本文關(guān)鍵詞：云南省玉溪市50歲及以上HIV陽(yáng)性人群分子流行病學(xué)研究

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【摘要】：[目的]了解云南省玉溪市50歲及以上HIV陽(yáng)性人群HIV基因型、基因亞型的分布和特征,在此基礎(chǔ)上進(jìn)一步探索和分析該市HIV在50歲及以上人群中的傳播規(guī)律以及HIV生物學(xué)特性,為遏制HIV在50歲及以上人群中的流行提供參考依據(jù)。[方法]本研究采用橫段面調(diào)查方法,對(duì)截至2014年8月31日玉溪市存活的50歲及以后感染HIV的感染者/AIDS患者進(jìn)行流行病學(xué)調(diào)查。采集血樣,分離血漿后使用RNA核酸提取試劑盒提取核酸并進(jìn)行RT-PCR和巢式PCR擴(kuò)增HIV-1 gag和env基因片段；對(duì)目的基因片段進(jìn)行序列測(cè)定后使用SeqMan軟件進(jìn)行序列拼接和處理；使用MEGA軟件進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建以及遺傳距離的分析；使用SimPlot軟件對(duì)可能發(fā)生重組的毒株基因序列進(jìn)行重組分析；利用R5/X4-pred在線服務(wù)軟件對(duì)HIV細(xì)胞輔助受體進(jìn)行預(yù)測(cè)。使用SPSS軟件對(duì)玉溪市50歲及以上HIV陽(yáng)性人群流行病學(xué)特征和分子流行病學(xué)資料進(jìn)行分析。利用Epi Info和GeoDa軟件制作流行病學(xué)地圖和進(jìn)行空間分布分析。[結(jié)果]本次研究共調(diào)查玉溪市50歲以上HIV陽(yáng)性173人,其中男性108人(62.4%),女性65人(37.6%),平均年齡為57.6±7.9歲,HIV感染年齡主要集中在50歲～(112人,占64.7%),職業(yè)以農(nóng)民為主(66.7%),民族以漢族為主(75.1%),文化程度以小學(xué)文化程度為主(45.1%),接觸史以非婚異性性行為為主(71.1%),其次為配偶/固定性伴陽(yáng)性(23.1%)；感染途徑以異性傳播感染為主(93.1%)。配偶HIV陽(yáng)性66人(38.2%)。感染后首次平均CD4細(xì)胞計(jì)數(shù)為373.8±236.8/mm3,CD4細(xì)胞計(jì)數(shù)以300/mm3～及以下水平為主(58.9%),127人(73.4%)已接受抗病毒治療。玉溪市所轄9縣區(qū)共計(jì)有48個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)均有50歲及以上HIV感染者/AIDS患者分布；其中50歲及以上HIV感染者/AIDS患者人數(shù)排名前5的分別是元江縣、通�？h、新平縣、紅塔區(qū)和華寧縣。2009年以前玉溪市各縣區(qū)50歲及以上HIV感染者AIDS患者數(shù)量較少且分布較為分散,2009年以后各縣區(qū)報(bào)告的50歲及以上HIV/AIDS病例逐年增加。空間自相關(guān)分析后發(fā)現(xiàn),2012年以后50歲及以上HIV感染者AIDS患者在鄉(xiāng)鎮(zhèn)級(jí)的空間分布上存在負(fù)相關(guān)聚集性,即HIV/AIDS分布總體上為離散分布,局部地區(qū)為聚集分布。截至2014年9月,局部空間自相關(guān)Gi*熱點(diǎn)地圖顯示,玉溪市50歲及以上HIV感染者/AIDS患者在鄉(xiāng)鎮(zhèn)分布上有9個(gè)熱點(diǎn)鄉(xiāng)鎮(zhèn),主要集中在玉溪市西南部的元江和新平縣。本次研究共有100份樣本獲得有效HIV-1目的基因序列,HIV核酸提取和擴(kuò)增成功率為57.8%；獲得的100分序列樣本在流行病病學(xué)特征和樣本地區(qū)來源上與173例納入研究的樣本基本一致,能代表和反應(yīng)玉溪市50歲及以上HIV陽(yáng)性人群分子流行病學(xué)特征。