發(fā)布時間：2017-08-09 22:09

  本文關(guān)鍵詞：環(huán)狀RNA在系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者中差異表達的研究

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【摘要】：目的:應(yīng)用circRNA芯片技術(shù)分析系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者外周血單個核細胞中環(huán)狀RNA的差異表達,為進一步探索差異性表達的環(huán)狀RNA作為SLE診斷生物標志物及其調(diào)控機制研究奠定基礎(chǔ)。方法:10例SLE患者(SLE組)、10例類風濕關(guān)節(jié)炎患者(RA組)及10例正常健康對照者(NC組)為實驗對象,分別收集實驗參與者的外周靜脈血并分離出外周血單個核細胞,提取總RNA,利用circRNA芯片技術(shù),篩查系統(tǒng)性紅斑狼瘡單個核細胞中差異性表達的環(huán)狀RNA,運用生物信息學方法得到與環(huán)狀RNA相關(guān)的miRNA,最后運用實時定量PCR對部分環(huán)狀RNA進行驗證。結(jié)果:與健康對照組相比,顯著差異性表達的環(huán)狀RNA有745種,其中182種表達上調(diào),563種表達下調(diào);與RA組相比,顯著差異性表達的環(huán)狀RNA有671種,其中225種表達上調(diào),446種表達下調(diào)。應(yīng)用實時定量PCR驗證6種表達上調(diào)環(huán)狀RNA:hsa_circ_0007337、hsa_circ_0047891、hsa_circ_0001349、hsa_circ_0046555、hsa_circ_0046215、hsa_circ_0056536表達呈上調(diào)趨勢;5種表達下調(diào)circRNA:hsa_circ_0070113、hsa_circ_0005480、hsa_circ_0001854、hsa_circ_0044468、hsa_circ_0006608表達呈下調(diào)趨勢,和芯片結(jié)果一致。生物信息學提示環(huán)狀RNA可以通過與miRNA發(fā)生相互作用從而調(diào)控系統(tǒng)性紅斑狼瘡的發(fā)生和發(fā)展。結(jié)論:SLE患者單個核細胞環(huán)狀RNA的表達具有疾病特異性,顯著差異的和特異性表達的環(huán)狀RNA可作為系統(tǒng)性紅斑狼瘡潛在的診斷標志物。此外,差異性表達的環(huán)狀RNA的生物信息學有助于系統(tǒng)性紅斑狼瘡發(fā)病機制研究,可作為機制研究的參考和補充。
【關(guān)鍵詞】：環(huán)狀RNA circRNA芯片 系統(tǒng)性紅斑狼瘡
【學位授予單位】：暨南大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：R593.241
【目錄】：

• 摘要3-4
• ABSTRACT4-7
• 1.前言7-15
• 1.1 circRNA研究現(xiàn)狀8-12
• 1.2 circRNA與自身免疫性疾病12-13
• 1.3 circRNA基因芯片、RT-PCR技術(shù)對SLE circRNA的綜合研究13-15
• 2.實驗材料和方法15-25
• 2.1 臨床資料15
• 2.2 實驗所需試劑和耗材15-16
• 2.3 實驗所需儀器16-17
• 2.4 人外周血單個核細胞分離17-18
• 2.5 Total RNA的提取18
• 2.6 RNA質(zhì)量檢測18-20
• 2.7 標記反應(yīng)20-21
• 2.8 標記/擴增的RNA的純化和標記cRNA的質(zhì)量控制21-22
• 2.9 雜交22-23
• 2.10 芯片洗滌23-24
• 2.11 圖像掃描及數(shù)據(jù)分析24
• 2.12 實時定量PCR驗證差異性表達circRNA24-25
• 3.結(jié)果25-47
• 3.1 Total RNA抽提與質(zhì)檢結(jié)果25-26
• 3.2 circRNA芯片檢測結(jié)果26-40
• 3.3 miRNA預測40-45
• 3.4 RT-PCR驗證差異性circRNA45-47
• 4.討論47-50
• 5.本實驗的不足和未來研究的方向50-52
• 6.結(jié)論52-53
• 參考文獻53-61
• 縮略詞表61-63
• 附錄63-65
• 致謝65

