山東地區(qū)梅毒螺旋體基因分型研究
發(fā)布時間:2017-11-18 21:11
本文關(guān)鍵詞:山東地區(qū)梅毒螺旋體基因分型研究
【摘要】:背景:梅毒(syphilis)是梅毒螺旋體(Treponema Pallidum,TP)感染引起的性傳播疾病,可侵犯全身各器官(皮膚黏膜、心血管、神經(jīng)、骨骼等),臨床表現(xiàn)和轉(zhuǎn)歸差異很大,包括顯性梅毒、隱性梅毒、晚期梅毒、自然痊愈、血清固定、治療后復發(fā)等。20世紀90年代,TP Nichols菌株全基因組成功測序使得從基因分子生物學的角度研究梅毒成為可能,1998年P(guān)illay等根據(jù)TP arp基因60bp重復序列數(shù)目分析、tpr基因MseI酶切后限制性片段長度多態(tài)性分析(RFLP)等,提出了TP[arp]/[tpr]兩基因分型方法。2010年,Marra CM等在此基礎(chǔ)上引入tp0548基因序列分析,提出了TP[arp]/[tpr]/[tp0548]三基因分型方法,進一步提高了TP基因分型能力。多個國家和地區(qū)對TP進行了基因分型的研究,亦有方法基因型與臨床表型的相關(guān)性研究。迄今為止,山東地區(qū)未有TP基因型的研究,因此本研究收集臨床TP DNA標本進行TP基因型的研究。目的:對山東地區(qū)TP臨床標本的DNA予以分型,為梅毒病原體分子生物學研究提供依據(jù)。方法:1.收集疑似梅毒患者肛周及生殖器潰瘍標本,提取TP DNA,經(jīng)實時熒光定量PCR證實為TP DNA;2.進行arp、tpr、tp0548基因的擴增,對PCR擴增產(chǎn)物進行arp基因60bp重復序列數(shù)目分析、tpr基因Msel酶切后限制性片段長度多態(tài)性分析(RFLP)、tp0548基因序列分析。結(jié)果:1.本研究收集的67份TP DNA標本,48份確定了TP基因型。我們共發(fā)現(xiàn)arp基因6個亞型:5,10,12,14,15,18;tpr基因7個亞型b,d,e,i,j,k,p;tp0548基因亞型:f及c。山東地區(qū)TP菌株最常見的亞型是14d/f(39.6%,19/48),其次是14j/f(10.4%,5/48)、14b/f(8.3%,4/48)15d/f(6.3%,3/48)14k/f(4.2%,2/48)、15b/f(4.2%,2/48)和14i/f(4.2%,2/48);其他亞型各1例14p/f、15e/f、15i/f、15k/f、15p/f、18d/f、5d/f、14e/f、10d/f、12b/f。2.本研究發(fā)現(xiàn)了tp0548基因國內(nèi)外尚未報道的新的亞型(CAGGCGGCAGTGGCCGCACGCGCTGGAGGGTCCGGCGGTAATGACAACCACCCCGGCAAGGAACAGTT TCTCCAGTT),命名為“k”亞型,鑒別了TP一個新的亞型15j/k。結(jié)論:山東地區(qū)TP存在菌群多樣性,優(yōu)勢菌株基因型是14d/f。k亞型是tp0548基因新的亞型,15j/k是TP新的基因型。
【學位授予單位】:安徽醫(yī)科大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R759.1
【參考文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 曾鐵兵,吳移謀,黃澍杰,吳志周;衡陽和江門地區(qū)梅毒螺旋體基因分型的初步研究[J];中華皮膚科雜志;2004年12期
中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 彭銳銳;早期梅毒的分子流行病學研究:我國多地區(qū)性病門診的橫斷面調(diào)查[D];北京協(xié)和醫(yī)學院;2012年
,本文編號:1201153
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