類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎患者舌苔菌群微生態(tài)研究
發(fā)布時(shí)間:2022-01-03 00:12
背景:類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(Rheumatoid Arthritis,RA)是一種以慢性滑膜炎性增生、多關(guān)節(jié)功能活動(dòng)受損并伴有關(guān)節(jié)骨質(zhì)破壞為主要臨床特征,并最終導(dǎo)致關(guān)節(jié)功能毀損的高致畸性的自身免疫性疾病。越來(lái)越多的研究表明,腔道菌群與RA的發(fā)病存在密切關(guān)系。越來(lái)越多的研究表明,人體口腔菌群紊亂可能與RA發(fā)病存在關(guān)系,而舌苔作為口腔菌群在外最直接的表現(xiàn)形式,RA患者舌苔微生物菌群必然區(qū)別于正常人群。然而目前對(duì)于RA患者舌苔微生態(tài)的研究十分欠缺,本研究即為RA患者舌苔微生態(tài)的研究,以期為腔道菌群與RA發(fā)病的研究提供理論基礎(chǔ)。目的:從舌苔菌群微生態(tài)上研究類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎患者疾病進(jìn)展與菌群的關(guān)系;方法:使用口腔咽拭子刮取活動(dòng)期(OP組,Oral Prograssive)、緩解期(OR組,Oral Remission)及健康對(duì)照組(OHC,Oral Health Control)各10人的舌苔,使用口腔拭子基因組DNA快速提取試劑盒提取總DNA,進(jìn)行16s rRNA擴(kuò)增并進(jìn)行Illumina MiSeq高通量測(cè)序,對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行微生態(tài)分析;結(jié)果:三組樣本在菌群的Alpha多樣性上無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P>0....
【文章來(lái)源】:中國(guó)人民解放軍陸軍軍醫(yī)大學(xué)重慶市
【文章頁(yè)數(shù)】:44 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
受試患者與健康人群PCR擴(kuò)增結(jié)結(jié)果
四三組樣本403個(gè)O的相互覆Venn圖(Chlor在屬水平拉菌屬(放線菌屬,(Geobac酸桿菌屬脫硫微(Allosca、菌群組成本共檢測(cè)出TU。Venn覆蓋區(qū)域了圖分析可見(jiàn)roflexi),平上,OHC(Moraxellac菌屬(Actinob副桿菌cillus),Cand屬(Lactob菌屬(Deardovia)(成分析分別出18個(gè)門(mén)、n圖可用于了解物種的見(jiàn):門(mén)水平上OR組獨(dú)有獨(dú)有的菌ceae),纖毛bacteria),微屬(Parapedidatus_Broacillus),Psulfomicrob(圖3B)陸軍軍醫(yī)圖2三組樣別對(duì)三組樣21個(gè)綱、于兩組或者多共有情況以上,OHC組有異常球菌-菌群有Aster毛菌屬(Lepto微桿菌屬(Medobacter)ocadia屬,棲elospora屬bium),出牙醫(yī)大學(xué)碩士學(xué)16樣本序列長(zhǎng)度樣本與細(xì)菌55個(gè)目、9多組樣本之以及各自獨(dú)組獨(dú)有棒狀嗜熱菌門(mén)roleplasmaotrichiaceaeMicrobacte;OR獨(dú)棲熱菌屬(Th,斯卡多維菌屬(Ge學(xué)位論文分布情況16SrRNA93個(gè)科、1之間物種相互有的物種情狀桿菌門(mén)((Deinococ屬,棒狀桿e),α-變形rium),Git有的菌hermus),Tep維亞氏菌屬(Semmataceae數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)比69個(gè)屬、3互包含關(guān)系情況。對(duì)三Rokubactercus-Thermu桿菌屬(Rok形菌屬(Alphtt-GS-136,群有芽pidimonas屬Scardovia),e),擬斯卡比分析菌群306個(gè)種的系,通過(guò)圖形三組樣本進(jìn)行ria)及綠彎us)(圖3kubacterialehaproteobacActinomar孢桿屬,OP獨(dú)有泛菌屬(Pan多維亞氏群組成,的細(xì)菌、形之間行物種彎菌門(mén)A);s),莫teria),rinales菌屬有的乳ntoea),菌屬