100例HIV核酸陽(yáng)性樣本中共檢出CRF08_BC型50例(50.0%), CRF07_BC型37例(37%),C型6例(6.0%),CRF01_AE型3例(4.0%)和CRF_01B型2例(2.0%)。CRF08_BC型是玉溪市50歲及以上HIV陽(yáng)性人群中主要的流行毒株；彝族和傣族陽(yáng)性人群則以CRF07_BC型為第一流行株,不同基因型毒株在不同民族人群中的分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(x2=66.982, Fisher's P=0.048)。CRF08_BC型毒株主要流行于玉溪市東部地區(qū),CRF07_BC型毒株主要流行于玉溪市西南地區(qū)的。遺傳距離分析結(jié)果推測(cè)CRF07_BC、 CRF08_BC和C型毒株進(jìn)入玉溪市的時(shí)間較晚,在玉溪市流行的時(shí)間較短。根據(jù)系統(tǒng)進(jìn)化樹上CRF07_BC、CRF08_BC亞型不同傳播簇遺傳距離的不同,推測(cè)CRF07_BC型毒株可能最早在新平縣50歲以上人群中流行并逐漸向其他縣區(qū)傳播和蔓延。CRF08_BC型毒株可能最早在通海縣50歲以上人群中流行并逐漸向縣區(qū)傳播和蔓延。在生物學(xué)特性方面,83例(89.2%)樣本使用CCR5輔助受體侵染細(xì)胞,10例(10.8%)樣本使用CXCR4輔助受體侵染細(xì)胞。不同基因型HIV-1樣本的細(xì)胞輔助受體類型差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(x2=23.805, Fisher's P值0.001); CRF07_BC、 CRF08 BC和C型毒株感染的樣本基本上多數(shù)使用CCR5型細(xì)胞輔助受體,而CRF01_AE和CRF_01B亞型毒株感染的樣本細(xì)胞輔助受體大多數(shù)為CXCR4型。[結(jié)論]近年來玉溪市50歲及以上人群中HIV疫情逐年上升,HIV在玉溪市50歲及以上人群中的流行具有一定程度的時(shí)間和空間特征,HIV感染者/AIDS患者主要分布在玉溪市經(jīng)濟(jì)水平相對(duì)發(fā)達(dá)的縣區(qū)和鄉(xiāng)鎮(zhèn)。50歲及以上人群HIV傳播模式基本為經(jīng)異性性接觸傳播同時(shí)還存在一定數(shù)量的婚內(nèi)性接觸傳播。大多數(shù)感染者在確證HIV感染時(shí)CD4細(xì)胞計(jì)數(shù)水平已處于較低的水平,部分感染者在確證HIV感染時(shí)已進(jìn)入AIDS期。研究發(fā)現(xiàn)CRF08_BC亞型毒株是玉溪市50歲及以上HIV陽(yáng)性人群中的第一流行毒株,不同基因型毒株在不同地區(qū)和不同民族人群中的分布不同。CRF07_BC和CRF08_BC亞型流行株在玉溪市50歲及以上人群中流行的時(shí)間不同,CRF08 BC亞型毒株開始流行的時(shí)間較晚、流行時(shí)間較短。玉溪市50歲及以上HIV陽(yáng)性人群中HIV-1基因型豐富,應(yīng)強(qiáng)化和重視對(duì)該人群艾滋病的干預(yù)工作,也要注重多HIV陽(yáng)性人群的干預(yù),避免HIV在該人群和其他人群中的流行以及不同基因型毒株在流行傳播過程中重組形成新的重組型毒株。
【關(guān)鍵詞】：玉溪市 50歲及以上人群 HIV 分子流行病學(xué) 基因型
【學(xué)位授予單位】：昆明醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：R512.91
【目錄】：

• 縮略詞表8-9
• 中文摘要9-12
• 英文摘要12-78
• 1 前言16-25
• 1.1 國(guó)內(nèi)外50歲及以上人群HIV感染現(xiàn)狀16-18
• 1.1.1 國(guó)外50歲及以上人群HIV感染現(xiàn)狀16-17
• 1.1.2 中國(guó)50歲及以上人群HIV感染現(xiàn)狀17
• 1.1.3 云南省和玉溪市50歲及以上人群HIV感染現(xiàn)狀17-18
