吉林省扶余地區(qū)35例兒童孢子絲菌病的分離菌株的基因鑒定
發(fā)布時(shí)間:2018-04-26 11:18
本文選題:申克孢子絲菌 + 基因測(cè)定 ; 參考:《吉林大學(xué)》2012年碩士論文
【摘要】:目的: 對(duì)吉林省扶余地區(qū)兒童孢子絲菌病進(jìn)行流行病學(xué)分析并對(duì)其部分分離菌株進(jìn)行基因鑒定,并與同時(shí)期吉林省非扶余地區(qū)孢子絲菌病的分離菌株基因?qū)Ρ,了解該地區(qū)孢子絲菌基因是否發(fā)生變異,導(dǎo)致該地區(qū)菌株致病力增強(qiáng)致使發(fā)病率增高;同時(shí)對(duì)臨床上引起1例皮膚播散型孢子絲菌病的分離菌株進(jìn)行基因鑒定,并與臨床表現(xiàn)為淋巴管型及固定型孢子絲菌病的分離菌株進(jìn)行比較,了解其基因水平上的異同。 方法: 通過收集2011年1月1日至2011年4月30日來自吉林省扶余地區(qū)就診于我科門診并確診為孢子絲菌病的患兒35例,進(jìn)行流行病學(xué)分析,并從35例兒童孢子絲菌病的分離菌株中選取7株菌株,其中包括固定型孢子絲菌4株和淋巴管型的孢子絲菌3株,用常規(guī)真菌學(xué)方法進(jìn)行鑒定,并對(duì)其核糖體保守區(qū)及ITS、NTS區(qū)進(jìn)行基因鑒定;收集吉林省非扶余地區(qū)1例臨床表現(xiàn)為皮膚播散型孢子絲菌病的菌株,用常規(guī)真菌學(xué)方法進(jìn)行鑒定,并對(duì)其核糖體保守區(qū)及ITS、NTS區(qū)進(jìn)行基因鑒定。上述所有菌株的基因鑒定結(jié)果均與吉林省非扶余地區(qū)的固定型及淋巴管型孢子絲菌進(jìn)行比較,了解基因水平上的異同。 結(jié)果: 1、吉林省扶余地區(qū)兒童孢子絲菌病的流行病學(xué)分析:本次發(fā)病主要累及地區(qū)為扶余縣弓棚子鎮(zhèn)及三家子鎮(zhèn),余散發(fā)病例為扶余縣的其他地區(qū);患兒病史1個(gè)月至6個(gè)月不等,平均3.00±1.29月;年齡80天至13歲不等,平均5.96±3.80歲;男性患兒23例,占65.71%,女性患兒12例,占34.29%,男女比例為1.92:1;固定型26例,占74.29%,淋巴管型9例,占35.71%。 2、核糖體保守區(qū)及ITS基因測(cè)定:吉林省扶余地區(qū)兒童孢子絲菌中1株淋巴管型孢子絲菌菌株基因長(zhǎng)度為376bp,與基因庫中的3株申克孢子絲菌菌株(KMU3509,KMU3993,Duke3751)相似性達(dá)100%;該地區(qū)其余6株菌株及非扶余地區(qū)的固定型、淋巴管型及播散型孢子絲菌共3株菌株均與基因庫中3株申克孢子絲菌菌株(KMU3509,KMU3993,,Duke3751)相似性達(dá)99%以上。 3、不同菌株NTS區(qū)的差異主要由堿基缺失引起。 4、吉林省非扶余地區(qū)的固定型及淋巴管型孢子絲菌NTS區(qū)測(cè)定:固定型孢子絲菌NTS序列,與基因庫中Dum12相似性達(dá)百分之百;淋巴管型孢子絲菌與固定型孢子絲菌NTS序列相似性高達(dá)98%。為使本實(shí)驗(yàn)菌株NTS區(qū)測(cè)序結(jié)果有統(tǒng)一的對(duì)照標(biāo)準(zhǔn),將固定型孢子絲菌作為標(biāo)準(zhǔn)對(duì)照菌株。 5、吉林省扶余地區(qū)菌株NTS基因測(cè)定:7株分離菌株中1株固定型孢子絲菌與標(biāo)準(zhǔn)對(duì)照株NTS序列完全一致;1株固定型及1株淋巴管型菌株與標(biāo)準(zhǔn)對(duì)照株相比可見個(gè)別堿基缺失,未發(fā)現(xiàn)有特異性;2株固定型及1株淋巴管型孢子絲菌與標(biāo)準(zhǔn)對(duì)照株相比除個(gè)別堿基缺失位點(diǎn)不一致外,在208 232bp區(qū)間可見不連續(xù)10個(gè)堿基的缺失,且缺失位點(diǎn)完全一致;1株淋巴管型孢子絲菌與標(biāo)準(zhǔn)對(duì)照株相比在208-249bp區(qū)間可見21個(gè)堿基的不連續(xù)缺失。7株菌中4株菌NTS區(qū)可見明顯的堿基缺失,占所有菌株的57.14%。 6、播散型孢子絲菌NTS基因測(cè)定:固定型和淋巴管型孢子絲菌NTS區(qū)相似性達(dá)98%,序列差異不大;播散型孢子絲菌與淋巴管型及固定型孢子絲菌相比在208 232bp區(qū)間可見相同位點(diǎn)的10個(gè)不連續(xù)堿基的缺失。 7、扶余地區(qū)2株固定型、1株淋巴管型孢子絲菌及非扶余地區(qū)1株播散型孢子絲菌與標(biāo)準(zhǔn)對(duì)照株相比除個(gè)別堿基缺失位點(diǎn)不一致外,在208 232bp區(qū)間均可見不連續(xù)10個(gè)堿基的缺失,且缺失位點(diǎn)完全一致。 