本文關鍵詞：ERAP1，TRAF3IP2，TNFAIP3和HLA-C基因交互作用與中國漢族人銀屑病相關性研究，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：研究背景銀屑病(Psoriasis, PS,OMIM*177900)是一種多基因共同作用下的慢性復發(fā)性自身免疫疾病,以紅斑、鱗屑為主要臨床表現(xiàn)。目前銀屑病的病因尚不完全清楚,多數(shù)學者認為銀屑病由多基因遺傳及環(huán)境因素共同作用,通過免疫介導的共同通路最終引起角質形成細胞過度增殖而發(fā)病。大量的遺傳流行病學調查研究發(fā)現(xiàn)銀屑病發(fā)病有著顯著的遺傳學基礎。國內外報道的有家族史患者的百分比分別為10%-23.8%和30%；有家族史者發(fā)病早于無家族史者,父母同患銀屑病者發(fā)病早于雙親正常者。同時,銀屑病易感基因研究是目前銀屑病遺傳學領域的研究熱點,世界范圍內許多研究團隊運用定位克隆和全基因組掃描等分子遺傳學技術和方法,在1p、1q、2q、3q、4q、6p、8q、14q、16q、17q、19q、19p和20p等染色體上發(fā)現(xiàn)了銀屑病易感區(qū)域,連鎖和關聯(lián)分析研究在這些區(qū)域內進一步確定了CCHCR1、HLA-C、HCG27、POU5F1、TCF19、CDSN、LCE3D、LCE3A、 IL12B、IL23R、IL15和IL20等銀屑病的易感基因。我們研究團隊前期的全基因組關聯(lián)分析(Genome-wide association study, GWAS)研究也發(fā)現(xiàn)了大量的銀屑病的易感基因。近年來,基因與基因的交互作用作為一種新的研究方向,為進一步揭示疾病發(fā)病機制提供了新的遺傳學證據(jù)。高加索銀屑病人群的GWAS數(shù)據(jù)已證實了ERAP1和HLA-C, TNFAIP3和HLA-C之間的基因基因交互作用與銀屑病發(fā)病風險顯著相關。 目的分析ERAP1(rs151823), TRAF3IP2(rs240993),TNFA1P3(rs640353,rs610604)與HLA-C(rs1265181)的基因交互作用對中國漢族人銀屑病發(fā)病的影響。討論不同種群間基因基因交互作用的生物學基礎,進一步揭示銀屑病的發(fā)病機制。 方法本研究首先對相關數(shù)據(jù)進行整理,5個SNP點的基因分型數(shù)據(jù)均來自于我們團隊前期GWAS研究,即4747份銀屑病病例和7104份正常對照,均為中國漢族人。對質控后的數(shù)據(jù)用Plink1.07分析并輸出結果,并運用卡方檢驗確立兩兩基因交互作用的最佳關聯(lián)模型。Excel2003建庫,雙錄入資料；哈迪-溫伯格平衡(Hardy-Weinberg Equilibrium,HWE)檢測采用STATA10.0進行統(tǒng)計評估；卡方檢驗和t檢驗均采用SPSS11.5統(tǒng)計軟件進行分析。SNPs位點與疾病的關聯(lián)強度以優(yōu)勢比(Odds Ratios,OR)、95%置信區(qū)間(Confidence Intervals,CI)表示,以a=0.05為檢驗水準。用logistic回歸方法分析ERAP1(rs151823),TRAF3IP2(rs240993), TNFAIP3(rs640353,rs610604), HLA-C (rs1265181)基因交互作用模型與銀屑病發(fā)病風險的關聯(lián)。 結果ERAP1(rs1265181)和HLA-C(rs151823)的交互作用與銀屑病發(fā)病風險有顯著關聯(lián)(chisq=17.36, p=0.0002)。統(tǒng)計學聯(lián)合效應顯示,存在rs1265181的風險等位基因A時,銀屑病患病風險明顯增加,基因型GQAG和AA的OR值分別是17.73,24.8和25.24。我們的研究不能為TRAF3IP2(rs240993)和HLA-C(rs1265181)之間的交互作用影響銀屑病發(fā)病提供證據(jù)(chisq=2.41,p=0.3004),以上結果與既往歐洲人群的研究結果一致。但是,TNFAIP3(rs640353)和HLA-C (rs1265181)(chisq=0.24, p=0.6228)之間,rNFAIP3(rs610604)和HLA-C (rs1265181)(ch isq=0.68,p=0.8773)之間的交互作用與銀屑病發(fā)病風險的關聯(lián)性在我們的研究中未被證實,這與歐洲人群的研究結果有差異。 結論本研究發(fā)現(xiàn)ERAP1(rs1265181)和HLA-C(rs151823)在中國漢族人銀屑病發(fā)病過程中有顯著的交互作用,ERAP1基因參與HLA-I類分子翻譯后的加工,共同產生的HLA-I類抗原啟動和調節(jié)機體的免疫應答,二者可能通過以上途徑誘發(fā)銀屑病。我們的研究未發(fā)現(xiàn)TRAF3IP2(rs240993)和HLA-C(rs1265181)交互作用導致銀屑病的證據(jù),可能二者不在一條信號通路上,或者它們通過媒介間接地產生相互作用。與國外研究結果不一致的是,在我們的研究中TNFAIP3(rs640353)和HLA-C(rs126518),TNFAIP3(rs610604)和HLA-C(rs1265181)的交互作用與銀屑病的發(fā)病不存在明顯關聯(lián)。上述結果可能是由于我們的研究選取的SNP點較少,也可能提示不同種群之間的基因交互作用對疾病的影響存在遺傳異質性。
【關鍵詞】：銀屑病 HLA-C ERAP1 TNFAIP3 TRAF3IP2 基因交互作用
【學位授予單位】：安徽醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2013
【分類號】：R758.63
【目錄】：