• 1.2 HIV-1基因型分布概況18-22
• 1.2.1 世界HIV-1基因型分布概況18-19
• 1.2.2 亞洲部分地區(qū)HIV-1基因型分布19
• 1.2.3 中國(guó)HIV-1基因型分布19-21
• 1.2.4 云南省HIV-1基因型的分布21-22
• 1.3 HIV-1的基因結(jié)構(gòu)和生物學(xué)特性22-24
• 1.4 HIV-1進(jìn)化分析與流行傳播24-25
• 1.5 本研究的意義25
• 1.6 本研究目的25
• 2 材料與方法25-35
• 2.1 研究對(duì)象25
• 2.1.1 對(duì)象來源25
• 2.1.2 對(duì)象納入標(biāo)準(zhǔn)25
• 2.2 研究?jī)?nèi)容25-26
• 2.3 研究方法26-31
• 2.3.1 文獻(xiàn)研究26
• 2.3.2 流行病學(xué)調(diào)查26
• 2.3.3 基因檢測(cè)26-31
• 2.4 統(tǒng)計(jì)分析31-32
• 2.5 質(zhì)量控制32-33
• 2.6 技術(shù)路線33-35
• 3 結(jié)果35-70
• 3.1 玉溪市50歲及以上HIV陽(yáng)性人群流行病學(xué)特征35-40
• 3.1.1 玉溪市50歲及以上HIV陽(yáng)性人群基本情況35-37
• 3.1.2 玉溪市50歲及以上HIV陽(yáng)性人群感染HIV的時(shí)間分布37
• 3.1.3 玉溪市50歲及以上HIV陽(yáng)性人群空間分布37-40
• 3.2 HIV核酸陽(yáng)性樣本流行病學(xué)特征40-45
• 3.2.1 核酸陽(yáng)性樣本基本特征41-43
• 3.2.2 核酸陽(yáng)性樣本HIV感染的時(shí)間分布43
• 3.2.3 核酸陽(yáng)性樣本的空間分布43-45
• 3.3 HIV核酸陽(yáng)性樣本構(gòu)成特征的擬合優(yōu)度檢驗(yàn)45-47
• 3.4 玉溪市50歲及以上HIV陽(yáng)性人群HIV-1基因型分布47-57
• 3.4.1 核酸提取擴(kuò)增及目的基因序列獲得情況47-48
• 3.4.2 HIV-1基因型判定48-49
• 3.4.3 HIV-1基因型分布49-57
• 3.4.3.1 HIV-1基因型在不同人群中的分布49-52
• 3.4.3.2 HIV-1基因型在不同接觸史和感染途徑人群中的分布52-53
• 3.4.3.3 HIV-1基因型的時(shí)間分布53
• 3.4.3.4 HIV-1基因型的空間分布53-57
• 3.5 玉溪市50歲及以上HIV陽(yáng)性人群基因序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析57-62
• 3.6 基于env基因片段系統(tǒng)進(jìn)化樹的傳播簇分析62-65
• 3.7 遺傳距離分析65-67
• 3.8 重組分析67-69
• 3.8.1 gag基因片段重組分析67-68
• 3.8.2 env基因片段重組分析68-69
• 3.9 細(xì)胞輔助受體預(yù)測(cè)69-70
• 4 討論70-76
• 4.1 玉溪市50歲及以上HIV陽(yáng)性人群流行病學(xué)特征70-71
• 4.2 玉溪市50歲及以上HIV陽(yáng)性人群時(shí)空分布和聚集性特征.71-73
• 4.3 玉溪市50歲及以上HIV陽(yáng)性人群HIV-1基因型特征73-76
• 4.4 細(xì)胞輔助受體76
• 5 結(jié)論76-78
• 6 下一步研究方向78
• 參考文獻(xiàn)78-91
• 附錄91-95
• 玉溪市老年人AIDS調(diào)查表91-95
• HIV-1基因型及分子流行病學(xué)研究綜述95-118
• 參考文獻(xiàn)109-118
• 攻讀學(xué)位期間獲得的學(xué)術(shù)成果118-119
• 致謝119

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