本文關鍵詞：利用二代測序技術對一個中國彌漫性掌跖角化病家系基因突變檢測及其致病機理的研究

  更多相關文章： 彌漫性掌跖角化病 二代測序 剪接位點突變 異常剪接 外顯子捕獲

【摘要】：彌漫性掌跖角化癥(Diffuse palmoplantar keratodema,DPPK)是一種常染色體顯性遺傳皮膚病,臨床癥狀是手掌和單層表皮發(fā)生特定均勻的過度角化現(xiàn)象,通常與KRT1和KRT9基因突變相關。通過二代測序技術對一個中國彌漫性掌跖角化癥四代家系的研究,發(fā)現(xiàn)家系中兩個新突變：KRT1基因c.1254GC,p.Gln418His和GJB6基因c.228delG以及已報道KRT9基因c.1216TC,p.Cys406Arg致病突變。通過直接測序對家系全部成員驗證結果和疾病表型分離研究和連鎖分析,排除基因GJB6c.228delG和KRT9c.1216TC,p.Cys406Arg的是本家系的致病突變。最終確定KRT1基因第6號外顯子剪接供體位點新雜合突變(c.1254GC),破壞了正常的拼接而導致異常剪接。該突變的pSPL3載體功能性分析結果表明c.1254GC的改變使6號外顯子丟失,同時下游54bp處產(chǎn)生新的剪接位點,導致KRT1基因2B結構域內42個氨基酸缺失和18個氨基酸插入。通過計算兩種轉錄體的比率,推斷同轉錄水平的兩種轉錄體的相對豐度。缺少42個氨基酸的短轉錄體(失去6號外顯子)和增加54個核苷酸的長轉錄體(保留部分6號內含子)分別占KRT1基因6至7號外顯子轉錄水平的25%和75%。生物信息學分析表明,KRT1Q418在若干物種及Ⅱ型角蛋白進化中十分保守。角蛋白是卷曲螺旋的異源二聚體,結構研究表明,位于KRT1蛋白七肽單元中“G”位置的Gln418與KRT1O蛋白Lys386形成氫鍵,而KRT1蛋白Q418H突變失去與KRT10Lys386氫鍵的相互作用,導致KRT1-KRT10卷曲螺旋二聚體結構變弱。本研究是首例由一種新的剪接供體位點突變導致異常剪接后同時形成兩種轉錄體而引起DPPK的報道,Q418H突變是新的致病突變。二代測序技術正在改變臨床遺傳學的研究,促進了分子診斷和遺傳咨詢的發(fā)展。研究表明,錯義突變造成的不同轉錄體是誘發(fā)疾病的機制之一。家系成員致病基因的攜帶檢測對于產(chǎn)前診斷和遺傳優(yōu)育有很大價值。
【關鍵詞】：彌漫性掌跖角化病 二代測序 剪接位點突變 異常剪接 外顯子捕獲
【學位授予單位】：浙江大學
【學位級別】：博士
【學位授予年份】：2014
【分類號】：R758.53
【目錄】：

• Acknowledgements5-7
• 中文摘要7-8
• Abstract8-10
• Abbreviations10-12
• 1 Introduction12-31
• 2 Materials & Methods31-56
• 3 Results56-66
• 4 Discussion66-70
• 5. Conclusion70-71
• References71-78
• Literature Review78-114
• References102-114
• Curriculum Vitae114-117

【共引文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 梁靜,高英堂,闞志超;mRNA變位剪接在肝癌中的研究進展[J];國外醫(yī)學.臨床生物化學與檢驗學分冊;2005年03期

2 倪斌,李麓蕓;mRNA選擇性剪接與人類疾病[J];國外醫(yī)學.遺傳學分冊;2005年01期

3 孫霞,殷鑫湞,鄔玲仟,施小六,胡正茂,劉小平,潘乾,戴和平,夏昆,夏家輝;彌漫性掌跖角化病家系角蛋白9基因突變熱點區(qū)的檢測[J];中南大學學報(醫(yī)學版);2005年05期

4 于寧;關媛媛;田菊霞;;抑癌基因KLF6在腫瘤中作用機制的研究進展[J];健康研究;2010年02期

5 ;Regulation of mammalian pre-mRNA splicing[J];Science in China(Series C:Life Sciences);2009年03期

