系,以未處理的A375細胞系作為對照組進行l(wèi)ncRNA表達譜分... 

【文章來源】:北京協(xié)和醫(yī)學院北京市 211工程院校 985工程院校

【文章頁數(shù)】:49 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

LncRNA及RNA m6A甲基化在肢端型黑色素瘤中發(fā)病機制的初步研究


圖1.轉染后各組細胞中THOC2表達水平??3.2?IncRNA表達譜分析??

聚類分析,信號通路,芯片分析,相對差異


3.2?IncRNA表達譜分析??選取?THOC2-2147siRNA?的?A375?細胞進行?IncRNA?芯片分析,THOC2-2147??siRNA及對照組A375細胞表達譜之間相對差異的聚類分析見圖2,其中包括??lnc-PKNOXl-1在內的IncRNA表達顯著下調。此外,KEGG信號通路富集圖顯??示THOC2沉默后A375細胞PTEN/PI3K/AKT信號通路顯著衰減。(圖3)??15??

信號通路,富集,相對差異


siRNA及對照組A375細胞表達譜之間相對差異的聚類分析見圖2,其中包括??lnc-PKNOXl-1在內的IncRNA表達顯著下調。此外,KEGG信號通路富集圖顯??示THOC2沉默后A375細胞PTEN/PI3K/AKT信號通路顯著衰減。(圖3)??15??


本文編號:3046766

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