免疫相關(guān)基因在絕經(jīng)后骨質(zhì)疏松癥患者外周血白細(xì)胞中的表達(dá)
發(fā)布時(shí)間:2021-08-13 23:18
背景:目前認(rèn)為骨骼是一種免疫器官,在骨髓中形成的多種免疫細(xì)胞可與骨骼系統(tǒng)的細(xì)胞相互作用,共同調(diào)控骨代謝。研究絕經(jīng)后骨質(zhì)疏松癥的發(fā)病機(jī)制,尋找其治療的分子靶標(biāo)和信號(hào)通路,有助于其預(yù)防和治療。目的:利用RNA-Seq技術(shù),探討絕經(jīng)后骨質(zhì)疏松癥患者外周血白細(xì)胞中與免疫相關(guān)的基因表達(dá)譜的變化。方法:選取因發(fā)生骨折住院治療的絕經(jīng)后0-20年的女性40人,首先采用Lunar Prodigy雙能X射線骨密度儀掃描后,分為骨量正常組(T>-1)和骨質(zhì)疏松組(T<-2.5)。全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-seq)分別抽取2組各5人的外周血樣本,分離白細(xì)胞后提取總RNA,篩選2組的表達(dá)差異基因并進(jìn)行GO富集分析,篩選免疫相關(guān)表達(dá)基因并進(jìn)行KEGG信號(hào)通路分析,收集2組各20人的外周血樣本采用Real-time PCR驗(yàn)證KEGG PATHWAY生物信息學(xué)分析的結(jié)果。研究方案的實(shí)施符合上海市浦東新區(qū)公利醫(yī)院的相關(guān)倫理要求(20170301)。結(jié)果與結(jié)論:①骨質(zhì)疏松組與骨量正常組相比,表達(dá)差異在2倍以上且具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的基因?yàn)?87個(gè)(其中表達(dá)上調(diào)131個(gè),表達(dá)下調(diào)56個(gè)),其中與免疫相關(guān)的表達(dá)差異基因?yàn)?..
【文章來(lái)源】:中國(guó)組織工程研究. 2020,24(25)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
Real-time PCR驗(yàn)證骨量正常組和骨質(zhì)疏松組免疫相關(guān)的表達(dá)差異基因(n=20)
在上述GO富集分析結(jié)果中,聚類免疫系統(tǒng)過(guò)程中的免疫相關(guān)表達(dá)差異基因,共29個(gè)表達(dá)差異基因,其中表達(dá)上調(diào)的25個(gè),表達(dá)下調(diào)的4個(gè)(圖3)。圖2 骨量正常組和骨質(zhì)疏松組的表達(dá)差異基因功能富集圖(n=5)
骨量正常組和骨質(zhì)疏松組的表達(dá)差異基因功能富集圖(n=5)
本文編號(hào):3341313
【文章來(lái)源】:中國(guó)組織工程研究. 2020,24(25)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
Real-time PCR驗(yàn)證骨量正常組和骨質(zhì)疏松組免疫相關(guān)的表達(dá)差異基因(n=20)
在上述GO富集分析結(jié)果中,聚類免疫系統(tǒng)過(guò)程中的免疫相關(guān)表達(dá)差異基因,共29個(gè)表達(dá)差異基因,其中表達(dá)上調(diào)的25個(gè),表達(dá)下調(diào)的4個(gè)(圖3)。圖2 骨量正常組和骨質(zhì)疏松組的表達(dá)差異基因功能富集圖(n=5)
骨量正常組和骨質(zhì)疏松組的表達(dá)差異基因功能富集圖(n=5)
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