結(jié)論: 1、核糖體基因保守區(qū)及ITS區(qū)保守性高,在申克孢子絲菌菌種鑒定上有極高的特異性。 2、吉林省扶余地區(qū)7株孢子絲菌菌株,其中4株(占57.14%)可見較多的堿基缺失,推測(cè)該地區(qū)菌株可能由于NTS堿基缺失而導(dǎo)致其致病力增強(qiáng),從而使該地區(qū)短時(shí)間內(nèi)發(fā)病率增高。 3、與固定型及淋巴管型孢子絲菌NTS區(qū)相比,播散型孢子絲菌NTS區(qū)可見10個(gè)相同位點(diǎn)的不連續(xù)堿基的缺失,推測(cè)播散型菌株可能因?yàn)镹TS區(qū)的堿基較大范圍缺失而導(dǎo)致其致病力增強(qiáng)。 4、本實(shí)驗(yàn)10株孢子絲菌菌株中兩株菌株NTS區(qū)完全相同,并與基因庫中Dum12菌株相似性達(dá)100%;3株菌株與標(biāo)準(zhǔn)對(duì)照株相比僅可見個(gè)別位點(diǎn)的堿基缺失;4株菌株與標(biāo)準(zhǔn)對(duì)照株NTS相比,除個(gè)別堿基差異外,可見相同位點(diǎn)的較大范圍的堿基缺失。實(shí)驗(yàn)菌株之間的NTS區(qū)差異主要是由于堿基缺失引起。我們推測(cè)NTS區(qū)也許可以作為孢子絲菌種內(nèi)分型的研究,而不同型別之間的差異可能主要是由于堿基缺失引起。
[Abstract]:Purpose :
Epidemiological analysis of sporotrichosis of children in Fuyu area of Jilin Province was carried out and some isolates were genotyped and compared with the isolates from non - Fuyu area of Jilin Province in the same period .
In the same time , the isolates were identified and compared with the isolates from the clinical manifestation of lymphatic vessel type and fixed - type sporotrichosis , and the differences of their gene level were understood .
Method :
A total of 35 cases of children from Jilin Province were collected from January 1 , 2011 to April 30 , 2011 , and 7 strains were selected from 35 children with sporotrichosis disease .
1 case of non - Fuyu area in Jilin province was collected and identified by routine mycology method . The results of gene identification were compared with those in non - Fuyu region of Jilin Province . The results of gene identification were compared with those of non - Fuyu region in Jilin Province .
Results :
1 . Epidemiological analysis of sporotrichosis of children in Fuyu area of Jilin Province : The main part of this disease is the arch shed town of Fuyu County and Sanjia Town , and the remaining cases are other parts of Fuyu County ;
The patient ' s medical history ranged from 1 month to 6 months , with an average of 3.00 鹵 1 . 29 months .
Age ranged from 80 days to 13 years , with an average of 5.96 鹵 3.80 years .
23 cases ( 65.71 % ) were male , 12 cases were female , 34.29 % , and the male and female ratio was 1 . 92 鈭
本文編號(hào):1805797
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