A五多樣性群落的三組樣本組OO整體比六這些序指數(shù)值為本次測(cè)量4)。:門(mén)水平,、物種Alp。其中cha多樣性情況本在物種多組別OPRHC比較(F,P)、樣本測(cè)序列對(duì)應(yīng)樣本為縱坐標(biāo)繪量每個(gè)樣本三組樣本菌pha多樣性ao、ace指況。對(duì)樣本進(jìn)多樣性指數(shù)表例數(shù)sha103.34103.37103.102.22序深度檢測(cè)本的Alpha繪制曲線,本讀取序列陸軍軍醫(yī)門(mén)相互包含關(guān)圖3物性分析Alp數(shù)反映了群進(jìn)行Alpha上無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)5多樣性annon±0.340±0.330±0.2702,0.13稀釋曲多樣性指數(shù)根據(jù)曲線是約30987條醫(yī)大學(xué)碩士學(xué)17關(guān)系;B:屬物種組成Venpha多樣性群落豐富度a多樣性分析學(xué)差異(P均性指數(shù)表(n=simpson0.0721±0.030.0671±0.030.0997±0.032.57,0.10曲線是從樣本數(shù),以抽取是否達(dá)到平條,從圖中可學(xué)位論文屬水平,三組nn圖性分析可以反情況,shan析得到多樣>0.05)。10,x±s)74227.00221.62207.00.本中隨機(jī)抽的數(shù)據(jù)量為緩來(lái)判斷本可以看到,本組樣本菌屬相反映微生物nnon、simp樣性指數(shù)統(tǒng)計(jì)ace37±42.1075±27.4274±31.2088,0.43抽取一定數(shù)為橫坐標(biāo),本次測(cè)序數(shù)本次測(cè)序深相互包含關(guān)系物群落的豐富pson指數(shù)反計(jì)表(見(jiàn)表chao230.17±4214.33±2220.33±40.33,0.數(shù)量的序列,以Alpha多數(shù)據(jù)量是否足深度符合要富度和反映了表5),o7.563.992.8772統(tǒng)計(jì)樣性足夠。求(圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]CD4+T細(xì)胞亞群在類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎發(fā)病機(jī)制中的研究進(jìn)展[J]. 李凡,張升校,李媛,王彩虹. 中國(guó)藥物與臨床. 2018(10)
[2]黃膩苔舌面菌群門(mén)與屬水平上的差異性研究[J]. 齊城成,李偉,丁成華,孫悅,王河寶. 中華中醫(yī)藥雜志. 2018(08)
[3]早期類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎女性患者陰道微生態(tài)菌群基因組分析[J]. 惠彩霞,張娟,曾本華,鐘兵,萬(wàn)萍,楊莉,吳力克,魏泓,方勇飛. 第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(11)
[4]類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎血瘀證大鼠模型的制備及評(píng)價(jià)[J]. 李茜,梁曉東,曹永倉(cāng),唐迎雪. 山東中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(05)
[5]基于主成分分析和聚類(lèi)分析的秦艽不同配伍藥對(duì)對(duì)風(fēng)濕熱痹類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎大鼠的作用研究[J]. 馬騰茂,劉飛,王蓉,高慧琴. 中草藥. 2017(11)
[6]腸道微生態(tài)與疾病[J]. 劉志鵬,馮強(qiáng). 營(yíng)養(yǎng)學(xué)報(bào). 2017(02)
[7]脊痛寧膠囊對(duì)風(fēng)寒濕痹型類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎大鼠的治療作用[J]. 熊麗,杜肖,陳寶忠,王炎焱,賀曉麗. 中國(guó)實(shí)驗(yàn)方劑學(xué)雜志. 2017(01)