6 李靜,陳獻華,林萬敏,李麗書,韓_g,徐平;用于前體mRNA剪接機制研究的小基因模型的建立和研究應用[J];中國科學(C輯:生命科學);2003年05期

7 殷鑫湞;張寶榮;胡正茂;劉志蓉;;三個先天性掌跖角化病家系致病基因的染色體定位[J];基礎醫(yī)學與臨床;2007年10期

8 席慶;步榮發(fā);周育森;劉洪臣;陳萬榮;丁美;于虹;;頰癌及轉移淋巴結角蛋白譜的分析研究[J];口腔醫(yī)學;2009年07期

9 朱愛蘭;伍嚴安;黃肖利;陳喜軍;黃毅;;馬凡綜合征原纖蛋白質-1突變的蛋白質三維結構分析[J];臨床檢驗雜志;2011年02期

10 魏聆;李明;楊莉佳;;彌漫性表皮松解性掌跖角化病1例[J];嶺南皮膚性病科雜志;2007年05期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 席慶;步榮發(fā);周育森;劉洪臣;陳萬榮;丁美;于虹;;頰癌及轉移淋巴結角蛋白譜的分析研究[A];第八次全國口腔頜面—頭頸腫瘤會議論文匯編[C];2009年

2 李東杰;賈曉明;;低溫保存皮膚的細胞骨架在細胞力傳導中的作用研究進展[A];第五屆全國低溫生物醫(yī)學及器械學術大會會議論文集[C];2006年

中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 王鑫;Pre-mRNA選擇性剪接調控機制研究[D];哈爾濱工程大學;2009年

2 牛召陽;RBM5蛋白在mRNA選擇性剪接中作用機制的研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學院;2011年

3 李盈枝;X連鎖特發(fā)性眼球震顫相關FRMD7基因新剪切變體的克隆及其在神經(jīng)發(fā)育過程中相關功能的研究[D];浙江大學;2011年

4 趙榮蘭;新發(fā)現(xiàn)甲狀腺激素受體β亞型的研究[D];天津醫(yī)科大學;2011年

5 傅衛(wèi)軍;兩個先天性凝血因子V缺陷癥家系的臨床和分子發(fā)病機制研究[D];第二軍醫(yī)大學;2002年

6 惠利健;對肝癌基因表達譜和腫瘤相關剪接類型的分析[D];中國科學院研究生院（上海生命科學研究院）;2003年

7 毛新國;小麥族A、S、D二倍體種全長cDNA文庫構建及序列初步分析[D];中國農業(yè)科學院;2004年

8 王美霞;U_1小核核糖核酸嵌合體核酶靶向抑制HCV表達的研究[D];吉林大學;2004年

9 韓黔峰;sFRP4、β-catenin、Cox-2、ER-β、pS2、Keratin 19蛋白和MSI基因在結直腸癌細胞中的表達[D];四川大學;2005年

10 席慶;抗舌癌特異性角蛋白單克隆抗體的制備[D];中國人民解放軍軍醫(yī)進修學院;2005年

中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 王娟;彌漫性掌跖角化病一家系的KRT1和KRT9-exonl的基因檢測與分析[D];鄭州大學;2010年

2 蔡榕榕;癌癥相關點突變共同定位的外顯子剪接增強子（ESE）特征分析[D];遼寧師范大學;2010年

3 王海濤;果蠅14-3-3ξ基因選擇性剪接機制的研究[D];浙江大學;2011年

4 王潔;中國壯族家系指間區(qū)紋候選基因的連鎖分析[D];廣西醫(yī)科大學;2011年

5 張曉紅;解酮障礙SCOT基因突變與臨床研究[D];廣州醫(yī)學院;2010年

6 莫韋倩;OTC基因突變與臨床研究[D];廣州醫(yī)學院;2010年

7 高超;X-連鎖遲發(fā)性脊椎骨骺發(fā)育不良的分子遺傳學研究[D];鄭州大學;2003年

8 李明;點狀掌跖角化病致病基因定位研究[D];安徽醫(yī)科大學;2004年

9 梁靜;應用DNA測序和寡聚核苷酸芯片對原發(fā)性肝癌中基因突變及變位剪接的研究[D];天津醫(yī)科大學;2004年

10 何新輝;4個中國人表皮松解性掌跖角化癥家系KRT9基因突變的研究[D];中國科學院研究生院（上海生命科學研究院）;2004年

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本文編號：1112125