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中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 魯慧英;Detection of hepatitis C virus RNA sequences in cholangiocarcinomas in Chinese and American patients[J];Chinese Medical Journal;2000年12期

2 ;Detection the HCV RNA by PCR-microplate hybridization method from clinical specimens[J];中國輸血雜志;2001年S1期

3 付漢江,鄭曉飛;類mRNA RNA研究進展[J];國外醫(yī)學(分子生物學分冊);2002年04期

4 Verheyden B ,徐其武;口服脊髓灰質(zhì)炎疫苗核殼和RNA的穩(wěn)定性[J];國外醫(yī)學.預防.診斷.治療用生物制品分冊;2002年01期

5 CMBE譯文組;探索小RNA的功能[J];現(xiàn)代臨床醫(yī)學生物工程學雜志;2004年03期

6 沈維干;RNA interference and its current application in mammals[J];Chinese Medical Journal;2004年07期

7 ;Potent and specific inhibition of SARS-CoV antigen expression by RNA interference[J];Chinese Medical Journal;2005年09期

8 孫娣;汪洋;張麗娟;閆玉清;;一種簡捷提取植物總RNA的方法[J];黑龍江醫(yī)藥;2005年06期

9 熊慧華;于世英;胡廣原;莊亮;;Effects of Survivin Expression Suppressed by Short Hairpin RNA on MCF-7 Cells[J];華中科技大學學報(醫(yī)學英德文版);2006年03期

10 楊益超;;RNA干擾及其在醫(yī)學中的應(yīng)用[J];廣西醫(yī)學;2007年10期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 金由辛;;面向21世紀的RNA研究[A];面向21世紀的科技進步與社會經(jīng)濟發(fā)展（下冊）[C];1999年

2 ;第四屆RNA全國研討會大會報告日程安排[A];第四屆全國RNA進展研討會論文集[C];2005年

3 ;Function of Transfer RNA Modifications in Plant Development[A];植物分子生物學與現(xiàn)代農(nóng)業(yè)——全國植物生物學研討會論文摘要集[C];2010年

4 王峰;張秋平;陳金湘;;棉花總RNA的快速提取方法[A];中國棉花學會2011年年會論文匯編[C];2011年

5 關(guān)力;陳本iY;iJ云虹;郭培芝;魏重琴;邱蘇吾;苗健;;關(guān)于動物}D~T中RNAn,定方法的研究[A];中國生理科學會學術(shù)會議論文摘要匯編（生物化學）[C];1964年

6 夏海濱;;小RNA在免疫學領(lǐng)域中的應(yīng)用研究進展[A];中國免疫學會第五屆全國代表大會暨學術(shù)會議論文摘要[C];2006年

7 ;The stability of hepatitis C virus RNA in various handling and storage conditions[A];中國輸血協(xié)會第四屆輸血大會論文集[C];2006年

8 郭德銀;;RNA干擾在病毒研究和控制中的應(yīng)用[A];2006中國微生物學會第九次全國會員代表大會暨學術(shù)年會論文摘要集[C];2006年

9 甘儀梅;楊業(yè)華;王學奎;曹燕;楊特武;;棉花總RNA快速提取[A];中國棉花學會2007年年會論文匯編[C];2007年

10 ;Identification and characterization of novel interactive partner proteins for PCBP1 that is a RNA-binding protein[A];中國優(yōu)生優(yōu)育協(xié)會第四屆全國學術(shù)論文報告會暨基因科學高峰論壇論文專輯[C];2008年

中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 記者 馮衛(wèi)東;研究人員發(fā)現(xiàn)可破壞腫瘤抑制基因的小RNA[N];科技日報;2009年