[8]口腔病灶與某些系統(tǒng)性疾病發(fā)生發(fā)展的相關(guān)關(guān)系研究[J]. 孫海燕,李歡,葛成. 臨床口腔醫(yī)學(xué)雜志. 2015(01)
[9]類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎濕熱痹阻證的舌象與活動(dòng)性指標(biāo)關(guān)系的研究[J]. 陳延強(qiáng),謝麗萍. 遼寧中醫(yī)雜志. 2013(06)
[10]新一代高通量技術(shù)在齲病相關(guān)的口腔菌群宏基因組學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 凌均棨,楊芳,滕飛. 中華口腔醫(yī)學(xué)研究雜志(電子版). 2011(04)
本文編號(hào):3565165
【文章來(lái)源】:中國(guó)人民解放軍陸軍軍醫(yī)大學(xué)重慶市
【文章頁(yè)數(shù)】:44 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
受試患者與健康人群PCR擴(kuò)增結(jié)結(jié)果
四三組樣本403個(gè)O的相互覆Venn圖(Chlor在屬水平拉菌屬(放線菌屬,(Geobac酸桿菌屬脫硫微(Allosca、菌群組成本共檢測(cè)出TU。Venn覆蓋區(qū)域了圖分析可見(jiàn)roflexi),平上,OHC(Moraxellac菌屬(Actinob副桿菌cillus),Cand屬(Lactob菌屬(Deardovia)(成分析分別出18個(gè)門(mén)、n圖可用于了解物種的見(jiàn):門(mén)水平上OR組獨(dú)有獨(dú)有的菌ceae),纖毛bacteria),微屬(Parapedidatus_Broacillus),Psulfomicrob(圖3B)陸軍軍醫(yī)圖2三組樣別對(duì)三組樣21個(gè)綱、于兩組或者多共有情況以上,OHC組有異常球菌-菌群有Aster毛菌屬(Lepto微桿菌屬(Medobacter)ocadia屬,棲elospora屬bium),出牙醫(yī)大學(xué)碩士學(xué)16樣本序列長(zhǎng)度樣本與細(xì)菌55個(gè)目、9多組樣本之以及各自獨(dú)組獨(dú)有棒狀嗜熱菌門(mén)roleplasmaotrichiaceaeMicrobacte;OR獨(dú)棲熱菌屬(Th,斯卡多維菌屬(Ge學(xué)位論文分布情況16SrRNA93個(gè)科、1之間物種相互有的物種情狀桿菌門(mén)((Deinococ屬,棒狀桿e),α-變形rium),Git有的菌hermus),Tep維亞氏菌屬(Semmataceae數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)比69個(gè)屬、3互包含關(guān)系情況。對(duì)三Rokubactercus-Thermu桿菌屬(Rok形菌屬(Alphtt-GS-136,群有芽pidimonas屬Scardovia),e),擬斯卡比分析菌群306個(gè)種的系,通過(guò)圖形三組樣本進(jìn)行ria)及綠彎us)(圖3kubacterialehaproteobacActinomar孢桿屬,OP獨(dú)有泛菌屬(Pan多維亞氏群組成,的細(xì)菌、形之間行物種彎菌門(mén)A);s),莫teria),rinales菌屬有的乳ntoea),菌屬
A五多樣性群落的三組樣本組OO整體比六這些序指數(shù)值為本次測(cè)量4)。:門(mén)水平,、物種Alp。其中cha多樣性情況本在物種多組別OPRHC比較(F,P)、樣本測(cè)序列對(duì)應(yīng)樣本為縱坐標(biāo)繪量每個(gè)樣本三組樣本菌pha多樣性ao、ace指況。對(duì)樣本進(jìn)多樣性指數(shù)表例數(shù)sha103.34103.37103.102.22序深度檢測(cè)本的Alpha繪制曲線,本讀取序列陸軍軍醫(yī)門(mén)相互包含關(guān)圖3物性分析Alp數(shù)反映了群進(jìn)行Alpha上無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)5多樣性annon±0.340±0.330±0.2702,0.13稀釋曲多樣性指數(shù)根據(jù)曲線是約30987條醫(yī)大學(xué)碩士學(xué)17關(guān)系;B:屬物種組成Venpha多樣性群落豐富度a多樣性分析學(xué)差異(P均性指數(shù)表(n=simpson0.0721±0.030.0671±0.030.0997±0.032.57,0.10曲線是從樣本數(shù),以抽取是否達(dá)到平條,從圖中可學(xué)位論文屬水平,三組nn圖性分析可以反情況,shan析得到多樣>0.05)。