目的基于高通量測(cè)序數(shù)據(jù),探討小鼠高脂血癥模型中長(zhǎng)鏈非編碼RNA（long non-coding RNA, lncRNA）的表達(dá)特征及競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA（competitive endogenous RNA, ceRNA）調(diào)控網(wǎng)絡(luò),篩選lncRNA介導(dǎo)的參與血脂異常發(fā)生發(fā)展的關(guān)鍵調(diào)控通路。方法應(yīng)用正常飲食和高脂飲食分別誘導(dǎo)ApoE-/-小鼠12周,建立高脂血癥模型;進(jìn)行肝臟全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,篩選差異表達(dá)的lncRNAs、微小RNAs（microRNAs, miRNAs）和信使RNAs（messenger RNAs, mRNAs）;對(duì)差異表達(dá)的mRNAs進(jìn)行基因功能（Gene Ontology, GO）分析和信號(hào)通路（KEGG）注釋;結(jié)合并分析lncRNA-mRNA共表達(dá)關(guān)系、miRNA-mRNA靶向關(guān)系、lncRNA-miRNA共表達(dá)和靶向關(guān)系,構(gòu)建lncRNA介導(dǎo)的ceRNA網(wǎng)絡(luò)并篩選關(guān)鍵ceRNA調(diào)控軸。結(jié)果高脂血癥小鼠肝臟全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序篩選出117個(gè)差異表達(dá)lncRNAs、53個(gè)差異表達(dá)miRNAs和1689個(gè)差異表達(dá)mRNAs;差異表達(dá)的mRNAs主要參與脂質(zhì)代謝過程、脂肪酸代謝過程和類... 

【文章來源】：中國(guó)分子心臟病學(xué)雜志. 2020,20(01)

【文章頁數(shù)】：8 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 研究對(duì)象及材料獲取
    1.2 血脂（TC、TG、HDL-c和LDL-c）檢測(cè)
    1.3 肝臟RNA的提取和質(zhì)量控制
    1.4 測(cè)序數(shù)據(jù)的獲取
    1.5 差異表達(dá)lnc RNAs、mi RNAs和m RNAs的篩選
    1.6 差異表達(dá)m RNAs的功能富集分析
    1.7 ceRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建及關(guān)鍵調(diào)控軸的篩選
2 結(jié)果
    2.1 小鼠高脂血癥模型的建立
    2.2 小鼠高脂血癥模型的肝臟全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析
    2.3 差異表達(dá)m RNAs的基因功能和通路注釋
    2.4 小鼠高脂血癥模型的ce RNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
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