多囊卵巢綜合征基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控關(guān)聯(lián)的生物信息分析
發(fā)布時(shí)間:2023-05-07 23:30
目的分析多囊卵巢綜合征(PCOS)基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控關(guān)聯(lián)的生物信息。方法從整合基因表達(dá)匯編平臺(tái)中共下載PCOS患者33例及健康對(duì)照30例的皮下脂肪組織樣本轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù),比較兩組基因表達(dá)數(shù)據(jù),保留P<0.0005的1636個(gè)顯著差異基因,進(jìn)行GO數(shù)據(jù)庫(kù)的功能富集分析和KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)的生物信號(hào)通路富集分析。結(jié)果 1636個(gè)顯著差異基因富集在GO功能條目下,如在生物學(xué)過(guò)程集合中的嗜同性細(xì)胞黏附、肌絲滑動(dòng)、肌肉收縮等,在細(xì)胞組分集合中的細(xì)胞質(zhì)、肌原纖維節(jié)、核質(zhì)等,在分子功能集合中的蛋白質(zhì)結(jié)合、多聚腺嘌呤RNA結(jié)合及鈣離子結(jié)合等(P<0.001)。1636個(gè)顯著差異基因富集KEGG生物信號(hào)通路,如TNF信號(hào)通路、催產(chǎn)素信號(hào)通路、Ras信號(hào)通路、環(huán)磷酸腺苷信號(hào)通路、胰島素信號(hào)通路及雌激素信號(hào)通路等(P<0.05)。結(jié)論P(yáng)COS表達(dá)基因的遺傳學(xué)變化可能通過(guò)影響卵巢發(fā)育生物學(xué)過(guò)程及卵巢發(fā)育相關(guān)的信號(hào)通路的活性,從而促進(jìn)PCOS的發(fā)生。
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【文章目錄】:
資料與方法
一、一般資料
二、方法
1.轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.差異基因篩選
3.功能富集分析和生物信號(hào)通路分析
三、統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
結(jié) 果
一、GO功能富集
二、KEGG生物信號(hào)通路富集
討 論
本文編號(hào):3811541
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資料與方法
一、一般資料
二、方法
1.轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.差異基因篩選
3.功能富集分析和生物信號(hào)通路分析
三、統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
結(jié) 果
一、GO功能富集
二、KEGG生物信號(hào)通路富集
討 論
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