【摘要】：目的:通過生物大數(shù)據(jù)挖掘,探討長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA)與黑色素瘤發(fā)生發(fā)展的關系。方法:從基因表達綜合數(shù)據(jù)庫中的黑色素瘤m RNA表達譜數(shù)據(jù)集GSE15605中提取出一些lncRNA的表達信息,并分析這些lncRNA與黑色素瘤的關聯(lián)關系。結果:LINC01213,PGM5-AS1,LINC01133和LOC284578共4個lncRNA與黑色素瘤的發(fā)生和轉移顯著相關,其中LINC01213,LINC01133和LOC284578的表達可被BRAF基因突變影響,而PGM5-AS1的表達能被NRA S基因突變影響。利用這4個lncRNA的表達值構建的預測模型可較好地區(qū)分正常樣本、初發(fā)黑色素瘤樣本和轉移性黑色素瘤樣本。結論:Lnc RNA可能在黑色素瘤的發(fā)生和轉移中起重要作用。
[Abstract]:Objective: to explore the relationship between long chain noncoding RNA (long noncoding RNA and melanoma by biological big data mining. Methods: some lncRNA expression information was extracted from the m RNA expression data set of melanoma in gene expression synthesis database, and the relationship between lncRNA and melanoma was analyzed. Results four lncRNA genes, PGM5-AS1 and LOC284578, were significantly associated with the occurrence and metastasis of melanoma. The expression of LINC01213LINC01133 and LOC284578 could be affected by BRAF gene mutation, while PGM5-AS1 expression could be affected by NRA S gene mutation. The predictive model constructed by using these four lncRNA expression values can be used to distinguish normal samples, primary melanoma samples and metastatic melanoma samples. Conclusion: LNC RNA may play an important role in the development and metastasis of melanoma.
【作者單位】： 中南大學湘雅醫(yī)院臨床藥理研究所;中南大學臨床藥理研究所湖南省遺傳藥理學重點實驗室;
【基金】：國家自然科學基金(81403017)~~
【分類號】：R739.5

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本文編號：2194600