10,x±s)74227.00221.62207.00.本中隨機(jī)抽的數(shù)據(jù)量為緩來(lái)判斷本可以看到,本組樣本菌屬相反映微生物nnon、simp樣性指數(shù)統(tǒng)計(jì)ace37±42.1075±27.4274±31.2088,0.43抽取一定數(shù)為橫坐標(biāo),本次測(cè)序數(shù)本次測(cè)序深相互包含關(guān)系物群落的豐富pson指數(shù)反計(jì)表(見(jiàn)表chao230.17±4214.33±2220.33±40.33,0.數(shù)量的序列,以Alpha多數(shù)據(jù)量是否足深度符合要富度和反映了表5),o7.563.992.8772統(tǒng)計(jì)樣性足夠。求(圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]CD4+T細(xì)胞亞群在類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎發(fā)病機(jī)制中的研究進(jìn)展[J]. 李凡,張升校,李媛,王彩虹. 中國(guó)藥物與臨床. 2018(10)
[2]黃膩苔舌面菌群門(mén)與屬水平上的差異性研究[J]. 齊城成,李偉,丁成華,孫悅,王河寶. 中華中醫(yī)藥雜志. 2018(08)
[3]早期類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎女性患者陰道微生態(tài)菌群基因組分析[J]. 惠彩霞,張娟,曾本華,鐘兵,萬(wàn)萍,楊莉,吳力克,魏泓,方勇飛. 第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(11)
[4]類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎血瘀證大鼠模型的制備及評(píng)價(jià)[J]. 李茜,梁曉東,曹永倉(cāng),唐迎雪. 山東中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(05)
[5]基于主成分分析和聚類(lèi)分析的秦艽不同配伍藥對(duì)對(duì)風(fēng)濕熱痹類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎大鼠的作用研究[J]. 馬騰茂,劉飛,王蓉,高慧琴. 中草藥. 2017(11)
[6]腸道微生態(tài)與疾病[J]. 劉志鵬,馮強(qiáng). 營(yíng)養(yǎng)學(xué)報(bào). 2017(02)
[7]脊痛寧膠囊對(duì)風(fēng)寒濕痹型類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎大鼠的治療作用[J]. 熊麗,杜肖,陳寶忠,王炎焱,賀曉麗. 中國(guó)實(shí)驗(yàn)方劑學(xué)雜志. 2017(01)
[8]口腔病灶與某些系統(tǒng)性疾病發(fā)生發(fā)展的相關(guān)關(guān)系研究[J]. 孫海燕,李歡,葛成. 臨床口腔醫(yī)學(xué)雜志. 2015(01)
[9]類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎濕熱痹阻證的舌象與活動(dòng)性指標(biāo)關(guān)系的研究[J]. 陳延強(qiáng),謝麗萍. 遼寧中醫(yī)雜志. 2013(06)
[10]新一代高通量技術(shù)在齲病相關(guān)的口腔菌群宏基因組學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 凌均棨,楊芳,滕飛. 中華口腔醫(yī)學(xué)研究雜志(電子版). 2011(04)
本文編號(hào):3565165
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