2 記者 儲笑抒 通訊員 盛偉;人體微小RNA有望提前發(fā)出癌癥預警[N];南京日報;2011年

3 瀘州醫(yī)學院副教授、科普作家 周志遠;“大頭兒子”與環(huán)狀RNA[N];第一財經(jīng)日報;2014年

4 麥迪信;小分子RNA可能有大作用[N];醫(yī)藥經(jīng)濟報;2003年

5 董映璧;美發(fā)現(xiàn)基因調(diào)控可回應(yīng)“RNA世界”[N];科技日報;2006年

6 張忠霞;特制RNA輕推一下,就能“喚醒”基因[N];新華每日電訊;2007年

7 聶翠蓉;RNA：縱是配角也精彩[N];科技日報;2009年

8 馮衛(wèi)東;RNA干擾機制首次在人體中獲得證實[N];科技日報;2010年

9 馮衛(wèi)東　王小龍;英在地球早期環(huán)境模擬條件下合成類RNA[N];科技日報;2009年

10 記者 常麗君;新技術(shù)讓研究進入單細胞內(nèi)RNA的世界[N];科技日報;2011年

中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 王趙瑋;昆蟲RNA病毒復制及昆蟲抗病毒天然免疫機制研究[D];武漢大學;2014年

2 包純;一類新非編碼RNA的發(fā)現(xiàn)以及產(chǎn)生和功能的初探[D];華中師范大學;2015年

3 李語麗;基于MeRIP-seq的水稻RNA m6A甲基化修飾的研究[D];中國科學院北京基因組研究所;2015年

4 熊瑜琳;miR-122靶位基因STAT3調(diào)控長鏈非編碼 RNA Lethe促進HCV復制的機制研究[D];第三軍醫(yī)大學;2015年

5 范春節(jié);高通量測序鑒定毛竹小RNA及其功能分析[D];中國林業(yè)科學研究院;2012年

6 王加強;小鼠著床前胚胎特異ERV相關(guān)長非編碼RNA的定向篩選及功能研究[D];東北農(nóng)業(yè)大學;2015年

7 王業(yè)偉;非編碼RNA SPIU的結(jié)構(gòu)和功能研究和p19INK4D在APL發(fā)病中的作用[D];上海交通大學;2013年

8 鄒艷芬;子癇前期中非編碼RNA對滋養(yǎng)細胞功能的調(diào)控及機制探索[D];南京醫(yī)科大學;2015年

9 朱喬;miR-10b在人肝細胞肝癌發(fā)生中的作用及其機制的初步探索[D];第四軍醫(yī)大學;2015年

10 蔣俊鋒;長鏈非編碼RNA BACE1-AS促進Aβ聚集及其調(diào)節(jié)BACE1和SERF1a的ceRNA機制研究[D];第二軍醫(yī)大學;2015年

中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 全弘揚;長鏈非編碼RNA在細胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激反應(yīng)中的相關(guān)作用及機制研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學院;2015年

2 胡亮;DDX19A識別PRRSV基因組RNA并激活NLRP3炎癥小體[D];中國農(nóng)業(yè)科學院;2015年

3 雷文婕;小菜蛾不同發(fā)育時期RNA編輯位點的識別與驗證[D];南京農(nóng)業(yè)大學;2014年

4 周燕;RNA干擾對大鯢蛙病毒（CGSRV）主要功能基因表達與增殖影響的研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學;2015年

5 石新新;改進的RNA-Seq數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)錄組表達分析研究[D];南京航空航天大學;2015年

6 陳金梅;利用植物表達藥用干擾小RNA的研究[D];南京大學;2014年

7 郭維超;miR-17家族在腫瘤生長和遷移中的作用及機制[D];杭州師范大學;2016年

8 沈曉彤;RNA“一步法”檢測的酶學基礎(chǔ)及凝血酶等溫擴增檢測方法的研究[D];青島科技大學;2016年

9 孫文陽;豬miR-15b前體單堿基突變對其生物加工過程的影響[D];甘肅農(nóng)業(yè)大學;2016年

10 郅淑引;微小RNA25在肺癌血清中的表達量與臨床意義的研究[D];山西醫(yī)科大學;2016年

，

本文編號：647526