目的初步探究Graves病(Graves disease,GD)患者腸道菌群的多樣性變化。方法選擇遵義醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院就診的初診Graves病患者(n=18例),同期于體檢中心體檢的健康人群(n=11例),受試者均排除近1個(gè)月內(nèi)合并感染性疾病、其他自身免疫疾病、應(yīng)用益生菌及抗生素等。并收集其糞便樣本,提取腸道菌群DNA,16S rRNA基因擴(kuò)增,Illumina平臺(tái)測(cè)序,對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行物種注釋、多樣性及物種差異分析。結(jié)果測(cè)序共測(cè)得1 200 665條高質(zhì)量序列,每個(gè)樣本平均含有(41 402±6 733)條有效序列。2組間Chao1指數(shù)、ACE指數(shù)、Shannon指數(shù)及Simpson指數(shù)沒(méi)有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P> 0.05),但GD組均小于NC組,表明Graves病患者腸道菌群多樣性降低。2組間腸道菌群組成和結(jié)構(gòu)存在顯著差異,門水平上GD組厚壁菌門相對(duì)豐度低于NC組,而放線菌門高于NC組(P <0.05)。屬水平上GD組雙歧桿菌屬、柯林斯氏菌屬、Pediococcus、N09、02d06等相對(duì)于NC組優(yōu)勢(shì)豐度分布,而羅斯氏菌屬、小桿菌屬、Thermus、Slackia、[Prev...

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【文章目錄】：
1 對(duì)象與方法
    1.1 研究對(duì)象
    1.2 標(biāo)本采集
    1.3 糞便菌群DNA的提取
    1.4 Illumina MiSeq測(cè)序
    1.5 數(shù)據(jù)分析
        1.5.1 OTU劃分和分類地位鑒定
        1.5.2 腸道群落的多樣性分析
    1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
2 結(jié)果
    2.1 2組一般臨床資料的比較
    2.2 2組OTUs的Venn圖
    2.3 2組腸道菌群Alpha多樣性分析
    2.4 2組腸道菌群Beta多樣性分析
    2.5 2組腸道菌群在門及屬水平分類學(xué)組成分析
3 討論



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