• 英文縮寫詞表7-8
• 中文摘要8-11
• Abstract11-13
• 1. 引言13-16
• 2. 材料和方法16-38
• 2.1 調查表的設計16-17
• 2.2 臨床資料收集及錄入過程中質量控制方法17
• 2.3 研究對象17-18
• 2.4 實驗試劑18-20
• 2.4.1 DNA提取試劑18
• 2.4.2 電泳用試劑18-19
• 2.4.3 標準化DNA用試劑19
• 2.4.4 基因分型用試劑19-20
• 2.5 實驗儀器20-22
• 2.5.1 DNA提取器材20
• 2.5.2 測OD值儀器20
• 2.5.3 電泳的儀器20-21
• 2.5.4 基因分型儀器21-22
• 2.6 實驗方法22-24
• 2.6.1 全血標本采集22
• 2.6.2 基因組DNA提取22-23
• 2.6.3 基因組DNA電泳23-24
• 2.6.4 DNA濃度標準化24
• 2.7 全基因組基因分型方法24-30
• 2.7.1 基因芯片制作24-30
• 2.7.2 基因芯片掃描30
• 2.8 Sequenom Mas sArray系統(tǒng)基因分型30-35
• 2.8.1 引物設計及合成30-31
• 2.8.2 引物稀釋及注意事項31-32
• 2.8.3 Sequenom Ma s sArray系統(tǒng)基因分型32-35
• 2.9 分析軟件和電子數(shù)據(jù)庫查詢信息35-37
• 2.9.1 基因分型軟件PLINK 1.0735-36
• 2.9.2 美國國立生物技術信息中心36
• 2.9.3 統(tǒng)計分析軟件STATA 10.036
• 2.9.4 統(tǒng)計分析軟件SPSS 11.536-37
• 2.10 SNPs的選擇37
• 2.11 統(tǒng)計分析方法37-38
• 3. 結果38-40
• 4. 討論40-43
• 5. 結論43-44
• 6. 參考文獻44-47
• 附錄47-49
• 致謝49-51
• 課題綜述51-58
• 參考文獻55-58
• 發(fā)表綜述58-66
• 參考文獻64-66

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 楊森,魏生才,張學軍,陳珊宇,王紅艷;尋常型銀屑病誘因流行病學研究[J];中國麻風皮膚病雜志;2000年03期

2 靳培英;可能誘發(fā)和加重銀屑病的藥物[J];中華皮膚科雜志;2005年07期

  本文關鍵詞：ERAP1，TRAF3IP2，TNFAIP3和HLA-C基因交互作用與中國漢族人銀屑病相關性研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號：289644