犬小孢子菌絲氨酸水解酶FSH1全長(zhǎng)cDNA的克隆及序列分析
本文選題:頭癬 切入點(diǎn):RACE 出處:《中國(guó)皮膚性病學(xué)雜志》2017年01期 論文類型:期刊論文
【摘要】:目的克隆犬小孢子菌絲氨酸水解酶FSH1基因全長(zhǎng)c DNA,為進(jìn)一步研究FSH1的功能以及其在頭癬中的致病機(jī)理打下基礎(chǔ)。方法以犬小孢子菌的總RNA為材料,采用c DNA末端快速擴(kuò)增(Rapid c DNA end amplification,RACE)方法擴(kuò)增犬小孢子菌絲氨酸水解酶FSH1基因的全長(zhǎng)c DNA。結(jié)合生物學(xué)軟件對(duì)其序列進(jìn)行了生物信息學(xué)分析。結(jié)果該全長(zhǎng)c DNA大小為945bp,包含44bp的5’UTR、70bp的3’UTR、開放閱讀框?yàn)?31bp,編碼276個(gè)氨基酸。Blast搜索結(jié)果顯示,該全長(zhǎng)c DNA與已報(bào)道的編碼犬小孢子菌的結(jié)構(gòu)域蛋白的基因序列同源性達(dá)100%,與編碼石膏樣小孢子菌的結(jié)構(gòu)域蛋白基因序列同源性達(dá)78%。結(jié)論首次成功獲得犬小孢子菌絲氨酸水解酶FSH1基因的全長(zhǎng)c DNA,為進(jìn)一步研究其在頭癬發(fā)病中的功能奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:Objective to clone the full-length FSH1 gene of microsporum canis serine hydrolase (FSH1) gene in order to further study the function of FSH1 and its pathogenic mechanism in tinea capitis. Methods the total RNA of microsporozoa canis was used as the material. The full-length c DNAof the serine hydrolase FSH1 gene of microsporum canis was amplified by rapid c DNA end amplification race with c DNA terminal. The sequence was analyzed by bioinformatics with the combination of biological software. The results showed that the total length of c DNA was as follows:. 945bp, containing 44bp 5- UTR70bp, ORAF 831bp, encoding 276 amino acids. Blast search results show that, The sequence homology of the full-length c DNA with the reported domain protein of microsporozoa canis is 100, and that with the sequence of domain protein encoding microsporum gypsum is 78. Conclusion it is the first time to successfully obtain the gene sequence of domain protein of microsporum canis. The full-length cDNA of FSH1 gene of hyphae aminohydrolase lays a foundation for further study of its function in the pathogenesis of tinea capitis.
【作者單位】: 大連市友誼醫(yī)院皮膚性病科;大連醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院皮膚性病科;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(81071330,30640016)
【分類號(hào)】:R756.1
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