ERAP1基因多態(tài)性與漢族人尋常型銀屑病表型的相關(guān)性研究
發(fā)布時(shí)間:2019-10-12 05:15
【摘要】:研究背景銀屑病(Psoriasis,OMIM*177900)是一種以紅斑、鱗屑為典型表現(xiàn)的慢性復(fù)發(fā)性炎癥性皮膚病,其發(fā)病有復(fù)雜的免疫學(xué)基礎(chǔ),包括角質(zhì)形成細(xì)胞增生,表皮分化異常等。漢族人群中的發(fā)病率約為0.123%。遺傳因素和復(fù)雜的環(huán)境因素在疾病的進(jìn)展中起重要作用。尋常型銀屑病(Psoriasis Vulgaris,PV)是最常見(jiàn)的臨床類(lèi)型,占90%以上。本課題組通過(guò)全基因組關(guān)聯(lián)分析(Genome-wide Association Study,GWAS)研究在國(guó)際上首次報(bào)道了漢族人尋常型銀屑病易感性與ERAP1(rs151823)基因多態(tài)性顯著相關(guān),位于5號(hào)染色體長(zhǎng)臂5q15上的ERAP1是漢族人銀屑病的易感基因。 目的對(duì)尋常型銀屑病發(fā)病年齡、家族史及臨床類(lèi)型進(jìn)行分層分析,在漢族人群中研究ERAP1基因單核苷酸多態(tài)性(rs151823)位點(diǎn)與尋常型銀屑病患者臨床表型的相關(guān)性,為進(jìn)一步探討銀屑病的發(fā)病機(jī)制提供重要的遺傳學(xué)依據(jù)。 方法7,717例PV患者和11,831例正常對(duì)照的ERAP1基因多態(tài)位點(diǎn)rs151823的基因分型(AA,CA,CC)資料均來(lái)源于本課題組銀屑病全基因組關(guān)聯(lián)分析的分型數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)資料經(jīng)適當(dāng)轉(zhuǎn)化后應(yīng)用社會(huì)科學(xué)統(tǒng)計(jì)軟件包SPSS 15.0對(duì)資料進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。χ~2檢驗(yàn)用于比較各組間ERAP1基因多態(tài)位點(diǎn)rs151823基因型和等位基因的頻率分布。P值小于0.05則認(rèn)為有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。 結(jié)果1.病例組與對(duì)照組的基因型頻率分布總體差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ~2=34.25,df=2,P=3.65×10~(-8)),病例組與對(duì)照組的等位基因頻率分布差異亦具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ~2=31.60,df=1, P=1.89×10~(-8),OR 1.12,95%CI 1.08-1.17)。2.早發(fā)患者與對(duì)照間的基因型和等位基因頻率分布差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(基因型:χ~2=40.52,df=2,P=1.59×10~(-9);等位基因:χ~2=37.69,df=1,P=8.28×10~(-10),OR 1.14,95%CI 1.09-1.19)。而晚發(fā)患者與對(duì)照間的基因型和等位基因頻率分布差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(基因型:χ~2=0.17,df=2,P=0.92;等位基因:χ~2=0.01,df=1,P=0.91,OR 1.01,95%CI 0.92-1.10)。早發(fā)患者與晚發(fā)患者間的基因型和等位基因頻率分布差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(基因型:χ~2=7.37,df=2,P=0.025,P_(AA)=0.04,P_(CA)=0.86,P_(CC)=0.018;等位基因:χ~2=6.96,df=1,P=0.008,OR 1.14,95%CI 1.03-1.25)。3.少兒發(fā)病患者與對(duì)照間的基因型和等位基因頻率分布差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(基因型:χ~2=21.81,df=2,P=1.84×10~(-5);等位基因:χ~2=18.86,df=1,P=1.41×10~(-5),OR 1.16,95%CI 1.09-1.25)。成人發(fā)病患者與對(duì)照間的基因型和等位基因頻率分布差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(基因型:χ~2=22.43,df=2,P=1.35×10~(-5);等位基因:χ~2=21.38,df=1,P=3.76×10~(-6),OR 1.11,95%CI 1.06-1.16)。少兒發(fā)病患者與成人發(fā)病患者間的基因型和等位基因頻率分布差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(基因型:χ~2=2.93,df=2,P=0.23,P_(AA)=0.68,P_(CA)=0.30,P_(CC)=0.09;等位基因:χ~2=1.58,df=1,P=0.21,OR 1.05,95%CI 0.97-1.13)。4.家族史陽(yáng)性患者與對(duì)照間的基因型和等位基因頻率分布差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(基因型:χ~2=22.30,df=2,P=1.43×10~(-5);等位基因:χ~2=21.53,df=1,P=3.48×10~(-6),OR 1.18,95%CI 1.10-1.26)。家族史陰性患者與對(duì)照間的基因型和等位基因頻率分布差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(基因型:χ~2=22.14,df=2,P=1.56×10~(-5);等位基因:χ~2=20.06,df=1,P=7.50×10~(-6),OR 1.11,95%CI 1.06-1.16)。家族史陽(yáng)性患者與家族史陰性患者間的基因型和等位基因頻率分布差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(基因型:χ~2=2.81,df=2,P=0.25,P_(AA)=0.16,P_(CA)=0.86,P_(CC)=0.19;等位基因:χ~2=2.70,df=1,P=0.10,OR 1.06,95%CI 0.99-1.15)。5.急性點(diǎn)滴型患者與對(duì)照間的基因型和等位基因頻率分布差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(基因型:χ~2=10.22,df=2,P=0.006;等位基因:χ~2=7.09,df=1,P=0.008,OR 1.10,95%CI 1.02-1.17)。慢性斑塊型患者與對(duì)照間的基因型和等位基因頻率分布差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(基因型:χ~2=31.40,df=2,P=1.52×10~(-7);等位基因:χ~2=30.28,df=1,P=3.74×10~(-8),OR 1.13,95%CI 1.08-1.19)。慢性斑塊型患者與急性點(diǎn)滴型患者間的基因型和等位基因頻率分布差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義 (基因型:χ~2=2.30,df=2,P=0.32,PAA=0.14,PCA=0.22,PCC=0.93;等位基因:χ~2=0.93,df=1,P=0.34,OR 1.04,95%CI 0.96-1.11)。 結(jié)論1. ERAP1基因(rs151823)遺傳多態(tài)性與中國(guó)漢族人群PV的易感性相關(guān),尤其與早發(fā)型銀屑病相關(guān)性更明顯;2.早發(fā)型銀屑病患者和晚發(fā)型銀屑病患者間ERAP1基因遺傳多態(tài)位點(diǎn)rs151823的作用有顯著差異。ERAP1基因(rs151823)遺傳多態(tài)性與漢族人PV的發(fā)病年齡有明顯相關(guān)性;3. ERAP1基因(rs151823)遺傳多態(tài)性與漢族人PV的有無(wú)家族史無(wú)相關(guān)性;4. ERAP1基因(rs151823)遺傳多態(tài)性與漢族人PV的臨床類(lèi)型無(wú)相關(guān)性;5. ERAP1基因(rs151823)遺傳多態(tài)性對(duì)漢族人PV的有無(wú)家族史及臨床類(lèi)型影響較弱,可能源自銀屑病復(fù)雜的遺傳背景和不同的發(fā)病機(jī)制。
【學(xué)位授予單位】:安徽醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2011
【分類(lèi)號(hào)】:R758.63
本文編號(hào):2547906
【學(xué)位授予單位】:安徽醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2011
【分類(lèi)號(hào)】:R758.63
【參考文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):2547906
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